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9.8:

Chaperoni molecolari e ripiegamento delle proteine

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Biologia Molecular
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Molecular Chaperones and Protein Folding

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Poiché sono sintetizzati nella cellula, la maggior parte delle proteine non si ripiegano spontaneamente nella loro conformazione nativa, ma richiedono una classe speciale di proteine chiamate chaperones per aiutarle a ripiegarsi. Dei diversi tipi di chaperones molecolari, trovati nei procarioti e negli eucarioti, le due famiglie principali sono le proteine di shock termico Hsp70 e Hsp60. In una proteina correttamente ripiegata, i patches idrofobi sono nascosti all’interno.In proteine malripiegate, i patches idrofobi sono esposti. Tali patches su diverse molecole proteiche possono legarsi l’uno all’altro portando ad un’aggregazione irreversibile di proteine. I chaperones riconoscono questi patches idrofobi esposti, e prevengono l’aggregazione proteica, facilitando il ripiegamento delle proteine.Il meccanismo Hsp70 agisce spesso prima che la proteina lasci il ribosoma, con ogni monomero legato all’ATP, riconoscendo il più piccolo tratto di aminoacidi idrofobi sulla superficie proteica. Un insieme di proteine Hsp40 più piccole interagisce con questo complesso e innesca l’idrolisi dell’ATP. Di conseguenza, parti di Hsp70 si uniscono come morse, intrappolando la proteina dispiegata all’interno.Successivamente, l’ATP lega di nuovo il complesso, inducendo la dissociazione di Hsp70 e rilasciando il polipeptide legato, lasciandogli una possibilità di ripiegare. Se la ripiegatura non avviene abbastanza rapidamente, il polipeptide può legarsi di nuovo, e il processo viene ripetuto fino a quando la proteina viene ripiegata nella sua conformazione nativa. In alternativa, un polipeptide completamente sintetizzato e parzialmente ripiegato può essere consegnato ad una chaperonina.Le chaperonine sono grandi complessi proteici, a forma di barile che forniscono una camera isolata per la ripiegatura delle proteine, con una metà del barile simmetrico che opera su una proteina alla volta. In E.coli, il sistema di chaperonine è chiamato GroEL/GroES, mentre l’analogo eucariotico è chiamato Hsp60. Una proteina dispiegata viene catturata dalle interazioni idrofobiche alla superficie esposta dell’apertura.Questo legame iniziale spesso aiuta a distendere una proteina malripiegata, una volta che la proteina è all’interno, il legame di ATP sigilla la camera con un cap. L’interno della camera è rivestito con superfici idrofile, dove la proteina può ripiegarsi in isolamento. L’idrolisi dell’ATP indebolisce il legame del cap, e il legame di ulteriori molecole di ATP, espelle il cap.La proteina di substrato, che sia ripiegata o no, viene rilasciata dalla camera.

9.8:

Chaperoni molecolari e ripiegamento delle proteine

The native conformation of a protein is formed by interactions between the side chains of its constituent amino acids. When the amino acids cannot form these interactions, the protein cannot fold by itself and needs chaperones. Notably, chaperones do not relay any additional information required for the folding of polypeptides; the native conformation of a protein is determined solely by its amino acid sequence. Chaperones catalyze protein folding without being a part of the folded protein.

The unfolded or partially folded polypeptides, which are often intermediates in the folding pathway, are stabilized by chaperones, leading to the final correctly folded state. Without chaperones, the unfolded or partially folded polypeptides may misfold or form insoluble aggregates. This is particularly observed in proteins in which the carboxy or C-terminus is required for the correct folding of the amino or N-terminus. In such cases, a chaperone can bind and stabilize the N-terminal part of the polypeptide in an unfolded conformation until the rest of the peptide chain is synthesized and the whole protein can fold correctly.

Chaperones can also stabilize unfolded polypeptide chains as they are transported into subcellular organelles. For instance, during the transfer of proteins into the mitochondria from the cytosol, it is easier for partially unfolded conformations to be transported across the mitochondrial membrane. During the transport, the partially unfolded polypeptides are stabilized by chaperones.

Additionally, chaperones play an important role in the assembly of proteins that have a complex structure, such as multi-subunit proteins. These proteins comprise multiple polypeptide chains – each of which needs to be correctly folded and then assembled in a specific manner. In the processes involved, chaperones assist in protein folding and the stabilization of unassociated components while other parts of the protein are undergoing assembly.

Leitura Sugerida

  1. Cooper GM. The Cell: A Molecular Approach. 2nd edition. Sunderland (MA): Sinauer Associates; 2000. Protein Folding and Processing. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9843/