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Recursos bioinformáticos para el estudio de las interacciones de proteínas mediadas por glicanos
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JoVE 신문 생물학
Bioinformatics Resources for the Study of Glycan-Mediated Protein Interactions
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Recursos bioinformáticos para el estudio de las interacciones de proteínas mediadas por glicanos

DOI:
10.3791/63356-v

•

11:21 min

•

January 20, 2022

•

1Proteome Informatics Group,SIB Swiss Institute of Bioinformatics, 2Computer Science Department,University of Geneva, 3Section of Biology,University of Geneva

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:11Accessing Resources from Glyco@Expasy and Exploring the Contextual Information of a Protein N-Glycome
  • 02:43Visualizing and Correlating the Contextual Information of a Protein N-Glycome
  • 05:38Glycan-Binding Information in UniLectin
  • 06:59Browsing the HGI Challenge High Confidence Dataset
  • 07:45Comparing the O-Glycome of a Selected Serum Protein in GlyConnect
  • 08:47Results: Combining Outputs of GlyConnect Octopus, GlyConnect Compozitor, and UniLectin
  • 10:49Conclusion

Summary

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Este protocolo ilustra cómo explorar, comparar e interpretar los glicomas de proteínas humanas con recursos en línea.

Tags

Keywords: BioinformaticsGlycoinformaticsGlycomicsGlycoproteomicsGlycan-mediated Protein InteractionsGlycoproteomeGlyConnectProstate-specific Antigen (PSA)Glycan StructuresGlycan CompositionsOctopusN-linked GlycansHybrid GlycansSialylated Glycans

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