Stor volym (20L +) Filtrering av Coastal Havsvatten Prover
Summary
Denna video dokument stor volym (≥ 20 L) filtrering av mikrobiella biomassan, mellan 0.22μm och 2.7μm i diameter, ur vattnet.
Abstract
Arbetsflödet börjar med insamling av kustnära marina vatten för nedströms mikrobiella, närings-och spårgas analyser. För denna metod har prover som tagits från däcket på HMS John Strickland verksamma i Saanich Inlet. Denna video dokument stor volym (≥ 20 L) filtrering av mikrobiella biomassan, mellan 0.22μm och 2.7μm i diameter, ur vattnet. Två 20L prover kan filtreras samtidigt med en enda pump utrustad med fyra roterande huvuden. Filtreringen sker i fältet på förlängda resor eller omedelbart efter avkastning för dagsutflykter. Det är viktigt att registrera den mängd vatten som passerar genom varje sterivex filter. För att förhindra att biofilm bildas mellan provtagning resor måste all utrustning för filtrering sköljas med utspädd HCl och avjoniserat vatten och autoklaveras direkt efter användning. Denna procedur tar cirka 5 timmar plus en extra timme för sanering.
Protocol
Discussion
Det är viktigt att torka av bänkar och pumpar med en fuktig handduk efter användning för att ta bort eventuella kvardröjande spår av salt vatten som annars skulle korrodera utrustning. Även om förfarandet är enkelt, kan den tid som kravet omfattande beroende på koncentrationen av biomassa eller skräp i provet filtreras.
Declarações
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Vi vill tacka det kanadensiska institutet för innovation, British Columbia Kunskap utvecklingsfonden och Statens Sciences and Engineering Research Council (NSERC) i Kanada för att stödja pågående studier på låg syre regioner i kustnära och öppna hav vatten. DAW stöddes av stipendier från NSERC, Killam och Tula stiftelsen finansierade Centrum för Mikrobiell diversitet och evolution.
Materials
| Material Name | Tipo | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| Peristaltic pump | Masterflex (Cole Palmer) | 77913-20, 77200-62, 77200-04 | ||
| Tygon LFL tubing | Masterflex (Cole Palmer) | 06429-24 | For filtration apparatus | |
| Hose clamps | Cole Palmer | 0683204 | For filtration apparatus | |
| 1/4” x 3/16” pipe adaptors | Cole Palmer | 31702-20 | For filtration apparatus | |
| Polypropylene prefilter housing | ADVANTEC | 501200 | For filtration apparatus | |
| Metal luer fitting (Hose end to Male luer lock) | Cole Palmer | 31507-27 | For filtration apparatus | |
| 2“ Magnets | For filtration apparatus | |||
| 3 port carboy caps | For filtration apparatus | |||
| GV 0.22 μm STERIVIX filters | Millipore | SVGV01R5 | ||
| 47 mm diameter 2.7 μm GF/D filters | Whatman | 1823047 | ||
| Lysis buffer | Reagent | 0.75 M sucrose, 40 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8.3) | ||
| 0.1 % HCl | Reagent | For post-filtration rinse | ||
| Autoclaved water | Reagent | For post-filtration rinse |
