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Artigo de método

Clonagem e produção em larga escala de alta capacidade vetores adenovirais com base no tipo adenovírus humano 5

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DOI:

10.3791/52894

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28 de janeiro de 2016

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Neste artigo

Resumo

Um protocolo para geração de vetores adenovirais de alta capacidade sem todas as sequências codificadoras virais é apresentado. A clonagem de transgenes contidos no genoma do vetor é baseada em endonucleases homing. A amplificação do vírus em células produtoras cultivadas como células aderentes e em suspensão depende de um vírus auxiliar que fornece genes virais em trans.

Resumo

Os vetores adenovirais de alta capacidade (HCAdV) desprovidos de todas as sequências codificadoras virais representam um dos vetores de entrega de genes mais avançados devido à sua alta capacidade de embalagem (até 35 kb), baixa imunogenicidade e baixa toxicidade. No entanto, para muitos laboratórios, o uso de HCAdV é dificultado pelo complicado procedimento de construção do genoma do vetor e produção de vírus. Aqui, um protocolo detalhado para clonagem e produção eficiente de HCAdV com base no plasmídeo pAdFTC contendo o genoma do HCAdV é descrito. A construção de genomas de HCAdV é baseada em um sistema de vetores de clonagem utilizando endonucleases homing (I-CeuI e PI-SceI). Qualquer gene de interesse de até 14 kb pode ser subclonado no vetor shuttle pHM5, que contém um sítio de clonagem múltipla flanqueado por I-CeuI e PI-SceI. Após a liberação mediada por I-CeuI e PI-SceI do transgene do vetor shuttle, o transgene pode ser inserido no vetor de clonagem HCAdV pAdFTC. Devido ao grande tamanho do plasmídeo pAdFTC e aos longos locais de reconhecimento das enzimas usadas associadas à forte ligação ao DNA, é necessário um manuseio cuidadoso dos fragmentos de clonagem. Para a produção do vírus, o genoma do HCAdV é liberado pela digestão NotI e transfectado em uma linha celular produtora baseada em HEK293 expressando de forma estável a Cre recombinase. Para fornecer todos os genes adenovirais para amplificação de adenovírus, é necessária a coinfecção com um vírus auxiliar contendo um sinal de empacotamento flanqueado por locais loxP. A pré-amplificação do vetor é realizada em células produtoras cultivadas em superfícies e a amplificação em larga escala do vetor é realizada em frascos giratórios com células produtoras cultivadas em suspensão. Para a purificação do vírus, são realizadas duas etapas de ultracentrifugação baseadas em gradientes de cloreto de césio, seguidas de diálise. Aqui são apresentadas dicas, truques e atalhos desenvolvidos nos últimos anos trabalhando com este sistema vetorial HCAdV.

Introdução

Para aplicações de terapia génica, é de grande importância para evitar efeitos colaterais citotóxicos e imunogénicas provocadas pela expressão de proteínas virais, a própria transgene ou por proteínas virais de entrada. Os vectores de adenovírus (Adv) são amplamente utilizados para introduzir ADN estranho numa ampla variedade de células para investigar o impacto da expressão do transgene 1,2. A versão mais avançada do AdV é representado por adenovírus vetores de alta capacidade (HCAdV) que faltam todas as sequências codificadoras virais 3,4 e oferecendo assim uma capacidade de acondicionamento até 35 kb, combinadas com baixa imunogenicidade e ba....

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Protocolo

1. Construção de Recombinantes HCAdV Genomas baseado no plasmídeo pAdFTC

Nota: Todos os plasmídeos foram descritos anteriormente 11,12 e estão disponíveis mediante solicitação. O procedimento de clonagem é mostrado esquematicamente na Figura 1.

  1. Clonar um gene de interesse (GOI) incluindo promotor e poliadenilação sinal (PA) para o transporte para o plasmídeo pHM5, usando uma estratégia de clonagem de escolha, para gerar pHM5-GOI.
    Observação: Uma vez que pAdFTC é um plasmídeo relativamente grande, protocolos clássicos de preparação de plasmídeo são recomendadas para evitar shee....

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Resultados

Aqui exemplos representativos para a clonagem, amplificação e purificação de preparações HCAdV são mostrados. Uma visão geral da estratégia de clonagem (Figura 1) e exemplos representativos para a clonagem e a libertação do genoma HCAdV por digestão com enzimas de restrição estão disponíveis (Figura 2). Um padrão de restrição típica após a libertação da cassete de expressão a partir de GI-pHM5 por PI-Sce I e I-I Ceu digerir e subsequent.......

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Discussão

O protocolo aqui apresentado permite a purificação de vectores HCAdV com base em adenovírus humano tipo 5 com base em procedimentos descritos anteriormente 4,12. O genoma HCAdV dentro do plasmídeo pAdFTC é destituído de todos os genes de adenovírus e só transporta as ITRs 5 'e 3'- e o sinal de empacotamento. Nesta estratégia do HV AdNG163R-2 4 fornece todos os genes necessários para a produção de vírus eficiente em trans. Isto oferece uma capacidade de acondicionamento de até 35 kb.......

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Divulgações

Os autores declaram que não têm interesses financeiros concorrentes.

Agradecimentos

Este trabalho foi apoiado pela bolsa DFG EH 192/5-1 (AE), o projeto da UE (E-rare-2) Transposmart (AE), o UWH Forschungsförderung (ES e WZ) e o programa de doutorado da Universidade Witten / Herdecke (PB). JL foi apoiado por uma bolsa do Conselho de Bolsas Chinesas e TB e MG pela fundação Else Kröner-Fresenius (EKFS).

....

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
I-CeuINew England BiolabsR0699Sresumo de restrição
PI-SceINew England BiolabsR0696Sresumo de restrição
T4 LigaseNew Engand BiolabsM0202Sligadura
SwaINew England BiolabsR0604Sresumo de restrição
NotINew England BiolabsR0189Sresumo de restrição
Fosfatase Alcalina Intestinal de Bezerro (CIP)New England BiolabsM0290Sdesfosforilação de plasmídeos digeridos
Hygromicina BPAN BiotechP02-015seleção de CRE expressando 116 células
DMEMPAN BiotechP04-03590     Meio de cultura celular Hek293T
Meio Essencial Mínimo (MEM) EaglePAN BiotechP04-08500116 meio de cultura de células   
Dulbecco' s tampão fosfato salino (DPBS)PAN BiotechP04-36500lavagem de células, ressuspensão de células
Frasco de armazenamento de 250 mlSigmaCLS430281-24EAinfecção de 116 células cultivadas em suspensão
500 ml PP CentrifugeTubesSigmaCLS431123-36EAsedimentação de células de cultura em suspensão
Frasco giratórioBellco1965-61030crescimento de 116 células em suspensão
Tubos ultra Clear UltracentrifugeBeckmann Coulter344059gradiente de densidade de centrifugação
UltracentrifugaçãoBeckmann Coulterdensidade gradiente centrifugação
SW-41 rotorBeckmann Coulterdensidade gradiente centrifugação
Spectrum Laboratories Spectrapor MembraneVWR132129tubo de diálise
de diálise prontos para uso Thermo66383diálise
one shot DH10B eletrocompetente E. coliinvitrogenC4040-52transformação de reações de ligação
PureYield Plasmid Midiprep SystemPromegaA2495midiprep
peqGOLD Tissue DNA Mini Kit Peqlab12-3396-02isolamento de DNA genômico
SuperFect Transfecção ReagenteQiagen301305transfecção de 116 células
opti MEM (10% FBS)Gibco31985-062transfecção de 116 células
iQ SYBR Green SupermixBioRad  170-8882q-PCR
CFX 96 C1000 touch Máquina de qPCRBiorad
Fenol/Clorofórmio/Álcool Isoamílico Carl RothA156.1purificação de DNA Cloreto de
césioCarl Roth8627.1gradiente de densidade centrifugação
acetato de sódio 99%Carl Roth6773.2DNA precipitação
LB médio Meio de crescimento bacterianoCarl RothX968.3
etanol  99.8% puroCarl Roth9065.5 Precipitação e lavagem de DNA
SDS 99.5%Carl Roth2326.2tampão de lise  tampão
EDTACarl Roth8043.2lise  tampão
Tris-HCl 99%Carl Roth9090.3tampão de diálise/lise  tampão
glicerol 99.5%Carl Roth3783.1tampão de diálise
MgCl2 98.5%Carl RothKK36.2tampão de diálise
NaClCarl Roth3957.1tampão de diálise opcional
KH2PO4Carl Roth3904.2tampão de diálise opcional
sacaroseCarlRoth 9286.1tampão de diálise opcional
Na2HPO4x2H2OCarl Roth4984.2Tampão de diálise opcional
Tubos de 1,5 mlSARSTEDT72.730.005Armazenamento de preparações de vírus a -80 &graus; O

Referências

  1. Benihoud, K., Yeh, P., Perricaudet, M. Adenovirus vectors for gene delivery. Curr Opin Biotechnol. 10 (5), 440-447 (1999).
  2. Crystal, R. G. Adenovirus: the first effective in vivo gene delivery vector. Hum Gene Ther. 25 (1), 3-11 (2014).
  3. Parks, R. J., et al.

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Reimpressões e permissões

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