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使用 Micro-C-XL 绘制哺乳动物 3D 基因组相互作用图
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Mapping Mammalian 3D Genome Interactions with Micro-C-XL
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使用 Micro-C-XL 绘制哺乳动物 3D 基因组相互作用图

DOI:
10.3791/64579-v

•

11:41 min

•

November 03, 2023

•

, ,
1Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research,University of Copenhagen

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:26MNase Titration
  • 03:07Preparative MNase Digestion
  • 04:43DNA End Processing and Proximity Ligation
  • 06:50Di‐Nucleosomal DNA Purification and Size Selection
  • 07:42Streptavidin Pull‐Down and On‐Bead Library Preparation
  • 08:59Results: Micro‐C Libraries for Mapping the Mammalian 3D Genome Interactions
  • 11:07Conclusion

Summary

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本文介绍了使用全基因组染色体构象捕获方法Micro-C-XL绘制具有核小体分辨率的三维基因组组织的方案。

Tags

3D GenomeMicro-C-XLMNase TitrationNucleosome ResolutionChromatin DigestionDNA PurificationAgarose Gel Electrophoresis

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