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단일 세포 다중오믹스를 위한 급속 동결 간 조직으로부터 핵 분리

JoVE 신문
생물학

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JoVE 신문 생물학

Isolation of Nuclei from Flash-Frozen Liver Tissue for Single-Cell Multiomics

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단일 세포 다중오믹스를 위한 급속 동결 간 조직으로부터 핵 분리

DOI:

10.3791/64792-v

•

09:09 min

•

December 09, 2022

•

Mateusz Strzelecki⁴, Kelvin Yin, Carlos Talavera-López³, Celia P. Martinez-Jimenez⁴

¹Helmholtz Pioneer Campus (HPC),Helmholtz Munich, ²Institute of Computational Biology, Computational Health Department,Helmholtz Munich, ³Division of Infectious Diseases and Tropical Medicine,Ludwig-Maximillian-Universität Klinikum, ⁴TUM School of Medicine,Technical University of Munich

Chapters

00:04Introduction
00:57Nuclei Isolation
05:11Nuclei Sorting for Hepatocyte Ploidy Profiling or Well-Based Sequencing Approaches
06:36Results: Isolation of Nuclei from Flash-Frozen, Archived Liver Tissues for Single-Nucleus RNA-Seq, ATAC-Seq, and Joint Multiomics
08:39Conclusion

Summary

자동 번역

여기에서는 단일 핵 RNA-seq, ATAC-seq 및 관절 다중오믹스(RNA-seq 및 ATAC-seq)에 대해 급속 냉동되고 보관된 간 조직에서 핵을 분리하기 위한 프로토콜을 제시합니다.

Tags

Nuclei Isolation Single-cell Multiomics Density Gradient Centrifugation Iodixanol Cell Strainer Bio-archived Human Liver Samples Mouse Model Non-human Primate

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