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Identification de fragments d’ARN résultant d’une dégradation enzymatique à l’aide de la spectrométrie de masse MALDI-TOF
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JoVE 신문 생화학
Identification of RNA Fragments Resulting from Enzymatic Degradation using MALDI-TOF Mass Spectrometry
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Identification de fragments d’ARN résultant d’une dégradation enzymatique à l’aide de la spectrométrie de masse MALDI-TOF

DOI:
10.3791/63720-v

•

09:20 min

•

April 11, 2022

•

, , , ,
1Department of Chemistry,University of Colorado, Denver, 2Department of Chemistry & Biochemistry,University of Denver, 3Analytical Resources Core Bioanalysis & Omics,Colorado State University

Chapters

  • 00:09Introduction
  • 01:05Concentration Determination of RNA Solution
  • 03:15Hydrolysis of Oligonucleotides of RNA by Xrn-1
  • 05:31Desalting of RNA Solution, MALDI-TOF Plate Spotting
  • 07:41Results: Identification of Enzymatically Degraded RNA Fragments Using MALDI-TOF Mass Spectrometry
  • 08:32Conclusion

Summary

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MALDI-TOF a été utilisé pour caractériser des fragments obtenus à partir de la réactivité entre l’ARN oxydé et l’exoribonucléase Xrn-1. Le présent protocole décrit une méthodologie qui peut être appliquée à d’autres processus impliquant l’ARN et/ou l’ADN.

Tags

RNA FragmentsEnzymatic DegradationMALDI-TOF Mass SpectrometryBiopolymer CharacterizationBiochemical TransformationsUV-Vis SpectrophotometryPeltier Temperature Control

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