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Genomics

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Lo studio dei singoli geni ha consentito di acquisire conoscenze straordinarie in quasi tutti gli aspetti della biologia, partendo dalle malattie e dall’ereditarietà, all’agricoltura e all’evoluzione. Tuttavia, molti dubbi sul funzionamento e l’evoluzione dei geni possono essere chiariti solamente studiando il DNA di un organismo—il suo genoma—nel suo insieme. Lo studio di genomi completi è noto col nome di genomica. Prevede il sequenziamento di interi genomi per esaminarne l’organizzazione, la funzione, la regolazione e l’evoluzione. La genomica si colloca all’intersezione tra genetica, biologia molecolare e scienze computazionali. Da quando, nel 1953, fu identificata la struttura del DNA, gli scienziati cominciarono a sviluppare tecniche scientifiche a ordinare in sequenze i singoli geni. Un’importante svolta nel sequenziamento del DNA avvenne nel 1977, quando Frederick Sanger mise a punto un metodo per sequenziare interi genomi. Ciò portò al sequenziamento di genomi per il lievito da pane e la mosca della frutta, usando il sequenziamento Shotgun. Il Progetto genoma umano, inaugurato nel 1990, era un tentativo durato 13 anni con finanziamenti internazionali di 2,7 bilioni di $ che nel 2003 riuscì a sequenziare il primo genoma umano. Il successo di questo progetto condusse ad innovazioni nella tecnica del sequenziamento, consentendo di sequenziare i genomi umani in un giorno per meno di mille dollari. Le grandi quantità di dati generati portano all’ascesa della bioinformatica, che combina tecniche matematiche e informatiche, per organizzare, analizzare e comparare le grandi quantità di dati genomici. Oggi la genomica è una componente centrale della medicina personalizzata, per esempio per la cura dei tumori, e continua a giocare un ruolo chiave in campi come antropologia, evoluzione, medicina legale, e agricoltura, tra gli altri.

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Genomica

La genomica è la scienza dei genomi: è lo studio di tutto il materiale genetico di un organismo. Nell’uomo, il genoma è costituito da informazioni trasportate in 23 coppie di cromosomi nel nucleo, così come DNA mitocondriale. Nella genomica, sia la codifica che il DNA non codificante vengono sequenziati e analizzati. La genomica permette una migliore comprensione di tutti gli esseri viventi, della loro evoluzione e della loro diversità. Ha una miriade di usi: ad esempio, per costruire alberi filogenetici, per migliorare la produttività e la sostenibilità delle colture, assistere le indagini criminali, identificare i geni associati alle malattie o mirare a un trattamento ottimale per i pazienti oncologici.

Negli ultimi 30 anni, significativi sviluppi tecnologici nel sequenziamento del DNA si sono verificati, in particolare, grazie allo sforzo del Progetto Genoma Umano internazionale. La tecnologia ora esiste per sequenziare 60 miliardi di basi di DNA, che è 20 volte la dimensione di un genoma umano. Con questa abbondanza di informazioni e grandi riserve di dati, gli scienziati informatici e i bioinformatici lavorano mano nella mano con i biologi per raccogliere, memorizzare e analizzare le uscite di sequenziamento del DNA, consentendo al contempo l’accesso sicuro ai dati.

Il successo della genomica ha aperto la strada ad altri metodi su larga scala per studiare i sistemi biologici nella loro interezza. Gli studi genomici possono ora essere completati da altri studi “omici” al fine di raccogliere dati sui set viventi a tutti i livelli: specie, popolazioni, individui, cellule, proteine, RNA, DNA. La trascrittomica è lo studio di come l’espressione complessiva dei geni varia in diverse condizioni sperimentali o patologiche. La proteomica è lo studio di tutte le proteine che costituiscono un organismo o un sistema. La metabolimica è lo studio di tutti i metaboliti (zucchero, grassi, altre molecole) contenuti in un dato sistema biologico e le loro interazioni. Indissociabili dalla bioinformatica, le “omiche” permettono una visione globale dei set viventi complessi nel loro ambiente e, come tali, spianano la strada a una medicina personalizzata.

Leitura Sugerida

The rise of genomics. Comptes Rendus Biologies. Volume 339, Issues 7–8, July–August 2016, Pages 231-239. [Source]

Multi-omics approaches to disease. Genome Biol. 2017; 18: 83. [Source]