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3.9:

Substance amyloïde

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Biologia Molecular
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Amyloid Fibrils

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Les protéines se replient dans des structures énergétiquement favorables avec leurs acides aminés hydrophobes à l’intérieur, et leurs acides aminés chargés et polaires à l’extérieur. Certaines protéines se replient facilement d’elles-mêmes, mais beaucoup sont guidées pour se replier correctement par des protéines appelées chaperons. Parfois, les protéines se replient dans des formes incorrectes, souvent appelées protéines mal repliées, qui sont dégradées par le protéasome.La surveillance cellulaire inadéquate, comme les chaperons ou les protéasomes non fonctionnels à cause du vieillissement ou de maladie, peut entraîner la présence de protéines dans des formes anormales. Les mutations peuvent provoquer des erreurs de repliement des protéines si la forme de la protéine d’origine devient moins favorable. Les facteurs extrinsèques tels que les changements physiques ou chimiques dans le cytoplasme, forcent les protéines correctement repliées à se replier dans de nouvelles structures adaptées au nouvel environnement.Quel que soit le mécanisme, un mauvais repliement peut exposer de courts segments hydrophobes d’une protéine, la rendant insoluble dans l’eau. Certains de ces segments hydrophobes qui se replient normalement en hélices alpha peuvent être assemblés en feuillets beta. Des centaines de feuillets beta et de protéines identiques mal repliées forment des liaisons hydrogène et les pilent pour former de longs filaments.Deux piles de feuillets beta étroitement empaquetés s’associent pour former un filament bêta croisé. Dans cette structure, les feuillets beta individuels sont perpendiculaires à l’axe central. Ces filaments peuvent s’agréger pour former des fibrilles amyloïdes.L’accumulation de fibrilles amyloïdes a été observée dans certaines conditions neurodégénératives, comme dans les maladies d’Alzheimer et de Parkinson. Les maladies à prions, comme la maladie de Creutzfeldt-Jakob chez l’homme et l’encéphalopathie spongiforme bovine communément connue comme la maladie de la vache folle impliquent également la formation de fibrilles amyloïdes. Une protéine prion particulière, PRP, est une protéine de membrane neuronale.Les PRPs malrepliés peuvent transformer les PRPs normaux en formes anormales. Tous les PRPs finissent par détenir la structure aberrante. Les PRPs malrepliés contiennent des feuillets beta, et ont donc tendance à s’agréger et à former des fibrilles amyloïdes.Cette forme transmissible de formation d’amyloïde est associée à une neurodégénérescence fatale. Cependant, toutes les fibres amyloïdes ne sont pas nocives. Certaines bactéries utilisent des fibrilles amyloïdes sur leurs surfaces pour créer des biofilms protecteurs.En outre, les eucaryotes construisent des fibrilles amyloïdes réversibles pour emballer et stocker les protéines sécrétrices jusqu’à ce que la cellule ait besoin de les libérer. Comprendre ces amyloïdes réversibles peut nous aider à développer des traitements pour les agrégats d’amyloïdes irréversibles.

3.9:

Substance amyloïde

Les fibrilles amyloïdes sont des agrégats de protéines mal repliées.  Dans la plupart des cas, les protéines mal repliées sont soit repliées par des protéines chaperons, soit dégradées par le protéasome. Cependant, en cas de mutation ou de maladie, ces protéines peuvent s’accumuler pour former de gros amas et souvent s’assembler pour former des fibres allongées, appelées fibrilles. 

Des dépôts amyloïdes ont été observés dès 1639 dans le foie et la rate.   En 1854, Rudolph Virchow a effectué une coloration à l’iode, normalement utilisée pour identifier la cellulose, et a conclu que le dépôt était un type de glucide. Il a nommé les dépôts amyloïdes du mot grec amylon et du latin amylum pour amidon. Même si Friedrich et Kekule ont découvert que les agrégats étaient principalement des protéines, quelques années plus tard, en 1859, le terme impropre continue d’être utilisé. À l’origine, on pensait que les fibrilles ne se formaient qu’à l’extérieur des cellules, mais plus récemment, il a été démontré que l’amyloïde perturbe les fonctions intracellulaires.

Les troubles amyloïdes sont associés à différents agrégats de protéines. Malgré les différences dans les séquences d’acides aminés et les structures des protéines causant la maladie, une caractéristique des fibres amyloïdes est l’empilement de feuillets. La formation de ces fibrilles insolubles à partir de protéines solubles se produit par la production d’un intermédiaire partiellement déplié. Cet intermédiaire est thermodynamiquement défavorable et évolue rapidement vers un polymère stable.

Les fibrilles et autres agrégats, comme les plaques, sont des caractéristiques de pathologies telles que la maladie d’Alzheimer et la maladie de Parkinson. Cependant, le mécanisme exact de la neurodégénérescence et la question de savoir si les fibrilles en sont la cause ou un symptôme font encore l’objet de débats. D’autres maladies associées aux fibrilles amyloïdes sont les maladies à prions, un groupe de maladies neurodégénératives mortelles connues pour affecter les animaux et les humains. Elles sont également connues sous le nom d’encéphalopathies spongiformes transmissibles (EST). Ces troubles peuvent survenir spontanément via une mutation héréditaire et peuvent être transmis à d’autres par voie infectieuse. Un exemple typique de maladie à prions est l’encéphalopathie spongiforme bovine, également connue sous le nom de maladie de la vache folle, une maladie neurodégénérative chez les bovins. Cette maladie peut être transmise aux humains qui consomment la viande infectée, où elle est appelée maladie de Creutzfeldt-Jakob.

Leitura Sugerida

  1. Reynaud, E. Protein Misfolding and Degenerative Diseases. Nature Education (2010), 3(9):28
  2. Chiti F, Dobson CM. Protein Misfolding, Amyloid Formation, and Human Disease: A Summary of Progress Over the Last Decade. Annu Rev Biochem. (2017);86 27-68.
  3. Cobb, N. J., & Surewicz, W. K. (2009). Prion diseases and their biochemical mechanisms. Biochemistry, 48(12), 2574–2585. https://doi.org/10.1021/bi900108v
  4. Rambaran, R. N., & Serpell, L. C. (2008). Amyloid fibrils: abnormal protein assembly. Prion, 2(3), 112–117. https://doi.org/10.4161/pri.2.3.7488