Summary

Prosedyre for å vurdere effektiviteten av Fnokker for fjerning av dispergert Partikler fra planteekstrakter

Published: April 09, 2016
doi:

Summary

The design-of-experiments procedure presented here allows the evaluation of different flocculants in terms of their ability to aggregate dispersed particles in plant extracts, thus reducing turbidity and the costs of downstream processing.

Abstract

Plants are important to humans not only because they provide commodities such as food, feed and raw materials, but increasingly because they can be used as manufacturing platforms for added-value products such as biopharmaceuticals. In both cases, liquid plant extracts may need to be clarified to remove particulates. Optimal clarification reduces the costs of filtration and centrifugation by increasing capacity and longevity. This can be achieved by introducing charged polymers known as flocculants, which cross-link dispersed particles to facilitate solid-liquid separation. There are no mechanistic flocculation models for complex mixtures such as plant extracts so empirical models are used instead. Here a design-of-experiments procedure is described that allows the rapid screening of different flocculants, optimizing the clarification of plant extracts and significantly reducing turbidity. The resulting predictive models allow the identification of robust process conditions and sets of polymers with complementary properties, e.g. effective flocculation in extracts with specific conductivities. The results presented for tobacco leaf extracts can easily be adapted to other plant species or tissues and will thus facilitate the development of more cost-effective downstream processes for commodities and plant-derived pharmaceuticals.

Introduction

Planter er mye brukt til å produsere mat varer som fruktjuicer, men de kan også utvikles som plattformer for produksjon av høyere verdi biofarmasøytisk produkter 1-3. I begge tilfeller nedstrømsprosessering (DSP) begynner ofte med utvinning av væsker fra vev som blader eller frukter, etterfulgt av rensing av partikkelladede ekstrakter 4,5. For fremstilling av Biopharmaceuticals, kan kostnadene ved DSP utgjøre opptil 80% av de totale produksjonskostnadene 6,7, og dette delvis skyldes den høye partikkelbelastningen til stede i ekstrakter fremstilt av forstyrrende metoder så som blad-baserte homogenisering 8,9 . Selv om rasjonelt valg av filterlag som passer til partikkelstørrelsesfordelingen i ekstraktet kan øke filterkapasiteten og redusere kostnadene 10,11, kan forbedringen aldri overstige taket av absolutt kapasitet definert av antall partikler som må bibeholdes perenhet av filterområdet for å oppnå avklaring.

Taket kan løftes hvis færre partikler nå overflaten av de fineste filtrene i filtrerings toget, og dette kan oppnås hvis dispergerte partikler blandes med polymerer som er kjent som flokkuleringsmidler som fremmer aggregering for å danne store fnokker 12. Slike fnokker kan beholdes lenger oppstrøms av grovere og mindre kostbare posefiltre, redusere partikkelbelastningen nå finere og mer kostbare dybdefiltre. Polymerene skal ha sikkerhetsprofil som passer for sine applikasjoner, for eksempel for Biopharmaceuticals de må være i samsvar med god framstillingspraksis (GMP), og vanligvis de må ha en molekylvekt> 100 kDa og kan enten være nøytral eller belastes 13. Mens nøytrale flocculants generelt opptre ved kryssbinding spredt partikler forårsaker deres aggregering og dannelsen av flokker med diameter> 1 mm 11, ladede polymerer nøytralisere ansvaret for dispersed partikler, noe som reduserer deres løselighet og dermed forårsaker utfelling 14.

Flokkulering kan forbedres ved å justere parametere som buffer pH eller ledningsevne, og polymeren type eller konsentrasjon, for å samsvare med egenskapene til ekstraktet 15,16. For tobakkekstrakter forbehandlet med 0,5-5,0 g L -1 polyetylenimin (PEI), større enn 2 ganger økning i dybdefilter kapasitet ble rapportert i en 100 L pilot-skala prosess. Kostnaden for denne polymer er mindre enn € 10 kg -1 så sin innføring i prosessen resulterte i kostnadsbesparelser på rundt € 6000 for filtre og forbruksvarer per batch 16 eller enda mer når den kombineres med cellulosebasert filter hjelpemidler 17. Likevel er prediktive modeller nødvendig for å evaluere en priori økonomiske fordelene av flokkuleringsmidler fordi deres inkludering kan kreve hold trinn på 15-30 min 16,18, noe som resulterer i ytterligere investeringskostnader for lagringtanker. Men det er ikke mekanistiske modeller som kan forutsi utfallet av slike eksperimenter på grunn av den komplekse natur flokkulering. Derfor ble en mer hensiktsmessig utforming-av-eksperimenter (DoE) tilnærming 19 utviklet som beskrevet i denne artikkelen. En protokoll for den generelle DoE prosedyren har nylig blitt publisert 20.

Småskala enheter er nå tilgjengelig for high-throughput screening av flokkulering forhold 21. Imidlertid kan disse anordninger ikke realistisk å simulere forholdene under flokkulering av plante-ekstrakter fordi dimensjonene på reaksjonsbeholderen (~ 7 mm til brønnene på en 96-brønns plate), og partiklene eller fnokkene kan være mindre enn en størrelsesorden fra hverandre. Dette kan påvirke blande mønstre og dermed prediktiv kraft av modellen. Videre kan det være vanskelig å skalere ned prosesser som involverer utfelling som skyldes ikke-lineære endringer i blande oppførsel og bunnfallet staheten 22. Derfor skisserer denne artikkelen en benk-top-skala screening system med en gjennomstrømning på 50-75 prøver per dag, noe som gir resultater som er skalerbar fra den innledende 20 ml reaksjonsvolum til en 100 L pilot-skala prosess 16. Når det kombineres med en DoE tilnærming, gjør dette at prediktive modeller som skal brukes til prosessoptimalisering og dokumentasjon som en del av en kvalitet-for-designkonsept.

Metoden er beskrevet nedenfor, kan også tilpasses Biopharmaceuticals produsert i cellekultur-baserte prosesser, hvor flokkuleringsmidler også vurderes som et kostnadsbesparende verktøy 23. Den kan også brukes til å modellere utfelling av target-proteiner fra et urent ekstrakt som en del av en rensestrategi, som vist for β-glukuronidase produsert i raps, mais og soyabønner 24,25. En detaljert beskrivelse av flokkuleringsmiddel egenskaper kan finnes andre steder 16,26, og det er viktig å sikre at polymeren konsentrasjonersjoner er enten ikke-toksiske eller skadelige nivåer under i det endelige produkt 11.

Protocol

1. Utvikle en Tilstrekkelig Experimental Strategy Identifiser de miljømessige og prosessparametre som er relevante for flokkulering prosedyre skal etableres eller optimalisert, det vil si hvilke faktorer har sterkest effekt på flokkulering. Vanligvis er det flere slike parametere så en DOE metode som nylig beskrevet 20 er nødvendig på grunn av mangel på mekanistiske modeller. Velg parametere (faktorer) basert på litteraturdata 12, tidligere kunnskap og erfaring m…

Representative Results

Flokkulering av tobakk ekstrakt med forskjellige polymerer Fremgangsmåten beskrevet ovenfor ble med hell anvendt for å utvikle en fremgangsmåte for flokkulering av tobakkekstrakter under fremstillingen av et monoklonalt antistoff (HIV-nøytraliserende antistoff 2G12) og et fluorescerende protein (DsRed) (figur 1) 16, og har siden blitt overført til andre proteiner, inkludert lektiner, malaria va…

Discussion

Det viktigste å vurdere når du setter opp en DoE å karakterisere partikkel flokkulering er at design skal i prinsippet kunne oppdage og beskrive forventede eller mulige effekter 36,38, f.eks påvirkning av pH, polymertype og polymerkonsentrasjon 16. Derfor er det viktig å evaluere brøkdel av design plass (FDS) før de egentlige eksperimenter. FDS er den brøkdel av det flerdimensjonale eksperimentelle plass (dekket av konstruksjonsfaktorer, for eksempel pH) innenfor hvilken d…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

I would like to acknowledge Dr. Thomas Rademacher for providing the transgenic tobacco seeds and Ibrahim Al Amedi for cultivating the tobacco plants. I wish to thank Dr. Richard M Twyman for editorial assistance and Prof. Dr. Rainer Fischer for fruitful discussions. This work was funded in part by the European Research Council Advanced Grant ”Future-Pharma”, proposal number 269110, the Fraunhofer-Zukunftsstiftung (Fraunhofer Future Foundation) and the Fraunhofer-Gesellschaft Internal Programs under Grant No. Attract 125-600164.

Materials

2100P Portable Turbidimeter Hach 4650000 Turbidimeter
2G12 antibody Polymun AB002 Reference antibody
Biacore T200 GE Healthcare 28-9750-01 SPR device
BP-410 Furh 2632410001 Bag filter
Catiofast VSH BASF 79002360 Flocculating agent
Centrifuge 5415D Eppendorf 5424 000.410 Centrifuge
Centrifuge tube 15 mL Labomedic 2017106 Reaction tube
Centrifuge tube 50 mL self-standing Labomedic 1110504 Reaction tube
Chitosan Carl Roth GmbH 5375.1 Flocculating agent
Design-Expert(R) 8 Stat-Ease, Inc. n.a. DoE software
Disodium phosphate Carl Roth GmbH  4984.3  Media component
Ferty 2 Mega Kammlott 5.220072 Fertilizer
Forma -86C ULT freezer ThermoFisher 88400 Freezer
Greenhouse n.a. n.a. For plant cultivation
Grodan Rockwool Cubes 10x10cm Grodan 102446 Rockwool block
HEPES Carl Roth GmbH 9105.3 Media component
K700P 60D Pall 5302305 Depth filter layer
KS50P 60D Pall B12486 Depth filter layer
Miracloth Labomedic 475855-1R Filter cloth
MultiLine Multi 3410 IDS WTW WTW_2020 pH meter / conductivity meter
Osram cool white 36 W Osram 4930440 Light source
Phytotron Ilka Zell n.a. For plant cultivation
Polymin P BASF 79002360 Flocculating agent
POLYTRON PT 6100 D Kinematica 11010110 Homogenization device with custom blade tool
Protein A Life technologies 10-1006 Antibody binding protein
Sodium chloride Carl Roth GmbH P029.2 Media component
Synergy HT BioTek SIAFRT Fluorescence plate reader
TRIS Carl Roth GmbH 4855.3 Media component
Tween-20 Carl Roth GmbH 9127.3 Media component
VelaPad 60 Pall VP60G03KNH4 Filter housing
Zetasizer Nano ZS Malvern ZEN3600 DLS particle size distribution measurement

Referências

  1. Godfray, H. C. J., et al. Food Security: The Challenge of Feeding 9 Billion People. Science. 327, 812-818 (2010).
  2. Fischer, R., Schillberg, S., Buyel, J. F., Twyman, R. M. Commercial aspects of pharmaceutical protein production in plants. Curr. Pharm. Des. 19, 5471-5477 (2013).
  3. Pastores, G. M., et al. A Phase 3, multicenter, open-label, switchover trial to assess the safety and efficacy of taliglucerase alfa, a plant cell-expressed recombinant human glucocerebrosidase, in adult and pediatric patients with Gaucher disease previously treated with imiglucerase. Blood Cells Mol. Dis. 53, 253-260 (2014).
  4. De Paepe, D., et al. A comparative study between spiral-filter press and belt press implemented in a cloudy apple juice production process. Food Chem. 173, 986-996 (2015).
  5. Buyel, J. F., Twyman, R. M., Fischer, R. Extraction and downstream processing of plant-derived recombinant proteins. Biotechnol. Adv. 33, 902-913 (2015).
  6. Wilken, L. R., Nikolov, Z. L. Recovery and purification of plant-made recombinant proteins. Biotechnol. Adv. 30, 419-433 (2012).
  7. Buyel, J. F. Process development trategies in plant molecular farming. Curr. Pharm. Biotechnol. 16, 966-982 (2015).
  8. Hassan, S., Keshavarz-Moore, E., Ma, J., Thomas, C. Breakage of transgenic tobacco roots for monoclonal antibody release in an ultra-scale down shearing device. Biotechnol. Bioeng. 111, 196-201 (2014).
  9. Hassan, S., van Dolleweerd, C. J., Ioakeimidis, F., Keshavarz-Moore, E., Ma, J. K. Considerations for extraction of monoclonal antibodies targeted to different subcellular compartments in transgenic tobacco plants. Plant Biotechnol. J. 6, 733-748 (2008).
  10. Buyel, J. F., Fischer, R. Scale-down models to optimize a filter train for the downstream purification of recombinant pharmaceutical proteins produced in tobacco leaves. Biotechnol. J. 9, 415-425 (2014).
  11. Buyel, J. F., Fischer, R. Downstream processing of biopharmaceutical proteins produced in plants: the pros and cons of flocculants. Bioengineered. 5, 138-142 (2014).
  12. Gregory, J., Barany, S. Adsorption and flocculation by polymers and polymer mixtures. Adv. Colloid Interface Sci. 169, 1-12 (2011).
  13. Zhou, Y., Franks, G. V. Flocculation mechanism induced by cationic polymers investigated by light scattering. Langmuir. 22, 6775-6786 (2006).
  14. Runkana, V., Somasundaran, P., Kapur, P. C. Mathematical modeling of polymer-induced flocculation by charge neutralization. J. Colloid Interface Sci. 270, 347-358 (2004).
  15. Hjorth, M., Jorgensen, B. U. Polymer flocculation mechanism in animal slurry established by charge neutralization. Water Res. 46, 1045-1051 (2012).
  16. Buyel, J. F., Fischer, R. Flocculation increases the efficacy of depth filtration during the downstream processing of recombinant pharmaceutical proteins produced in tobacco. Plant Biotechnol. J. 12, 240-252 (2014).
  17. Buyel, J. F., Opdensteinen, P., Fischer, R. Cellulose-based filter aids increase the capacity of depth filters during the downstream processing of plant-derived biopharmaceutical proteins. Biotechnol. J. 10, 584-591 (2014).
  18. Yasarla, L. R., Ramarao, B. V. Dynamics of Flocculation of Lignocellulosic Hydrolyzates by Polymers. Ind. Eng. Chem. Res. 51, 6847-6861 (2012).
  19. Montgomery, D. C. . Design and Analysis of Experiments. , (2007).
  20. Buyel, J. F., Fischer, R. Characterization of complex systems using the design of experiments approach: transient protein expression in tobacco as a case study. J. Vis. Exp. , e51216 (2014).
  21. Espuny Garcia Del Real, G., Davies, J., Bracewell, D. G. Scale-down characterization of post-centrifuge flocculation processes for high-throughput process development. Biotechnol. Bioeng. 111, 2486-2498 (2014).
  22. Rathore, A. S., Sofer, G. . Process Validation in Manufacturing of Biopharmaceuticals, 3rd edn, Vol. 1. , (2012).
  23. Kang, Y., et al. Development of a Novel and Efficient Cell Culture Flocculation Process Using a Stimulus Responsive Polymer to Streamline Antibody Purification Processes. Biotechnol. Bioeng. 110, 2928-2937 (2013).
  24. Menkhaus, T. J., Eriksson, S. U., Whitson, P. B., Glatz, C. E. Host selection as a downstream strategy: Polyelectrolyte precipitation of beta-glucuronidase from plant extracts. Biotechnol. Bioeng. 77, 148-154 (2002).
  25. Holler, C., Vaughan, D., Zhang, C. M. Polyethyleneimine precipitation versus anion exchange chromatography in fractionating recombinant beta-glucuronidase from transgenic tobacco extract. J. Chromatogr. A. 1142, 98-105 (2007).
  26. Buyel, J. F., Fischer, R. Synthetic polymers are more effective than natural flocculants for the clarification of tobacco leaf extracts. J. Biotechnol. 195, 37-42 (2014).
  27. Pearson, C. R., Heng, M., Gebert, M., Glatz, C. E. Zeta potential as a measure of polyelectrolyte flocculation and the effect of polymer dosing conditions on cell removal from fermentation broth. Biotechnol. Bioeng. 87, 54-60 (2004).
  28. Buyel, J. F., Gruchow, H. M., Boes, A., Fischer, R. Rational design of a host cell protein heat precipitation step simplifies the subsequent purification of recombinant proteins from tobacco. Biochem. Eng. J. 88, 162-170 (2014).
  29. Wang, S., Liu, C., Li, Q. Impact of polymer flocculants on coagulation-microfiltration of surface water. Water Res. 47, 4538-4546 (2013).
  30. Menkhaus, T. J., Anderson, J., Lane, S., Waddell, E. Polyelectrolyte flocculation of grain stillage for improved clarification and water recovery within bioethanol production facilities. Bioresour. Technol. 101, 2280-2286 (2010).
  31. Mune, M. A. M., Minka, S. R., Mbome, I. L. Optimising functional properties during preparation of cowpea protein concentrate. Food Chem. 154, 32-37 (2014).
  32. Buyel, J. F., Fischer, R. Predictive models for transient protein expression in tobacco (Nicotiana tabacum L.) can optimize process time, yield, and downstream costs. Biotechnol. Bioeng. 109, 2575-2588 (2012).
  33. Buyel, J. F., Kaever, T., Buyel, J. J., Fischer, R. Predictive models for the accumulation of a fluorescent marker protein in tobacco leaves according to the promoter/5’UTR combination. Biotechnol. Bioeng. 110, 471-482 (2013).
  34. Buyel, J. F., Fischer, R. A juice extractor can simplify the downstream processing of plant-derived biopharmaceutical proteins compared to blade-based homogenizers. Process Biochem. 50, 859-866 (2014).
  35. Anderson, M. J., Whitcomb, P. J. . DOE Simplified: Practical Tools for Effective Experimentation. Vol. 1. 1, (2000).
  36. Anderson, M. J., Whitcomb, P. J. . Response Surface Methods Simplified. , (2005).
  37. Buyel, J. F., Fischer, R. Generic chromatography-based purification strategies accelerate the development of downstream processes for biopharmaceutical proteins produced in plants. Biotechnol. J. 9, 566-577 (2014).
  38. Myers, R. H., Montgomery, D. C., Anderson-Cook, C. M. . Response Surface Methodology: Process and Product Optimization Using Designed Experiments. , (2009).
check_url/pt/53940?article_type=t

Play Video

Citar este artigo
Buyel, J. F. Procedure to Evaluate the Efficiency of Flocculants for the Removal of Dispersed Particles from Plant Extracts. J. Vis. Exp. (110), e53940, doi:10.3791/53940 (2016).

View Video