JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다. 전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
Chapters
- 00:04Introduction
- 00:40Loading the Phylogenetic Codon Substitution Frequencies (PhyloCSF) Track Hub to the University of California Santa Cruz (UCSC) Genome Browser
- 01:25Navigating to Genes of Interest Using Gene Identifiers
- 02:20Navigating to Genomic Regions of Interest Using Sequence Information
- 03:10Identifying Conserved Short Open Reading Frames (sORFs) Using PhyloCSF Track Data
- 04:06Viewing Homologous Regions in Other Genomes
- 04:51Generating Multi-Species Sequence Alignments for Microproteins of Interest
- 06:47Results: Identification of Genomic Regions of Interest for Microprotein-Coding Potential
- 08:47Conclusion
يوفر البروتوكول الموضح هنا تعليمات مفصلة حول كيفية تحليل المناطق الجينومية ذات الأهمية لإمكانات ترميز البروتين الدقيق باستخدام PhyloCSF على متصفح UCSC Genome سهل الاستخدام. بالإضافة إلى ذلك ، يوصى بالعديد من الأدوات والموارد لمواصلة التحقيق في خصائص تسلسل البروتينات الدقيقة المحددة لاكتساب نظرة ثاقبة على وظائفها المفترضة.
