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Artigo de método

Purificação e redobramento de amilóide fibrilas de (seu)

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DOI:

10.3791/53432

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19 de dezembro de 2015

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Neste artigo

Resumo

Um método cromatográfico de duas etapas é descrito para a purificação da proteína Shadoo recombinante expressa como corpos de inclusão em Escherichia coli, bem como um protocolo para fibrilar Shadoo purificado em estruturas amilóides.

Resumo

O sistema de expressão de Escherichia coli é uma ferramenta poderosa para a produção de proteínas eucarióticas recombinantes. Nós usá-lo para produzir Shadoo, uma proteína pertencente à família de prião. Um método de cromatografia para a purificação de (His) 6 tagged Shadoo recombinante expressa como corpos de inclusão é descrito. Os corpos de inclusão solubilizados em ureia 8 M e ligado a uma coluna de Ni 2+ -charged para realizar cromatografia de afinidade de iões. As proteínas ligadas são eluidas com um gradiente de imidazole. As fracções contendo proteína Shadoo são submetidas a cromatografia de exclusão de tamanho para obter uma proteína altamente purificada. No passo final é purificado Shadoo dessalinizada para remover os sais, ureia e imidazole. Shadoo proteína recombinante é um reagente importante para estudos bioquímicos e biofísicos de distúrbios conformação da proteína que ocorrem nas doenças de priões. Muitos relatórios demonstraram que as doenças neurodegenerativas priões são originários da deposição de facadale, ordenou fibrilas amilóides. Protocolos de exemplo que descrevem como fibrilar Shadoo em fibrilas amilóides no ácido e neutro / pHs básicos são apresentados. Os métodos de como produzir e fibrilar Shadoo pode facilitar a investigação em laboratórios que trabalham com doenças de príon, uma vez que permite a produção de grandes quantidades de proteína de uma maneira rápida e de baixo custo.

Introdução

Doenças neurodegenerativas causadas por príons, que incluem a encefalopatia espongiforme bovina em bovinos, scrapie em ovinos ea doença de Creutzfeldt-Jakob em humanos, são fatal e incurável. Prion doenças são caracterizadas por mudanças conformacionais da proteína príon celular composta principalmente de hélices, no-β-sheet cruz enriquecido amilóide conformer 1,2. Cross-beta-estruturas contêm densamente embalado e beta-folhas-cristalinos como altamente ordenadas estabilizado com ligações de hidrogênio 3,4. Amyloids Príon se auto-replicar devido aos beta-fios na borda crescente que fornecem um modelo para recrutar e converter uma unidade de prot....

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Protocolo

1. Produção de plasmídeo e Shadoo Expressão

Nota: O gene que codifica a proteína de murino Shadoo (Shadoo 25-122), foi subclonado no vector de expressão pET-28 11. Este clone foi usado para transformar E. SoluBL21 coli estirpe bacteriana, para expressar a proteína Shadoo com uma etiqueta de hexa-histidina N-terminal, (HHHHHHHHHHSSGHIDDDDKHMKGGRGGARGSARGVRGGARGASRVRVRP APRYGSSLRVAAAGAAAGAAAGVAAGLATGSGWRRTSGPGELGLEDDENGAMGGNGTDRGVYSYWAWTSG), como explicado anteriormente 11. O plasmídeo pode ser solicitado dos autores. O peso molecular calculado a partir da Shadoo sua sequência de aminoácidos ....

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Resultados

Cerca de 5-10 mg de proteína Shadoo purificado é obtido por litro de cultura bacteriana. A purificação em duas fases é necessário para obter Shadoo recombinante de elevado grau de pureza. A primeira etapa é realizada por cromatografia de afinidade com uma coluna de Ni 2+ -charged que conserva as suas-proteínas marcadas. As fracções eluídas são sujeitas a SDS-PAGE e corados com Coomassie Brilliant Blue (Figura 5A). As fracções que contêm proteína são reunidas e Shadoo adicionalmente purificado.......

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Discussão

Um protocolo de fácil e eficiente tanto para expressão e purificação de uma grande quantidade de proteína recombinante de ratinho Shadoo é apresentado. O método descrito permite a solubilização e purificação bem sucedida de (His 6) tagged Shadoo proteína recombinante. É importante, tal como referido no título, que quando expresso em uma bactéria procariota E. Shadoo coli acumula-se em corpos de inclusão. Antes da purificação Shadoo, as bactérias têm que ser lisadas por sonicação em um tampão.......

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Divulgações

Os autores não têm nada a divulgar.

Agradecimentos

Os autores gostariam de agradecer a Natalie Doude e David Westerway (Universidade de Alberta) por nos fornecerem Sho cDNA, Christophe Chevalier (INRA) pela construção de plasmídeos, Michel Brémont (INRA) por nos fornecer bactérias BL21Sol; Christine Longin (INRA) pela assistência TEM e Edith Pajot-Augy (INRA) pelos comentários e revisão.

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
AKTA FPLC GE, Amersham# 1363
HiLoad 16/60Superdex GE Healthcare17-1069-01
HiTrap IMACGE HealthcareGE17-0920-05
HiPrep26/10 Coluna de dessalinizaçãoGE HealthcareGE17-5087-01
SoluBL21 Competente E. coliGenlantisC700200
pET-28b+Novogen69865-3
IPTGSigma-AldrichI6758
LB-Broth médioSigma-AldrichL3022
Eppendorf BiophotometarEppendorf550507804
Trito X-100Life Technologies85111
NiSO4Sigma-Aldrich656895
EDTASigma-AldrichE6758
Tris-HClSigma-AldrichRES3098T
Comprimidos de Coquetel Inibidor de ProteaseRoche4693116001
NaClSigma-Aldrich746398
ImidazolSigma-AldrichI5513
Gdn-HClSigma-AldrichG4505
marcador de tamanho de proteína Thermo Fisher Scientific26620

Referências

  1. Biasini, E., Turnbaugh, J. A., Unterberger, U., Harris, D. A. Prion protein at the crossroads of physiology and disease. Trends in Neurosciences. 35, 92-103 (2012).
  2. Colby, D. W., Prusiner, S. B. De novo generation of prion strains. Nature Reviews. Microbiology. 9, 771....

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Reimpressões e permissões

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