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植物细胞类型的分离和转录组分析

JoVE 신문
생물학

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JoVE 신문 생물학

Isolation and Transcriptome Analysis of Plant Cell Types

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植物细胞类型的分离和转录组分析

DOI:

10.3791/64913-v

•

08:53 min

•

April 07, 2023

•

Jun Zhang, Mayra Ahmad, Rongrong Xie, Hongbo Gao

¹Joint Center for Single Cell Biology, School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiao Tong University

Chapters

00:04Introduction
01:01Growing the Plants
01:43Generating the Protoplasts
02:43Fluorescence‐Activated Cell Sorting (FACS) of the Protoplasts
04:23Smart‐Seq2 Library Preparation
07:00Results: Protoplast Isolation and Transcriptome Analysis
08:11Conclusion

Summary

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高通量scRNA-seq方法的可行性和有效性预示着植物研究的单细胞时代。这里介绍的是一个强大而完整的程序，用于分离特定的拟南芥根细胞类型以及随后的转录组文库构建和分析。

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Keywords: Plant Cell Types Transcriptome Analysis Single Cell Cell Sorting RNA-seq Protoplast Isolation Arabidopsis Thaliana Fluorescence-activated Cell Sorting (FACS)

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