Journal
/
생물학
/
Inherent Dynamics Visualizer, en interaktiv applikation för utvärdering och visualisering av utgångar från en pipeline för genreglerande nätverk
JoVE 신문
생물학
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 생물학
Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Inherent Dynamics Visualizer, en interaktiv applikation för utvärdering och visualisering av utgångar från en pipeline för genreglerande nätverk

DOI:
10.3791/63084-v

•

10:44 min

•

December 07, 2021

•

, , , ,
1Department of Biology,Duke University, 2Department of Mathematical Sciences,Montana State University, 3Department of Mathematical Sciences,Florida Atlantic University

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:46Node Finding
  • 03:40Edge Finding
  • 05:32Network Finding
  • 08:14Results: Investigating the Core Oscillator Gene Regulatory Network of the Yeast Cell-Cycle
  • 10:06Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Inherent Dynamics Visualizer är ett interaktivt visualiseringspaket som ansluter till ett genreglerande nätverksingsverktyg för förbättrad, strömlinjeformad generering av funktionella nätverksmodeller. Visualizern kan användas för att fatta mer välgrundade beslut för att parametrisera härledningsverktyget, vilket ökar förtroendet för de resulterande modellerna.

Tags

Gene Regulatory NetworkInference PipelineInherent Dynamics VisualizerInteractive ApplicationVisualizationParameter ExplorationTime Series DataAnnotation FileOutput FileNumber Of ProcessesDLxJTKCutoffGene List

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

Regulatoriska T-celler: terapeutisk potential för behandling av transplantatavstötning och typ I-diabetes

Hjälp av ett automatiserat celltalsräknare att förenkla Studier Gene Expression: siRNA Knockdown av IL-4 beroende genuttryck i Namalwa Cells

Kvantitativ jämförelse av Cis-Regulatory Element (CRE) Aktiviteter i transgena Drosophila melanogaster</em

Använda SecM Arrest sekvens som ett verktyg för Isolera ribosom Bundna Polypeptider

Selektiv fångst av 5-hydroxymethylcytosine från genomisk DNA

En snabb och pålitlig Pipeline för Bacterial transkriptomanalys Fallstudie: Serin beroende genreglering i<em> Streptococcus pneumoniae</em

Visualisering Stromule frekvens med fluorescensmikroskopi

En enkel metod för isolering av sojabönor Protoplasts och ansökan till övergående gen uttryck analyser

Fotodiodbaserad optisk avbildning för inspelning av nätverksdynamik med en neuronupplösning hos icke-transgena ryggradslösa djur

En bioinformatikpipeline för att undersöka molekylär evolution och genuttryck med RNA-seq

Read Article