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MALDI-TOF 질량 분광법을 이용한 효소적 분해로 인한 RNA 단편의 확인

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JoVE 신문 생화학

Identification of RNA Fragments Resulting from Enzymatic Degradation using MALDI-TOF Mass Spectrometry

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MALDI-TOF 질량 분광법을 이용한 효소적 분해로 인한 RNA 단편의 확인

DOI:

10.3791/63720-v

•

09:20 min

•

April 11, 2022

•

Shawn W. Schowe, Conner J. Langeberg, Erich G. Chapman, Kitty Brown, Marino J. E. Resendiz

¹Department of Chemistry,University of Colorado, Denver, ²Department of Chemistry & Biochemistry,University of Denver, ³Analytical Resources Core Bioanalysis & Omics,Colorado State University

Chapters

00:09Introduction
01:05Concentration Determination of RNA Solution
03:15Hydrolysis of Oligonucleotides of RNA by Xrn-1
05:31Desalting of RNA Solution, MALDI-TOF Plate Spotting
07:41Results: Identification of Enzymatically Degraded RNA Fragments Using MALDI-TOF Mass Spectrometry
08:32Conclusion

Summary

자동 번역

MALDI-TOF는 산화된 RNA와 엑소리보뉴클레아제 Xrn-1 사이의 반응성으로부터 수득된 단편을 특성화하는데 사용되었다. 본 프로토콜은 RNA 및/또는 DNA를 포함하는 다른 공정에 적용될 수 있는 방법론을 기술한다.

Tags

RNA Fragments Enzymatic Degradation MALDI-TOF Mass Spectrometry Biopolymer Characterization Biochemical Transformations UV-Vis Spectrophotometry Peltier Temperature Control

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