这份手稿介绍如何筛选thermostabilizing突变,净化人的羟色胺转运,产生高亲和力的抗体,并结晶势必抗抑郁药物小号 -citalopram羟色胺转运-抗体复合物。该协议可以适于其他具有挑战性的膜转运,受体和通道的研究。
羟色胺转运是钠和氯偶联转运的“泵”外血清素进入细胞:S -citalopram是用于通过结合具有高亲和力的羟色胺转运,阻断血清素再摄取来治疗抑郁症和焦虑症的药物。在这里,我们报告一个有效的程序和一套工具,以稳定,快速,纯化和结晶势必给S -citalopram和其他抗抑郁药羟色胺转运-抗体复合物。其中稳定羟色胺转运突变使用S -citalopram结合分析鉴定。在杆状病毒转导HEK293S GnTI表示羟色胺转运–细胞,被改组为脂酶和用于提高高亲和力的抗体。我们已经制定了一项战略,以发现对于结构研究的抗体。抗体片段在昆虫细胞中表达的直接方法也已确立。使用这种方法纯化运输车-抗体复合物的乖巧和容易结晶,产生带有S -citalopram的衍射X射线,以3-4的分辨率配合。这里开发的策略可以被用来确定其他具有挑战性的膜蛋白的结构。
血清素转运蛋白(SERT)是有助于羟色胺的穿过细胞膜1传送一个完整的膜蛋白。 SERT属于家庭神经递质钠Symporters(NSSS),其中还包括多巴胺和去甲肾上腺素转运2。 SERT是广泛的处方抗抑郁和抗焦虑药,其作用是竞争性抑制血清素转运3的分子靶点。 SERT利用钠的积极有利的协同转运从突触间隙去除神经递质。血清素系统的广泛的表征已经表明,血清素代谢的变化看起来几乎影响所有神经过程,包括情绪,睡眠,疼痛,认知和攻击行为4。 SERT功能可以通过使用,比如s -citalopram,抗抑郁药和选择性血清素再摄取抑制剂(SSRIs),以及由psychostimula修改NTS和吸毒成瘾的药物,如安非他明和3,4-亚甲ñ-methylamphetamine或“摇头丸”1,2。
SSRIs的是心境障碍的治疗极为重要的,但对于其作用的确切结构基础还不是很清楚。 WT SERT是在去污剂胶束不稳定,因此妨碍朝SERT 5,6的三维(3D)结构的进展。最近,我们开发这是鲁棒稳定在广泛的洗涤剂和保留SSRI结合活性6 SERT的变体。这些热稳定的SERT变体使用基于邻近闪烁热稳定性测定法中选择。在这里,我们描述了可结合SERT高亲和力抗体的产生的方法,以及热稳定SERT的纯化和结晶,在用抗体和S -citalopram复杂。
这个协议假定SERT和8B6基因已经全成ý分别克隆入BacMam 7和昆虫表达载体。为了产生抗体,编码cDNA残WT SERT的73-616克隆到用C-末端链球菌II标签(SERT IC)的BacMam载体。对于热稳定性屏幕,使用SERT残基73-616具有C末端的GFP,链球菌II和10-His的标签(SERT TC)。在SERT TC背景生成个别的点突变。对于结晶协议中,SERT-GFP融合蛋白与双链球菌[TrpSerHisProGlnPheGluLys(GlyGlyGlySer)2 GlyGlySerAlaTrpSerHisProGlnPheGluLys]和10他的标签中使用,携带耐高温突变体,Y110A,I291A和T439S和表面半胱氨酸C554A,C580A突变和C622A(SERT CC)。凝血酶裂解序列(LVPRGS)也插入在Q76和T618后SERT CC以允许除去的N-和C-末端。编码8B6的Fab的质粒被工程化以表达两个重链和轻与两个单独的多角体蛋白启动子的控制下,GP67的分泌序列的抗体链。所述8B6抗体的重链的C-末端被标记使用8 His标签和被插入重链和标签之间的凝血酶切割位点。
由生物物理技术膜蛋白结构的测定仍然是许多医学显著转运,受体和通道11是一项艰巨的任务。我们在下面分享了约束向S -citalopram人血清素转运蛋白的结构测定制定了详细的专业知识。我们预计,这些方法将是决定在其他构象状态以及其他困难的膜蛋白的结构SERT的结构非常有用。此外,这里所描述的生物化学技术也可以用来研究在洗涤剂纯化SERT和近天然脂质环境的功能。
SERT结晶铰接后的多种工具和技术的发展。首先,在转运热稳定性的改善产生SERT变体是乖巧的继起膜6转运提取各种洗涤剂胶束。二,使用在整个纯化和结晶的高亲和力配体小号 -citalopram进一步改善的稳定性和降低的构象的异质性。第三,允许生产的2周短时间内大量SERT的BacMam表达系统7,促进两个免疫和结晶的发展。最后,发展战略,以选择识别允许的8B6抗体的发现促进SERT抗体复合物秩序井然包装成晶体的3D表位的高亲和力的抗体。
有许多的这往往在整个协议发生的关键步骤和试剂,以及常见的问题。第一,高滴度SERT P2病毒的产生可能是有问题。加入低浓度的P 1病毒的如在本协议中所述生成的P2病毒通常减轻此问题,并在那里在P2病毒滴度是低的情况下,P3病毒可制成全光照G病毒在0.0001的MOI。用滴度小于1×10 8个病毒颗粒的病毒/ mL的不应使用,并且几乎总是导致低蛋白产量。对于表达,HEK293S GnTI –细胞被选择,因为它们缺乏Ñ-acetylglucosaminyltransferase我活性,因此不能合成复合N- -glycans,代替只生产高甘露糖Ñ-glycans。 EndoH的裂解ñ -连接高甘露聚糖的糖基化在胞外环2(EL2)两个网站,留下附着于天冬酰胺的N -acetylglucosamine。 氮消化-连接的糖减少EL2的表面熵这对结晶有可能很重要。对于抗体的产生,所述SERT 集成电路应用于免疫。 GFP是高度免疫原性的12和不应该被用作融合标记来产生抗体,因为它是难以完全通过SEC除去。 SERT的柔性N-和C-末端也没有包含在构建体中,以避免对这些区的抗体。小鼠可以重新构成蛋白质的30微克进行免疫;继续免疫小鼠直到抗体的高血清浓度可以被检测和产生杂交瘤细胞如所述13。一个thermostabilized结构通常是用于免疫接种的最佳选择;如果转运性能良好,并且保留在纯化生物活性,这往往是足以提高抗体。该8B6抗体产生抗WT SERT。结晶,从SEC含有单分散复杂的由FSEC作为判断只有峰值部分应该合并,浓缩。 SERT-8B6晶体生长在一个窄的范围内的条件,并有许多的应采取解决具体涉及SERT晶体生长问题的步骤。 Tris碱用HCl调节不应在贮存溶液中使用,因为这种缓冲器不支持晶体生长;因此它是CRI蒂卡尔改用的Tris用NaOH调节。 SERT晶体生长在聚乙二醇400的窄的浓度范围内,因此,如果晶体不生长或如果观察到许多小晶体,即使在PEG 400浓度的小的增加或减少会被告知。此外,该添加剂6-氨基己酸也被在优化屏幕用于改善成核。的蛋白质的降低率:井溶液也是一个关键的决定因素为晶体生长。降的1.5比 – 2:1,建议,与降比率更接近2:1通常支持较大的三维晶体的生长。最后,使用低轮廓24孔板的也是朝向晶体增长的关键,这大概是由于蒸汽扩散的速率的修饰。
该SPA方法的另一种方法已经发展到屏幕的量稳定的大鼠血清素转运中使用的过滤器结合试验5可卡因结合构象突变。与此相反,对SPA巴SED法允许通过测定SERT的这仍结合配体部分的顺序如下加热步骤。从而,这允许从一个小数目的样本的快速测定熔融温度。 SPA的方法依赖于放射性标记的高亲和性配体的可用性,如果没有配位体是已知的具有亚微摩尔的亲和力结合然后一种替代方法将是必要的。许多其它方法通常用于测量蛋白质稳定性的诸如荧光染料和量热14的结合,但是低通量,均无法直接测量功能或需要大量的蛋白质。如果不能使用了SPA方法,一个可替换的高通量的方法是一种基于FSEC-热稳定性试验15(FSEC-TS),其中样品被加热之后剩余转运的级分的分离。 FSEC-TS是访问色谱行为和低聚状态的有用的方法,是APowerful互补工具,它可以沿着SPA的方法中。
各种常用的蛋白质表达系统的比较也被发现有利于对SERT表达16使用哺乳动物细胞和勿庸置疑,这是有可能为哺乳动物来源的许多蛋白质的情况。我们已经用于表达的方法已被定制为SERT但有可能易于适应。这有利于高水平的表达条件应通过改变表达,温度,病毒浓度和存在的组蛋白脱乙酰酶抑制剂的时候,如丁酸钠仔细鉴别。
我们一般倾向于在温和的长链洗涤剂亲和纯化如C12M连同CHS以复溶之前保留高亲和力配体结合。使用疏水性的吸收重建是一种温和的技术,该技术我们已经发现是有效的几个其他转运和受体。如果这不成功,透析,稀释,或者SEC除去具有高临界胶束浓度洗涤剂可使用17提供的抗原是在这类洗涤剂充分稳定。在没有合适的抗体被发现的情况下,我们几乎总能找到问题是由于功能或抗原变性损失在这种情况下,我们成功地执行新的免疫接种要特别注意蛋白质生物化学。最后,这与高亲和力结合的配体和抗体应当形成用于合理规划结晶实验的基础,并通过采取热变体的优点,人们可以通过改变不同洗涤剂的属性屏幕的条件范围更广。此外,在脂质中间相18结晶或使用bicelles 19应该总是被视为在微胶粒的替代结晶。
这些原理和方法可与一些modifi使用阳离子为许多其他跨膜蛋白这是难以表达,并从其他表达宿主纯化和将成为的高亲和性的药物靶的结构测定是特别有用的。
The authors have nothing to disclose.
We thank D. Cawley for generating monoclonal antibodies. We thank A. Penmatsa and K. Wang for sharing ideas and expertise developed from the dopamine transporter. L. Vaskalis for assistance with figures, H. Owen for help with manuscript preparation and other Gouaux laboratory members for helpful discussions. J.A.C. has support from a Banting postdoctoral fellowship from the Canadian Institutes of Health Research. E.M.G. is supported by the National Science Foundation Graduate Research Fellowship. We are particularly grateful to Bernie and Jennifer LaCroute for their generous support, as well as for funding from the NIH (5R37MH070039). E.G. is an investigator of the Howard Hughes Medical Institute.
DH10Bac | Invitrogen | 10361-012 | |
Kanamycin | Fisher | BP906-5 | |
Gentamicin | Fisher | BP918-1 | |
Tetracycline | Sigma | T-7660 | |
Bluo-gal | Invitrogen | 15519-028 | 5-Bromo-3-indolyl β-D-galactopyranoside |
IPTG | Anatrace | I1003 | |
Miniprep kit | Qiagen | 27106 | |
Cellfectin II | Invitrogen | 10362-100 | Sf9 transfection reagent |
SF9 | ATCC | CRL-1711 | |
Sf-900 III SFM media | Life Technologies | 12658-027 | |
HEK-293S GnTI- | ATCC | CRL-3022 | |
Freestyle 293 media | Life Technologies | 12338-018 | 293 expression media |
Fetal bovine serum | Life Technologies | 0984018DJ | |
Sodium butyrate | Sigma | 303410 | |
S-citalopram | Sigma | E4786 | Anagrade |
n-Dodecyl-?-D-Maltopyranoside | Anatrace | D310 | |
Cholesteryl hemmisuccinate | Sigma | C6013 | |
1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine | Avanti Polar Lipids | 850457P | |
1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine | Avanti Polar Lipids | 850757P | |
1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphoglycerol | Avanti Polar Lipids | 840457P | |
Leupeptin | Sigma | L2884 | |
Pepstatin A | Sigma | P5318 | |
Aprotinin | Sigma | A1153 | |
PMSF | Sigma | P7626 | |
Desthiobiotin | Iba Life Sciences | 2-1000-05 | |
Asolectin | Sigma | 11145 | |
Cholesterol | Sigma | C-8667 | |
Lipid A | Sigma | L5399 | |
Brain polar lipid | Avanti Polar Lipids | 141101C | |
Biobeads | Biorad | 152-3920 | Hydrophobic absorption resin |
Goat anti-mouse IRDye 680RD | Odyssey | 926-68070 | Used as secondary for western blotting |
Lauryl maltose neopentyl glycol | Anatrace | NG310 | Anagrade |
Serotonin | Sigma | H9523 | |
pFastBac 8B6 | Available from authors | ||
pEG Bacmam SERT Strep II | SERTIC, Available from authors | ||
pEG Bacmam SERT GFP twin Strep His | SERTTC, Available from authors | ||
pEG Bacmam SERT ts3 GFP twin Strep His | SERTCC, Available from authors | ||
Imidazole | Sigma | 56749 | |
n-Octyl β-D-maltoside | Anatrace | O310 | Anagrade |
Thrombin | Haematologic Technologies | HCT-0020 | |
EndoH | New England Biolabs | P0702 | |
Trizma-HCl | Sigma | T5941 | Tris used for preparation of crystallization reservoirs |
PEG 400 | Sigma | 91893 | |
6-aminohexanoic acid | Sigma | 7260 | |
Trypsin-EDTA | Fisher | MT25052CV | |
Isoplate-96 TC | PerkinElmer | 6005070 | |
PolyJet | SignaGen | SL100688 | Polymer transfection reagent for mamalian cells |
Copper HIS-Tag YSI SPA Beads | PerkinElmer | RPNQ0096 | His-tag affinity SPA beads |
Citalopram, [N-Methyl-3H] | PerkinElmer | NET1039250UC | |
ThermoMixer C | Eppendorf | 5382000023 | heating block for thermostability assay |
ThermoTop | Eppendorf | 5308000003 | |
SmartBlock PCR 96, thermoblock for PCR plates | Eppendorf | 5306000006 | |
0.2 µm syringe filter | Olympus Plastics | 25-243 | |
1 L filter system | Corning | 430517 | |
2 L flat bottom tissue culture flask | Genemate | F-5909-2000 | |
2 L baffled tissue culture flask | Genemate | F-5909-2000B | |
CO2 incubator | Thermo Scientific | 3950 | |
Forma Orbital Shaker | Thermo Scientific | 416 | |
Strep-Tactin resin | Iba Life Sciences | 2-1208-025 | Strep affinity resin |
Extruder | Northern Lipids | ||
Li-Cor imaging system | Odyssey | western blot imaging system | |
XK16 column | GE Healthcare | 28-9889-37 | column used for Strep-Tactin and Talon purificaiton |
100 kDa MWCO protein concentrator | Millipore | UFC910096 | |
30 kDa MWCO protein concentrator | Millipore | UFC903024 | |
Äkta FPLC | GE Healthcare | UPC-900 | |
HPLC | Shimadzu | 51476 | |
Superose 6 (10/300) column | GE Healthcare | 17-5172-01 | Used for FSEC |
Tangential flow apparatus | Pall Filtron | ||
0.2 µm filter tangential flow cell | Pall Filtron | PSM20C11 | |
30 kDa MWCO tangential flow concentrator | Pall Filtron | OS030T12 | |
Talon resin | Clonetech | 635504 | His-tag affinity resin used for Fab purification |
1 ml HiTrap SP column | GE Healthcare | 17115101 | Cation exchanger used for Fab purification |
Superdex 200 10/300 GL column | GE Healthcare | 17-5175-01 | Used for SEC separation of SERT-8B6 |
24-well VDXm plate | Hampton Research | HR3-306 | |
18 mm coverslips | Hampton Research | HR3-239 | |
Virocyt virus counter | Virocyt | 2100 | |
MicroBeta Trilux | PerkinElmer | 1450 | 96-well scintillation counter |
HiTrap SP column | GE Healthcare | 17115101 | |
Sertraline | Sigma | S6319 |