Investigation of Microbial Cooperation <em>via</em> Imaging Mass Spectrometry Analysis of Bacterial Colonies Grown on Agar and in Tissue During Infection

Jonathan T. Specker; Alexander B. Smith; Orlaith Keenan; Joseph P. Zackular; Boone M. Prentice

doi:10.3791/64200

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Investigación de la cooperación microbiana a través del análisis de espectrometría de masas de imágenes de colonias bacterianas cultivadas en agar y en tejidos durante la infección

JoVE 신문
생화학

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JoVE 신문 생화학

Investigation of Microbial Cooperation via Imaging Mass Spectrometry Analysis of Bacterial Colonies Grown on Agar and in Tissue During Infection

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Investigación de la cooperación microbiana a través del análisis de espectrometría de masas de imágenes de colonias bacterianas cultivadas en agar y en tejidos durante la infección

DOI:

10.3791/64200-v

•

09:49 min

•

November 18, 2022

•

Jonathan T. Specker, Alexander B. Smith, Orlaith Keenan, Joseph P. Zackular³, Boone M. Prentice

¹Department of Chemistry,University of Florida, ²Division of Protective Immunity,Children’s Hospital of Philadelphia, ³Department of Pathology and Laboratory Medicine, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Chapters

00:05Introduction
00:58Ambient, Vacuum, and Heat-Mediated Drying of Clostridioides difficile and Enterococcus faecalis Bacterial Macrocolonies
02:33MALDI Matrix Application via Robotic Spraying
03:12Preparing Bacterial Macrocolonies for MALDI Imaging Mass Spectrometry Data Acquisition
04:37Imaging Mass Spectrometry Data Analysis and Compound Identification
05:57Cryosectioning of Noninfected Control Versus Clostridioides difficile-Infected Mouse Cecal Tissues
07:45Preparation of Noninfected Control Versus Clostridioides difficile-Infected Mouse Cecal Tissues for Matrix Application and MALDI Imaging Mass Spectrometry
08:08Results: Imaging Mass Spectrometry Analysis of Bacterial Macrocolonies and Infected Murine Cecal Tissues
09:09Conclusion

Summary

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Se demuestra un nuevo método de preparación de muestras para el análisis de macrocolonias bacterianas basadas en agar mediante espectrometría de masas de imágenes de ionización / desorción láser asistida por matriz.

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Resuelta en el tiempo de ionización por electrospray de hidrógeno-deuterio Espectrometría de Masas de cambio para el estudio de la estructura proteica y Dinámica

Resolver purificado por afinidad Complejos de Proteína de Blue nativo PAGE y de proteínas de perfiles de correlación

Aislamiento gotas de lípidos para el análisis cuantitativo de Espectrometría de Masas

Preparación de muestras para identificación basada en espectrometría de masa de regiones de unión de ARN

Evaluar la viabilidad de un consorcio bacteriano sintético en la interfaz de Host-microbio In Vitro Gut

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Espectrometría de masa de hoja aerosol: Una técnica rápida ionización ambiental evaluar directamente los metabolitos de los tejidos vegetales

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