جهاز ميكروفلويديك الانجذاب الكيميائي لقياس تركيز البكتيريا في التدرجات مستقرة
Summary
يصف هذا البروتوكول على تطوير جهاز للتحقيق في ميكروفلويديك الكيميائي الجرثومي في التدرجات تركيز chemoeffectors مستقرة.
Abstract
الكيميائي يسمح البكتيريا لنهج مصادر جاذبة للمواد الكيميائية أو لتجنب مصادر للمواد الكيميائية طارد. رصد البكتيريا باستمرار تركيز chemoeffectors محددة بمقارنة التركز الحالي للتركيز الكشف عن بضع ثوان في وقت سابق. هذه المقارنة يحدد اتجاه صافي الحركة. على الرغم من عدة تدرجات المتنافسة غالبا ما تتعايش في الطبيعة ، والنهج التقليدي للتحقيق الكيميائي الجرثومي غير كافية لقياس الهجرة ردا على التدرجات تركيز الجاذبة والطاردة. هنا ، نحن تصف وضع نموذج لتقديم الكيميائي ميكروفلويديك التدرجات تركيز دقيق وثابت من chemoeffectors للبكتيريا والتحقيق كميا استجابتها لتطبيق التدرج. الجهاز تنوعا في تلك التدرجات تركيز تركيز أي المطلقة المطلوبة وقوة الانحدار يمكن توليدها بسهولة عن طريق خلط ناشر. وأظهر الجهاز باستخدام استجابة<em> القولونية</em> RP437 إلى التدرجات من الأحماض الأمينية وأيونات النيكل.
Protocol
Discussion
ويمكن حساب معامل القسم الكيميائي (CPC) ومعامل الهجرة الكيميائي (CMC) كما هو موضح في ماو وآخرون 5. إذا تم الكشف عن خلية على الجانب عالية التركيز ، وإعطائها قيمة +1 ، في حين يرد الكشف عن خلية على الجانب تركيز منخفض قيمة -1. ولخص القيم صعودا ومقسوما على العدد الكلي لل?…
Acknowledgements
وأيد هذا العمل في جزء من مؤسسة العلوم الوطنية (CBET 0846453).
Referências
- McDonald, J. C. Prototyping of microfluidic devices in poly(dimethylsiloxane) using solid-object printing. Anal Chem. 74, 1537-1545 (2002).
- Hansen, M. C., Palmer, R. J. J., Udsen, C., White, D. C., Molin, S. Assessment of GFP fluorescence in cells of Streptococcus gordonii under conditions of low pH and low oxygen concentration. Microbiol. 147, 1383-1391 (2001).
- Englert, D. L., Manson, M. D., Jayaraman, A. A Flow-Based Microfluidic Device for Quantifying Bacterial Chemotaxis in Stable, Competing Gradients. Appl Environ Microbiol. 75, 4557-4564 (2009).
- Englert, D. L., Jayaraman, A., Manson, M. D. . Microfluidic techniques for the analysis of bacterial chemotaxis. , (2009).
- Mao, H., Cremer, P. S., &, M. a. n. s. o. n. A sensitive, versatile microfluidic assay for bacterial chemotaxis. PNAS. 100 (9), 5449-5454 (2003).
