Journal
/
생화학
/
Shotgun Proteomics Sample Processing geautomatiseerd door een open-source labrobot
JoVE 신문
생화학
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 생화학
Shotgun Proteomics Sample Processing Automated by an Open-Source Lab Robot
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Shotgun Proteomics Sample Processing geautomatiseerd door een open-source labrobot

DOI:
10.3791/63092-v

•

10:12 min

•

October 28, 2021

•

, , , ,
1Department of Medicine-Cardiology,University of Colorado Anschutz Medical Campus, 2Department of Biochemistry & Molecular Genetics,University of Colorado Anschutz Medical Campus, 3Consortium for Fibrosis Research & Translation, School of Medicine,University of Colorado Anschutz Medical Campus

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:40Mass Spectrometry (MS) Sample Preparation with a Single Protein
  • 04:44Peptide Clean-up Using SP3 Paramagnetic Beads
  • 06:19MS Sample Preparation with Protein Lysate
  • 08:37Results: Mass Spectrometry Proteomics with a Single Protein Standard Bovine Serum Albumin and a Detergent-Containing Human Heart Lysate Sample
  • 09:44Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Gedetailleerd protocol en drie Python-scripts zijn voorzien voor het bedienen van een open-source robotisch vloeistofverwerkingssysteem om semi-geautomatiseerde eiwitmonstervoorbereiding uit te voeren voor massaspectrometrie-experimenten, met betrekking tot wasmiddelverwijdering, eiwitvertering en peptide-ontzoutingsstappen.

Tags

Shotgun ProteomicsAutomated Sample ProcessingOpen-source Lab RobotLiquid Handling SystemMass SpectrometryProtein BiochemistryProteomic StudiesAmmonium BicarbonateDTTTemperature ControlAutomationOpen-source Python Scripts

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/63092?article_type=v

Geautomatiseerde Acoustic Afgifte voor de seriële verdunning van Peptide agonisten in potentie Bepaling Testen
check_url/kr/63092?article_type=v

LERLIC-MS / MS Gedetailleerde karakterisering en kwantificering van glutamine en asparagine Deamidatie in Shotgun Proteomics
check_url/kr/63092?article_type=v

Kalibratie-gratis In Vitro kwantificering van eiwit Homo-oligomerisatie met behulp van commerciële instrumentatie en Software van de analyse van de helderheid van gratis, Open Source
check_url/kr/63092?article_type=v

Voorbereiding van Chloroplast sub compartimenten van Arabidopsis voor de analyse van eiwit lokalisatie door Immunoblotting of Proteomics
check_url/kr/63092?article_type=v

Detectie van eiwitubiquitinatiesites door peptideverrijking en massaspectrometrie
check_url/kr/63092?article_type=v

Met behulp van de open-source MALDI TOF-MS IDBac pijpleiding voor analyse van microbiële eiwitten en gespecialiseerde metaboliet gegevens
check_url/kr/63092?article_type=v

Een alles-in-een monsterhouder voor macromoleculaire X-Ray kristallografie met minimale achtergrond verstrooiing
check_url/kr/63092?article_type=v

Een plasmamonstervoorbereiding voor massaspectrometrie met behulp van een geautomatiseerd werkstation
check_url/kr/63092?article_type=v

TMT Sample Voorbereiding voor Proteomics Facility Indiening en latere data-analyse
check_url/kr/63092?article_type=v

Nauwkeurige en nauwkeurige FRET-metingen met één molecuul uitvoeren met behulp van de Open-Source smfBox

Read Article