Summary
Abstract
The Journal of visualiseres Experiments (Jove) begynner 2012 med å publisere sin 1500th artikkelen, som fokuserer på en metode for analyse av frie radikaler sammensetningen av sigarettrøyk. Selv om tobakk tjære er antatt å være den mest kreftfremkallende agent i sigarettrøyk, er frie radikaler godt kjente kreftfremkallende molekyler, og nivået på disse kreftfremkallende stoffer som finnes i sigarettrøyk er foreløpig ikke kjent. Metoden brukt i denne artikkelen kombinerer bruk av en enkelt-port røyking enhet, som simulerer sigarett puffing, med elektron spinn resonans (ESR) spektroskopi, en teknikk som måler spinne energien slippes ut av uparede elektroner i frie radikaler. En viktig modifikasjon av én port røyking enhet som brukes i denne artikkelen, er innføringen av et flytende nitrogen felle foran spin fellen. Flytende nitrogen fjerner vanndamp fra sigarettrøyk og forbedrer ESR spektra som resultat.
I tillegg tilmåling av frie radikaler konsentrasjon finnes i sigarettrøyk, blir plante antioksidanter innført i endret sigarett filter og ESR spektra av sigarettrøyk gått gjennom disse filtrene er oppnådd. Druefrøekstrakt og lykopen ble observert å ha de mest betydningsfulle scavenging effekt på frie radikaler, og hvis kostnadseffektiv måte å inkludere disse molekylene i sigarett filter kan utvikles, kan en mindre skadelig sigarett bli opprettet.
I klinisk og translasjonell medisin, presenterer Jove en analytisk metode for å bestemme de lokale Gyrification Index (LGI) – et mål på omfanget av kortikale folding. Kortikale bretter utvikle seg i løpet av de første få postnatal måneder, og uønskede hendelser i løpet av denne tiden kan føre til avvik i hjernens overflate anatomi, som kan til slutt korrelerer med nevropsykiatriske lidelser.
Analysen verktøy utviklet for å beregne lokale Gyrification Index er Freesurfer, som kan konvertere T1 vektet MRI skanner inn 3D rekonstruksjoner av hjernebarken. Separate rekonstruksjoner er skapt for de grå / hvit mater og grå / pial grensesnitt, som justeres manuelt før computating den LGI. Etter en glatting operasjon, er sirkulære regioner i pial og grå / hvite flater forhold, for å beregne LGI for tusenvis av punkter over hele hjernen. Freesurfer gjør analyse av gyrification enkle og tilgjengelige for klinikere og hjerneforskere, som er interessert i å sammenligne omfanget av kortikale folding mellom ulike individer i normal og sykdom stater.
Jove er Immunologi og infeksjonsbiologi artikkel for januar måned fortsetter tidsskriftets tradisjon for publisering cutting edge metodikk i vektor født sykdom forskning. Konkret legger denne artikkelen til Jove omfattende samling av protokoller for malaria forskning ved å utvide vårt bibliotek til cerebral malaria – en ødeleggendetilstand med høy følsomhet hos barn. Kort fortalt innebærer denne protokollen utsette en monolayer av menneskelige hjerne endotelceller, passaged på petriskåler, til plasmodium falciparum-infiserte røde blodceller. Etter vask og berikende trinn, kan høy avkastning av parasitter, som bærer potensialet til å infisere hjernen, bli isolert og ytterligere karakterisert.
I Neuroscience, viser Jove en metode for å studere migrering av neural crest cellene. Disse cellene er en forbigående, multipotent, utviklingsmessige celletype som kan, i tillegg til å bli neuronal vev, differensieres til glatt muskulatur, chromaffin celler, cartiliage og bein. Kyllingembryo er nøye forberedt, slik at stammen regionen kan bli isolert og nevralrøret excised for overnight kultur på fibronektin-belagt Dekkglass, som lar neural crest cellene å emigrere fra nevralrøret. Etter fjerning av nevralrøret, Dekkglass inneholder dyrkede neural crest celleneoverføres til en modifisert Zigmond kammer – et kammer som muliggjør en konsentrasjonsgradient av mulige kjemotaktisk agent for å bli etablert på tvers av kultur. Timelapes bildebehandling etterfulgt av analyse av celle baner, brukes til å vurdere kjemotaktisk potensialet av molekyler lastet inn i zigmund kammer, og gir innsikt i de molekylære signaler som styrer migrering av denne viktige utviklingsforstyrrelser celletype.
Disse inneholdt artikler består av fire av femti video-protokoller for utgivelse i januar. Andre bemerkelsesverdige artikler omfatter metoder for å visualisere cuticle strukturer c. elegans, termisk avbildning av forsinket utbruddet stølhet, dyrking av ventrale midthjernen i organotypic skiver, og inducing åreforkalkning i mus.
