العزلة ذات جودة عالية ، RNA سليمة هو خطوة أساسية في بروتوكولات مختبر كثيرة. هنا ، علينا أن نظهر استخراج الحمض النووي الريبي من الأجنة الزرد كله والتوليف [كدنا] لاحقة في تطبيق إجراءات التجريبية المختلفة بما في ذلك التعبير الجيني التحليل ميكروأري.
Abstract
العديد من الإجراءات المختبرية هامة ومعقدة تتطلب مدخلات عالية من الحمض النووي الريبي ، ونوعية سليمة. ويمكن لعينة المتدهورة أو وجود شوائب تؤدي إلى نتائج كارثية في مجال التطبيقات التجريبية المصب. ومن ثم فهي ذات أهمية قصوى لاستخدام تقنيات متينة مع العديد من الضمانات والضوابط لمراقبة الجودة لضمان عينة متفوقة. هنا ، نحن من التفصيل على بروتوكول لعزل الحمض النووي الريبي من مجموع الأجنة الزرد بأكملها باستخدام ممسخ الكيميائية المتاحة تجاريا وتنظيف لاحقة لإزالة آثار الحمض النووي والشوائب باستخدام الحمض النووي الريبي عزلة تجارية عدة. كما RNA غير مستقر نسبيا ، وعرضة للانقسام بسهولة بواسطة RNAses ، ومعظم البروتوكولات التعبير الجيني فحص باستخدام المنتج الذي يتم تصنيعه [كدنا] مباشرة من قالب الحمض النووي الريبي. نحن من التفصيل إجراء لتحويل الحمض النووي الريبي في الناتج [كدنا] أكثر استقرارا استخدام عدة متاحة تجاريا. طوال هذه الإجراءات هناك العديد من الضوابط لمراقبة الجودة لضمان أن العينة ليست متدهورة أو ملوثة. المنتج النهائي من هذه البروتوكولات هو [كدنا] التي هي مناسبة لتحليل ميكروأري ، RT PCR أو تخزين طويل الأجل.
Protocol
الجزء 1 : استخراج الحمض النووي الريبي مجموع باستخدام الكاشف TRIzol عند العمل مع الجيش الملكي النيبالي من المهم جدا للعمل في بيئة خالية من RNAses. احتياطات بسيطة مثل وجود ماصات محفوظة للاستخدام فقط مع الإجراءات RNA والرش في منطقة عمل مع كاش…
Discussion
هشاشة جزيء الحمض النووي الريبي هو الاعتبار الأهم الذي ينبغي ألا يغيب عن البال طوال هذا البروتوكول. وينبغي دائما أن المعدات المعقمة ريبونوكلياز خالية تستخدم في منطقة خالية من ريبونوكلياز المختبر. ومن المفيد أن تحتفظ بجزء من المختبر لاستخدامها في إجراءات RNA فقط. يجب ر?…
Declarações
The authors have nothing to disclose.
Materials
Material Name
Tipo
Company
Catalogue Number
Comment
Glycogen (5 mg/ml)
Ambion
9510
NanoDrop ND-100
Thermo Scientific
ND-1000
Pellet Pestles with Microfuge Tube
VWR
KT749520-0090
Phase Lock Gel Light, 1.5 ml
Eppendorf
2302800
Phenol, Tris-saturated
Roche Diagnostics
3117944001
RNAse Away
VWR
17810-491
RNAse-Free DNase Set
Qiagen
79254
RNEasy Mini Kit
Qiagen
74104
SuperScript® First-Strand Synthesis System for RT-PCR
Peterson, S. M., Freeman, J. L. RNA Isolation from Embryonic Zebrafish and cDNA Synthesis for Gene Expression Analysis. J. Vis. Exp. (30), e1470, doi:10.3791/1470 (2009).