JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다. 전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
Chapters
- 00:04Introduction
- 00:40Loading the Phylogenetic Codon Substitution Frequencies (PhyloCSF) Track Hub to the University of California Santa Cruz (UCSC) Genome Browser
- 01:25Navigating to Genes of Interest Using Gene Identifiers
- 02:20Navigating to Genomic Regions of Interest Using Sequence Information
- 03:10Identifying Conserved Short Open Reading Frames (sORFs) Using PhyloCSF Track Data
- 04:06Viewing Homologous Regions in Other Genomes
- 04:51Generating Multi-Species Sequence Alignments for Microproteins of Interest
- 06:47Results: Identification of Genomic Regions of Interest for Microprotein-Coding Potential
- 08:47Conclusion
Het protocol dat hier wordt beschreven, biedt gedetailleerde instructies voor het analyseren van genomische gebieden die van belang zijn voor microproteïnecoderingspotentieel met behulp van PhyloCSF op de gebruiksvriendelijke UCSC Genome Browser. Daarnaast worden verschillende hulpmiddelen en middelen aanbevolen om de sequentiekenmerken van geïdentificeerde microproteïnen verder te onderzoeken om inzicht te krijgen in hun vermeende functies.
