Method Article

Investigando Tecido e órgãos específicos Responses Fitocromo usando FACS assistida Célula tipo Profiling expressão específica no Arabidopsis thaliana

DOI:

10.3791/1925

May 29th, 2010

In This Article

Summary

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A base molecular do espaço-respostas específicas fitocromo está sendo investigado o uso de plantas transgênicas que apresentam tecidos e órgãos específicos deficiências fitocromo. O isolamento de células específicas exibindo esgotamento cromóforo fitocromo induzida por fluorescência-Activated Celular classificação seguido por análises de microarray está sendo utilizada para identificar genes envolvidos em respostas espaciais específicos fitocromo.

Abstract

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Media luz uma série de processos de desenvolvimento e de adaptação ao longo do ciclo de vida de uma planta. Plantas utilizam a luz de absorção de moléculas chamadas fotorreceptores de sentir e adaptar-se a luz. O vermelho / vermelho-extremo de absorção de luz fotorreceptores fitocromo têm sido estudadas extensivamente. Fitocromos existir como uma família de proteínas com funções distintas e sobrepostas em todos os sistemas de plantas superiores em que foram estudados

Protocol

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1. Crescimento da Planta

  1. Confirmado UAS-BVR X GAL4-GFP linha armadilha enhancer isoladas como descrito 4 (Para um resumo ver Fig. 1.) E as linhas do tipo selvagem ou parental são semeadas em solo, ou seja, ~ 2000 sementes esterilizadas por linha.
  2. As plantas são cultivadas por 5 semanas em solo sob iluminação branca de 100 μmolm -2 s -1 a 22 ° C e umidade de 70%.

2. Folha de protoplastos de isolamento (adaptado de Denecke Vitale e 9)

  1. Para isolar protoplastos, prepare TEX buffer. Para um buffer de litros TEX, pesar os seguintes componentes: 3,1 g sais Gamborg ....

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Discussion

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Perfil de expressão gênica através de microarrays (1) indicou que mais de 30% dos genes em Arabidopsis mudas são leves regulamentados e 11 (2) identificou um vasto conjunto de genes que codificam proteínas de transdução de sinal de luz envolvidos na cascata de sinalização fitocromo 12, 13 . Tais experimentos sugerem que a luz induz a mudanças rápidas e de longo prazo na expressão genética. Cada pool de fitocromos pode controlar apenas um subconjunto de respostas de desenvolvimento e de adaptação. A.......

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Acknowledgements

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Trabalho no laboratório Montgomery nas respostas fitocromo em plantas é apoiado pela National Science Foundation (Grant no. MCB-0919100 para BLM) e Ciências Químicas, Geociências e Biociências Divisão do Escritório de ciências básicas da energia, o Office of Science, EUA Departamento de energia (não concedem. FG02 DE 91ER20021 a BLM). Agradecemos a Melissa Whitaker de assistência técnica durante as filmagens e leitura crítica do manuscrito, Stephanie Costigan de assistência experimental, Dr. Luís Rei de assistência ao desenvolvimento e otimização de fluorescência-Activated Celular classificação protocolos para a classificação de protoplastos Arabidopsis e Frame Dr. M....

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Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
Anticorpo anti-BVRQED Bioscience Inc.56257-100
Celulase “ Onozuka” R-10SERVA EletroforeseMSPC 0930
Gamborg' s Mistura de sais basais B5Sigma-AldrichG5768
Macerozyme R-10SERVA EletroforesePTC 001
MES, baixo teor de umidadeSigma-AldrichM3671
Sais de Murashige e SkoogCaisson Laboratories74904
PhytablendCaisson Laboratories28302
RNeasy Plant MinikitQiagen16419

References

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  1. Franklin, K. A., Quail, P. H. Phytochrome functions in Arabidopsis development. J. Exp. Bot. 61, 11-24 (2010).
  2. Montgomery, B. L. Right place, right time: Spatiotemporal light regulation of plant growth and development. Plant Signal Behav. 3, ....

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Phytochrome ResponsesFACS AssistedCell Type SpecificGene Expression ProfilingArabidopsis thalianaFluorescence Activated Cell SortingProtoplast IsolationConfocal MicroscopyRNA ExtractionMicroarray Analysis

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