Summary

Денатурирующих Мочевина полиакриламидном геле (мочевина PAGE)

Published: October 29, 2009
doi:

Summary

Денатурирующих мочевины полиакриламидном геле используется для разделения одноцепочечных ДНК или РНК, до предела в 500 нуклеотидов. Карбамид в сочетании с тепло денатурации образцов и неструктурированных одной нити мигрировать в гель матрицы в зависимости от их молекулярного веса.

Abstract

СТРАНИЦА мочевины или денатурации мочевиной полиакриламидном геле работают 6-8 М мочевины, которая денатурирует вторичных ДНК или РНК, структурам и используется для их разделения в матрице полиакриламидном геле на основе молекулярной массой. Фрагменты от 2 до 500 баз, с длиной различия как малые, как одного нуклеотида, могут быть разделены с помощью этого метода 1. Миграция образца зависит от выбранного акриламида концентрации. Высокий процент полиакриламидном решает нижняя молекулярных фрагментов весом. Сочетание мочевины и температуре 45-55 ° С в течение геля позволяет запустить для разделения неструктурированных ДНК или РНК молекул.

В целом этот метод, необходимые для анализа или очистки одноцепочечной ДНК или РНК фрагменты, например, синтезированные или меченых олигонуклеотидов или продуктов из ферментативных реакций расщепления.

В этом видео статье мы покажем, как подготовить и запустить денатурирующих гелях мочевины полиакриламида. Технические чаевые включены в дополнение к оригинальным 1,2 протокола.

Protocol

Полный и подробный текст протокола для этой экспериментальной процедуры доступны в текущих протоколов в области молекулярной биологии. Подробная шаг за шагом инструкции по сборке гель бутерброд и гель для аппарата можно найти на веб-сайте BioRad 3. Необходимое обору…

Discussion

  1. Группа резкости зависит от нескольких факторов. Объем выборки загружен для резких полос должна быть как можно меньше, то есть идеально между 1-5 мкл. Тем не менее, до 15 мкл может быть загружена который по-прежнему обеспечивает приемлемое разрешение. Менее объем пробы результаты в четкие полосы. </l…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Эта работа была поддержана Сингапур академического научного совета (АРК) [номер гранта 90/07]. Мы благодарим Radiodurans за поддержку.

Referências

  1. Maniatis, T., Jeffrey, A., van deSande, H. Chain length determination of small double- and single-stranded DNA molecules by polyacrylamide gel electrophoresis. Bioquímica. 14, 3787-3794 (1975).
  2. Albright, L. M., Slatko, B. E. Denaturing polyacrylamide gel electrophoresis. Curr Protoc Nucleic Acid Chem. , (2001).
  3. . . PROTEAN II xi Cell and PROTEAN II xi 2-D Cell Instruction Manual. , (2001).
check_url/pt/1485?article_type=t

Play Video

Citar este artigo
Summer, H., Grämer, R., Dröge, P. Denaturing Urea Polyacrylamide Gel Electrophoresis (Urea PAGE). J. Vis. Exp. (32), e1485, doi:10.3791/1485 (2009).

View Video