Os vetores adenovirais de alta capacidade (HCAdV) desprovidos de todas as sequências codificadoras virais representam um dos vetores de entrega de genes mais avançados devido à sua alta capacidade de embalagem (até 35 kb), baixa imunogenicidade e baixa toxicidade. No entanto, para muitos laboratórios, o uso de HCAdV é dificultado pelo complicado procedimento de construção do genoma do vetor e produção de vírus. Aqui, um protocolo detalhado para clonagem e produção eficiente de HCAdV com base no plasmídeo pAdFTC contendo o genoma do HCAdV é descrito. A construção de genomas de HCAdV é baseada em um sistema de vetores de clonagem utilizando endonucleases homing (I-CeuI e PI-SceI). Qualquer gene de interesse de até 14 kb pode ser subclonado no vetor shuttle pHM5, que contém um sítio de clonagem múltipla flanqueado por I-CeuI e PI-SceI. Após a liberação mediada por I-CeuI e PI-SceI do transgene do vetor shuttle, o transgene pode ser inserido no vetor de clonagem HCAdV pAdFTC. Devido ao grande tamanho do plasmídeo pAdFTC e aos longos locais de reconhecimento das enzimas usadas associadas à forte ligação ao DNA, é necessário um manuseio cuidadoso dos fragmentos de clonagem. Para a produção do vírus, o genoma do HCAdV é liberado pela digestão NotI e transfectado em uma linha celular produtora baseada em HEK293 expressando de forma estável a Cre recombinase. Para fornecer todos os genes adenovirais para amplificação de adenovírus, é necessária a coinfecção com um vírus auxiliar contendo um sinal de empacotamento flanqueado por locais loxP. A pré-amplificação do vetor é realizada em células produtoras cultivadas em superfícies e a amplificação em larga escala do vetor é realizada em frascos giratórios com células produtoras cultivadas em suspensão. Para a purificação do vírus, são realizadas duas etapas de ultracentrifugação baseadas em gradientes de cloreto de césio, seguidas de diálise. Aqui são apresentadas dicas, truques e atalhos desenvolvidos nos últimos anos trabalhando com este sistema vetorial HCAdV.