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Localizzazione del fattore a cella singola sulla cromatina utilizzando la scissione di input ultra-bassa sotto i bersagli e il rilascio utilizzando la nucleasi
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JoVE 신문 생물학
Single-Cell Factor Localization on Chromatin using Ultra-Low Input Cleavage Under Targets and Release using Nuclease
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Localizzazione del fattore a cella singola sulla cromatina utilizzando la scissione di input ultra-bassa sotto i bersagli e il rilascio utilizzando la nucleasi

DOI:
10.3791/63536-v

•

09:20 min

•

February 01, 2022

•

,
1Department of Biological Sciences,University of Pittsburgh

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:17Pre-Blocking of Samples to Prevent Early Digestion by MNase
  • 01:46Addition of Primary Antibody
  • 03:09Addition of pA-MNase or pA/G-MNase
  • 04:04Directed DNA Digestion
  • 05:04Sample Fractionation and DNA Extraction
  • 07:09Results: Protein Localization on Chromatin Using Single Cell uliCUT&RUN
  • 08:54Conclusion

Summary

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CUT&RUN e le sue varianti possono essere utilizzati per determinare l'occupazione proteica sulla cromatina. Questo protocollo descrive come determinare la localizzazione delle proteine sulla cromatina utilizzando uliCUT&RUN a singola cellula.

Tags

Single-cellChromatinCUT&RUNProtein LocalizationLow-cellLow-abundanceAntibody96-wellMagnetic RackBlocking BufferWash BufferPrimary Antibody

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