यह प्रोटोकॉल संयुक्त कॉन्फोकल और एसटीईडी माइक्रोस्कोपी द्वारा न्यूरोमस्कुलर जंक्शनों के मोर्फोमेट्रिक विश्लेषण के लिए एक विधि का वर्णन करता है जिसका उपयोग एसएमए और कोलक्यू से संबंधित सीएमएस के माउस मॉडल में पैथोलॉजिकल परिवर्तनों को निर्धारित करने के लिए किया जाता है।