Kryo-STEM-tomografi giver et middel til at visualisere organeller af intakte celler uden indlejring, sektionering eller andre invasive præparater. Den opnåede 3D-opløsning ligger i øjeblikket i området omkring et par nanometer med et synsfelt på flere mikrometer og en tilgængelig tykkelse i størrelsesordenen 1 μm.