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Identificazione di frammenti di RNA risultanti dalla degradazione enzimatica mediante spettrometria di massa MALDI-TOF
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JoVE 신문 생화학
Identification of RNA Fragments Resulting from Enzymatic Degradation using MALDI-TOF Mass Spectrometry
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Identificazione di frammenti di RNA risultanti dalla degradazione enzimatica mediante spettrometria di massa MALDI-TOF

DOI:
10.3791/63720-v

•

09:20 min

•

April 11, 2022

•

, , , ,
1Department of Chemistry,University of Colorado, Denver, 2Department of Chemistry & Biochemistry,University of Denver, 3Analytical Resources Core Bioanalysis & Omics,Colorado State University

Chapters

  • 00:09Introduction
  • 01:05Concentration Determination of RNA Solution
  • 03:15Hydrolysis of Oligonucleotides of RNA by Xrn-1
  • 05:31Desalting of RNA Solution, MALDI-TOF Plate Spotting
  • 07:41Results: Identification of Enzymatically Degraded RNA Fragments Using MALDI-TOF Mass Spectrometry
  • 08:32Conclusion

Summary

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MALDI-TOF è stato utilizzato per caratterizzare frammenti ottenuti dalla reattività tra RNA ossidato ed esoribonucleasi Xrn-1. Il presente protocollo descrive una metodologia che può essere applicata ad altri processi che coinvolgono RNA e/o DNA.

Tags

RNA FragmentsEnzymatic DegradationMALDI-TOF Mass SpectrometryBiopolymer CharacterizationBiochemical TransformationsUV-Vis SpectrophotometryPeltier Temperature Control

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