Journal
/
생물학
/
Inherent Dynamics Visualizer, et interaktivt program til evaluering og visualisering af output fra en Genregulerende Netværksslutningspipeline
JoVE 신문
생물학
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 생물학
Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline

Inherent Dynamics Visualizer, et interaktivt program til evaluering og visualisering af output fra en Genregulerende Netværksslutningspipeline

DOI:
10.3791/63084-v

•

10:44 min

•

December 07, 2021

•

, , , ,
1Department of Biology,Duke University, 2Department of Mathematical Sciences,Montana State University, 3Department of Mathematical Sciences,Florida Atlantic University

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:46Node Finding
  • 03:40Edge Finding
  • 05:32Network Finding
  • 08:14Results: Investigating the Core Oscillator Gene Regulatory Network of the Yeast Cell-Cycle
  • 10:06Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Inherent Dynamics Visualizer er en interaktiv visualiseringspakke, der opretter forbindelse til et genregulerende netværksslutningsværktøj til forbedret, strømlinet generation af funktionelle netværksmodeller. Visualizeren kan bruges til at træffe mere informerede beslutninger om parameterisering af slutningsværktøjet og dermed øge tilliden til de resulterende modeller.

Tags

Gene Regulatory NetworkInference PipelineInherent Dynamics VisualizerInteractive ApplicationVisualizationParameter ExplorationTime Series DataAnnotation FileOutput FileNumber Of ProcessesDLxJTKCutoffGene List

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/63084?article_type=v

Regulatory T cells: Therapeutic Potential for Treating Transplant Rejection and Type I Diabetes
check_url/kr/63084?article_type=v

Using an Automated Cell Counter to Simplify Gene Expression Studies: siRNA Knockdown of IL-4 Dependent Gene Expression in Namalwa Cells
check_url/kr/63084?article_type=v

Kvantitativ sammenligning af Cis-Regulatory Element (CRE) Aktiviteter i transgene Drosophila melanogaster</em
check_url/kr/63084?article_type=v

Brug SecM Arrest Sequence som et redskab til at isolere ribo bundne polypeptider
check_url/kr/63084?article_type=v

Selektiv opsamling af 5-hydroxymethylcytosine fra genomisk DNA
check_url/kr/63084?article_type=v

En hurtig og pålidelig Pipeline for bakteriel Transkriptomet Analyse Case study: Serin-afhængig genregulering i<em> Streptococcus pneumoniae</em
check_url/kr/63084?article_type=v

Visualisere Stromule Frekvens med Fluorescence Microscopy
check_url/kr/63084?article_type=v

En simpel metode til dyrkning af sojabønner Protoplasts og ansøgning til forbigående gen Expression analyser
check_url/kr/63084?article_type=v

Fotodiode-baseret optisk billedbehandling til optagelse af netværksdynamik med enkelt-neuronopløsning i ikke-transgene hvirvelløse dyr
check_url/kr/63084?article_type=v

En bioinformatikrørledning til undersøgelse af molekylær udvikling og genekspression ved hjælp af RNA-seq

Read Article