Journal
/
생화학
/
Onderzoekende RNA-structuur met dimethylsulfaatmutatieprofilering met sequencing in vitro en in cellen
JoVE 신문
생화학
This content is Free Access.
JoVE 신문 생화학
Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling with Sequencing In Vitro and in Cells
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Onderzoekende RNA-structuur met dimethylsulfaatmutatieprofilering met sequencing in vitro en in cellen

DOI:
10.3791/64820-v

•

10:34 min

•

December 09, 2022

•

,
1Department of Microbiology,Harvard Medical School

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:36Gene‐Specific In Vitro DMS Modification
  • 02:49Gene‐Specific RT‐PCR of Modified RNA
  • 04:19Whole‐Genome DMS‐MaP Using Virus‐Infected Cells
  • 07:17Analysis of the Sequencing Data
  • 08:12Results: Probing RNA Structure with Dimethyl Sulfate Mutational Profiling and Sequencing
  • 10:00Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Het protocol geeft instructies voor het modificeren van RNA met dimethylsulfaat voor mutatieprofileringsexperimenten. Het omvat in vitro en in vivo tasten met twee alternatieve bibliotheekvoorbereidingsmethoden.

Tags

Keywords: RNA StructureDMS-MaPSequencingIn VitroIn CellsRNA Structure EnsembleBiological ResearchRefolding BufferDimethyl SulfateBeta-mercaptoethanolSpectrophotometerTGIRTComplementary DNAPCR

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/64820?article_type=v

Tijdsgeresolveerde elektrosprayionisatie waterstof-deuterium Exchange Massaspectrometrie voor het bestuderen van Protein Structure en Dynamics
check_url/kr/64820?article_type=v

Onderzoek naar eiwitsequentie-structuur-dynamiek Relaties met Bio3D-web
check_url/kr/64820?article_type=v

Polysoom profilering in Leishmania, menselijke cellen en muis Testis
check_url/kr/64820?article_type=v

Karakterisering van glycoproteïnen met de vouw van de immunoglobuline door middel van röntgendiffractie en biofysische technieken
check_url/kr/64820?article_type=v

De structuur en de dynamiek van Nucleosomes met behulp van Atomic Force microscopie Imaging sonderen
check_url/kr/64820?article_type=v

Plaats-geleide mutagenese voor In Vitro en In Vivo experimenten wordt geïllustreerd met RNA interacties in Escherichia Coli
check_url/kr/64820?article_type=v

Interacties met en membraan Permeabilization van de mitochondriën van de hersenen door amyloid fibrils
check_url/kr/64820?article_type=v

Zeer snelle en specifieke metabolische etikettering van RNA in vivo met 4-thiouracil (Ers4tU)
check_url/kr/64820?article_type=v

Snelle en kosteneffectieve RNA-extractie van rattenlelfum
check_url/kr/64820?article_type=v

Fosfaatprotemische strategie voor profilering osmotische stresssignalering in Arabidopsis

Read Article