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유전자 규제 네트워크 추론 파이프라인의 출력을 평가하고 시각화하기 위한 대화형 응용 프로그램인 내재역학 시각화
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JoVE 신문 생물학
Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline
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유전자 규제 네트워크 추론 파이프라인의 출력을 평가하고 시각화하기 위한 대화형 응용 프로그램인 내재역학 시각화

DOI:
10.3791/63084-v

•

10:44 min

•

December 07, 2021

•

, , , ,
1Department of Biology,Duke University, 2Department of Mathematical Sciences,Montana State University, 3Department of Mathematical Sciences,Florida Atlantic University

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:46Node Finding
  • 03:40Edge Finding
  • 05:32Network Finding
  • 08:14Results: Investigating the Core Oscillator Gene Regulatory Network of the Yeast Cell-Cycle
  • 10:06Conclusion

Summary

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내재된 Dynamics 시각화는 향상된 능률적인 기능 성 네트워크 모델을 위해 유전자 규제 네트워크 추론 도구에 연결하는 대화형 시각화 패키지입니다. 시각화 도우미를 사용하여 추론 도구를 매개 변수화하기 위해 보다 정보에 입각한 결정을 내릴 수 있으므로 결과 모델에 대한 신뢰도가 높아질 수 있습니다.

Tags

Gene Regulatory NetworkInference PipelineInherent Dynamics VisualizerInteractive ApplicationVisualizationParameter ExplorationTime Series DataAnnotation FileOutput FileNumber Of ProcessesDLxJTKCutoffGene List

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