Summary

Rilevamento delle interazioni proteiche in pianta utilizzando un gateway compatibile complementazione fluorescenza biomolecolare (BiFC) Sistema

Published: September 16, 2011
doi:

Summary

Abbiamo sviluppato una tecnica per testare interazioni proteina-proteina in pianta. Una proteina fluorescente gialla (YFP) è divisa in due frammenti non si sovrappongono. Ogni frammento viene clonato in-frame ad un gene di interesse attraverso il sistema Gateway, consentendo l'espressione di proteine ​​di fusione. Ricostituzione del segnale YFP si verifica solo quando le proteine ​​interagiscono inchiesta.

Abstract

Abbiamo sviluppato una tecnica BiFC per testare l'interazione tra due proteine ​​in vivo. Ciò si ottiene dividendo una proteina fluorescente gialla (YFP) in due frammenti non si sovrappongono. Ogni frammento viene clonato in-frame ad un gene di interesse. Questi costrutti possono essere co-trasformato in Nicotiana benthamiana tramite trasformazione mediata da Agrobacterium, consentendo l'espressione di proteine ​​di fusione di transito. La ricostituzione del segnale YFP si verifica solo quando le proteine ​​interagiscono inchiesta 1-7. Per testare e convalidare il interazioni proteina-proteina, BiFC possono essere utilizzati insieme con il lievito due ibridi (Y2H) test. Questo può rilevare le interazioni indirette che può essere trascurato nel Y2H. La tecnologia Gateway è una piattaforma universale che consente ai ricercatori di navetta il gene di interesse (GOI), in quanto espressione di molti e sistemi di analisi funzionale possibile 8,9. Sia l'orientamento e la cornice di lettura può essere mantenuta senza l'utilizzo di enzimi di restrizione o la legatura di rendere l'espressione-ready cloni. Come risultato, si può eliminare tutte le re-sequencing misure per garantire risultati costanti nel corso degli esperimenti. Abbiamo creato una serie di vettori Gateway compatibile BiFC e Y2H che fornire ai ricercatori un facile da usare strumenti per eseguire test sia BiFC e Y2H 10. Qui, dimostriamo la facilità di utilizzo il nostro sistema BiFC per testare interazioni proteina-proteina in N. benthamiana piante.

Protocol

1. Preparazione della cultura Agrobacterium Tumefaciens ceppo GV3101 precedentemente trasformato compatibile con BiFC Gateway vettore pEarleyGate201-YC e pEarleyGate202-YN, ciascuno contenente una fusione costrutto di governo indiano. Inoculare un 5-ml YEB (5g L estratto di manzo -1, 1g L estratto di lievito -1, 5 g L -1 peptone, 5g L Saccarosio -1, 2mM MgSO 4, pH 7,2) cultura della proteina di fusione BiFC costruisce trasforma…

Discussion

Saggio BiFC è un potente strumento per studiare le interazioni delle proteine. A differenza del tradizionale test Y2H, BiFC non solo permette la visualizzazione delle interazioni proteina-proteina, ma fornisce anche ulteriori informazioni del complesso proteico come la localizzazione sub-cellulare. Inoltre, è possibile rilevare le interazioni indirette finché le due proteine ​​candidato può essere portato abbastanza vicino da un terzo partner. Come ogni tecnologia, BiFC ha i suoi limiti. A causa della necessità…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Ringraziamo Vi Nguyen per la lettura del manoscritto e l'assistenza di laboratorio in generale.

Materials

Name of the reagent Company Catalogue number
Acetosyringone Sigma D134406
MES hydrate Sigma M2933
1 mL slip-tip tuberculin syringe BD 309602

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Citar este artigo
Tian, G., Lu, Q., Zhang, L., Kohalmi, S. E., Cui, Y. Detection of Protein Interactions in Plant using a Gateway Compatible Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) System. J. Vis. Exp. (55), e3473, doi:10.3791/3473 (2011).

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