Using Phage Display to Develop Ubiquitin Variant Modulators for E3 Ligases

Olivia Roscow; Wei Zhang

doi:10.3791/62950

Journal

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생화학

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Usando o Phage Display para desenvolver moduladores variantes de Ubiquitin para Ligases E3

JoVE 신문
생화학

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JoVE 신문 생화학

Using Phage Display to Develop Ubiquitin Variant Modulators for E3 Ligases

Usando o Phage Display para desenvolver moduladores variantes de Ubiquitin para Ligases E3

DOI:

10.3791/62950-v

•

06:30 min

•

August 27, 2021

•

Olivia Roscow, Wei Zhang

¹Department of Molecular and Cellular Biology, College of Biological Science,University of Guelph

Chapters

00:04Introduction
00:36Round One of Selection
03:23Preparation for the Subsequent Rounds of Selection
04:37Results: Ubiquitin Variant (UbV) Selection Against UBE4B
05:43Conclusion

Summary

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A ubiquização é uma modificação pós-translacional de proteínas críticas, que tem sido implicada em inúmeras doenças humanas. Este protocolo detalha como o display phage pode ser utilizado para isolar novas variantes de ubiquitina que podem ligar e modular a atividade de ligaduras E3 que controlam a especificidade, eficiência e padrões de ubiquização.

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Exibição Inner-membrana bacteriana para o rastreio de uma biblioteca de anticorpo Fragments

Usando andaime lipossomas para reconstituir interações proteína-proteína Lipid-proximal<em> In Vitro</em

Biopanning semi-automático de exibição bacteriana bibliotecas para peptídeo afinidade reagente descoberta e análise dos isolados resultantes

Um método alternativo de cultura para manter Hypomethylation genômico das células-tronco embrionárias Mouse usando MEK inibidor PD0325901 e vitamina C

Microgravimetry dissipativo para estudar a dinâmica da vinculação do fosfolipídeo proteína anexina A2 para Bilayers do Lipid com suporte sólido usando um ressonador de quartzo

Usando o índice elevado de imagem para quantificar o destino noivado em células aderentes

Purificação de etapa única de complexos macromoleculares usando RNA ligado à biotina e um foto-cleavable vinculador

Usando na transferência de energia de ressonância de fluorescência de Vitro para estudar a dinâmica dos complexos de proteínas em uma escala de tempo de milissegundo

Usando o Phage Display para desenvolver moduladores variantes de Ubiquitin para Ligases E3

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Usando na transferência de energia de ressonância de fluorescência de Vitro para estudar a dinâmica dos complexos de proteínas em uma escala de tempo de milissegundo

Perfil de Ubiquitin e Ubiquitin-like Modificações pós-translacionais dependentes e identificação de alterações significativas

Caracterização funcional do RING-Tipo E3 Ubiquitin Ligases In Vitro e In Planta

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