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단백질 보존의 신속한 평가를 위한 종 간 감수성 도구를 예측하기 위한 서열 정렬 입증
JoVE 신문
유전학
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JoVE 신문 유전학
Demonstration of the Sequence Alignment to Predict Across Species Susceptibility Tool for Rapid Assessment of Protein Conservation
DOI:

16:02 min

February 10, 2023

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:56Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 1
  • 02:43Developing and Running a SeqAPASS Query: Level 2
  • 03:47Accessing and Understanding the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
  • 05:54Manipulating Data Settings and Visualizing the Data: SeqAPASS Level 1 and Level 2
  • 07:23Developing and Running a SeqAPASS Analysis: Level 3
  • 08:28Identify Critical Amino Acid Residues through a Literature Search
  • 10:54Visualizing Level 3 SeqAPASS Data and Interpretation of Results
  • 13:45Results: SeqAPASS Level 1, 2, and 3 Analyses of the Conservation of Amino Acid Residues and Level 1 and 2 Analyses of μ Opioid Receptor Conservation Across Taxonomic Groups
  • 15:10Conclusion

Summary

자동 번역

여기에서는 미국 환경 보호국 서열 정렬을 활용하여 종 감수성 (SeqAPASS) 도구를 예측하는 프로토콜을 제시합니다. 이 프로토콜은 단백질 보존을 신속하게 분석하고 종 전반에 걸쳐 화학적 감수성에 대한 사용자 정의 가능하고 쉽게 해석 가능한 예측을 제공하는 온라인 도구의 적용을 보여줍니다.

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