Dégradation des ARNm non-sens

Lorsqu’une molécule d’ARNm est transportée du noyau alors que son extrémité cinq prime émerge d’un pore nucléaire, un ribosome commence à la traduire. Ce test de traduction vérifie l’ARNm pour les erreurs et signale les ARNm irrégulièrement traitées pour la dégradation. Dans ce mécanisme de surveillance ARNm appelé voie de dégradation des ARNm non-sens-ou NMD-le ribosome peut détecter si un ARNm a un codon non-sens ou stop au mauvais endroit.En général, un pré-ARNm peut contenir des codons d’arrêt dans des introns en plus du codon stop prévu. Lorsque ce pré-ARNm est épissé et traité dans le noyau, les complexes de jonction d’Exon-ou EJCs-lient l’ARNm à chaque site d’épissage. Dans le test de la traduction, les EJCs sont déplacés par le ribosome en mouvement.Dans un ARNm normalement épissé, ce codon stop-marqué par la séquence UAA, UAG ou UGA-se trouve dans le dernier exon. Ainsi, lorsque le ribosome l’atteint et que la traduction est terminée, il n’y a plus d’EJCs liés. Quand l’ARNm réussit le contrôle de qualité il est alors disponible pour d’autres séries de traduction.Les ARNm partiellement épissés ont toujours des codons non-sens présents dans le cadre de lecture de l’ARNm. Ce phénomène est observé plus fréquemment chez les organismes ayant des introns plus longs. Comme un ribosome traduit ce ARNm, il atteint un codon stop avant d’interagir avec le dernier EJC.Ce ribosome bloqué termine la traduction prématurément alors que la voie active la réponse NMD. L’EJC relié sert de plate-forme de liaison pour les facteurs NMD, y compris les protéines up-frameshift UPF1, UPF2 et UPF3, et l’enzyme phosphorylante-SMG. Ces protéines recrutent des exonucléases qui dégradent l’ARNm défectueux.La surveillance de NMD est essentielle pour choisir des combinaisons génétiques qui peuvent produire une protéine fonctionnelle.