Aqui, apresentamos um protocolo para converter dados transcriptômicos em uma visão mqTrans, permitindo a identificação de biomarcadores escuros. Embora não expressos diferencialmente em análises transcriptômicas convencionais, esses biomarcadores exibem expressão diferencial na visão mqTrans. A abordagem serve como uma técnica complementar aos métodos tradicionais, revelando biomarcadores antes negligenciados.