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Inherent Dynamics Visualizer, eine interaktive Anwendung zur Bewertung und Visualisierung von Ergebnissen aus einer Gene Regulatory Network Inference Pipeline
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Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline
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Inherent Dynamics Visualizer, eine interaktive Anwendung zur Bewertung und Visualisierung von Ergebnissen aus einer Gene Regulatory Network Inference Pipeline

DOI:
10.3791/63084-v

•

10:44 min

•

December 07, 2021

•

, , , ,
1Department of Biology,Duke University, 2Department of Mathematical Sciences,Montana State University, 3Department of Mathematical Sciences,Florida Atlantic University

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:46Node Finding
  • 03:40Edge Finding
  • 05:32Network Finding
  • 08:14Results: Investigating the Core Oscillator Gene Regulatory Network of the Yeast Cell-Cycle
  • 10:06Conclusion

Summary

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Der Inherent Dynamics Visualizer ist ein interaktives Visualisierungspaket, das mit einem Genregulationsnetzwerk-Inferenzwerkzeug verbunden ist, um eine verbesserte, optimierte Generierung funktionaler Netzwerkmodelle zu ermöglichen. Der Visualizer kann verwendet werden, um fundiertere Entscheidungen für die Parametrisierung des Inferenzwerkzeugs zu treffen und so das Vertrauen in die resultierenden Modelle zu erhöhen.

Tags

Gene Regulatory NetworkInference PipelineInherent Dynamics VisualizerInteractive ApplicationVisualizationParameter ExplorationTime Series DataAnnotation FileOutput FileNumber Of ProcessesDLxJTKCutoffGene List

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