Summary

Sviluppo di un virus System Reporter dell'epatite B per monitorare la fasi iniziali del ciclo di replicazione

Published: February 01, 2017
doi:

Summary

Qui si descrive un virus dell'epatite B recentemente sviluppato (HBV) sistema reporter per monitorare le prime fasi del ciclo di vita HBV. Questo semplificata nel sistema vitro sarà di aiuto nella proiezione di agenti anti-HBV utilizzando una strategia ad alto rendimento.

Abstract

Currently, it is possible to construct recombinant forms of various viruses, such as human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) and hepatitis C virus (HCV), that carry foreign genes such as a reporter or marker protein in their genomes. These recombinant viruses usually faithfully mimic the life cycle of the original virus in infected cells and exhibit the same host range dependence. The development of a recombinant virus enables the efficient screening of inhibitors and the identification of specific host factors. However, to date the construction of recombinant hepatitis B virus (HBV) has been difficult because of various experimental limitations. The main limitation is the compact genome size of HBV, and a fairly strict genome size that does not exceed 1.3 genome sizes, that must be packaged into virions. Thus, the size of a foreign gene to be inserted should be smaller than 0.4 kb if no deletion of the genome DNA is to be performed. Therefore, to overcome this size limitation, the deletion of some HBV DNA is required. Here, we report the construction of recombinant HBV encoding a reporter gene to monitor the early stage of the HBV replication cycle by replacing part of the HBV core-coding region with the reporter gene by deleting part of the HBV pol coding region. Detection of recombinant HBV infection, monitored by the reporter activity, was highly sensitive and less expensive than detection using the currently available conventional methods to evaluate HBV infection. This system will be useful for a number of applications including high-throughput screening for the identification of anti-HBV inhibitors, host factors and virus-susceptible cells.

Introduction

L'infezione cronica da virus dell'epatite B (HBV) è un importante fattore di rischio per le malattie croniche del fegato 1. Sebbene strategie terapeutiche attuali si basano su analoghi nucleotidici che inibiscono la funzione HBV pol e / o la somministrazione di tipo I interferon che attiva risposte immunitarie negli individui infetti nonché indirettamente sopprimere la proliferazione HBV attraverso funzioni genici stimolati 2, questi trattamenti non possono eliminare HBV DNA completamente 3. Inoltre, l'emergere di HBVs che sono resistenti agli agenti anti-Pol è di preoccupazione 4. La somministrazione di agenti anti-virali combinati rivolti direttamente le varie fasi del virus dell'immunodeficienza umana (HIV) o il ciclo di vita del virus dell'epatite C (HCV) è stato dimostrato che sopprimere o eliminare il virus (es) con successo. Simile a questa idea, lo sviluppo di anti-HBV agent (s) che agiscono direttamente sulle diverse fasi di HBV ciclo di vita è importante per stabilire le future terapie HBV.

In generale, la creazione di un semplice sistema di coltura in vitro del virus destinazione facilita lo sviluppo di agenti anti-virus. Tuttavia, ci sono almeno due ostacoli allo sviluppo di sistemi di coltura in vitro per lo screening agenti anti-HBV. La prima è la mancanza di una comoda vitro sistema di coltura cellulare a HBV / proliferazione. A differenza di altri virus, come l'HIV e HCV, che si propagano in linee cellulari stabilizzate, è difficile da coltivare HBV in vitro a causa delle limitazioni sperimentali compresa una gamma ristretta ospitante. L'uso di sistemi di coltura cellulare specifici quali la linea di cellule di epatoma umano HepaRG, che è suscettibile di infezione da HBV, 5, 6, 7 sono state sviluppate per superare questi problemi. Inoltre, le cellule PXB, isolate da urochinasi-tyPE attivatore del plasminogeno transgenici / topi SCID inoculati con primari epatociti umani (PHH), hanno dimostrato di essere suscettibili di infezione da HBV e la replicazione 8. Tuttavia, i livelli di replicazione dell'HBV in HepaRG dipendono dallo stato differenziazione cellulare dopo la cultura, che può causare risultati incoerenti e non riproducibili su livelli di infezione / replicazione dell'HBV. PXB è comunemente utilizzato per esperimenti di infezione da HBV, ma è limitata dalla sua disponibilità. Una linea di cellule espressione inducibile HBV tetraciclina, HepAD38, è stato ampiamente utilizzato per studiare la replicazione dell'HBV, ma questo sistema consente solo di valutazione dopo la trascrizione e non al passo ingresso di infezione da HBV 9. Recentemente, l'identificazione di sodio taurocolato cotransporting polipeptide (NTCP) come un recettore funzionale per HBV ha consentito lo sviluppo di un sistema di coltura variabile di HBV 10. In effetti, l'espressione NTCP in cellule di epatocarcinoma non sensibili, come Huh7 eHepG2 consente HBV 10 e, quindi, la scelta delle linee cellulari sensibili HBV è stata ampliata, risolvere molti dei limiti sperimentali. Il secondo problema è la mancanza di un semplice sistema di test per valutare HBV e la replicazione. Valutazione della HBV è solitamente condotta analizzando HBV DNA, RNA e proteine. Tuttavia, la quantificazione di questi marcatori virali è che richiede tempo, spesso costosi e non sempre semplice. Pertanto, lo sviluppo di un semplice sistema di analisi, ad esempio utilizzando un gene reporter, potrebbe superare i problemi associati ai sistemi di dosaggio HBV.

Tuttavia, poiché la dimensione del genoma che può essere confezionato in un capside HBV è limitata – meno di 3,7 kb 11 – la dimensione di un gene reporter deve essere il più breve possibile. Inoltre, la presenza di più elementi cis sparsi in tutto il genoma, che sono essenziali per la replicazione virale, limita le posizioni disponibili dal serimento del gene reporter nel genoma. Diversi studi hanno tentato di inserire geni estranei, compreso l'HIV-1 Tat, proteina fluorescente verde e DsRed, in HBV genoma 11, 12, 13. Tuttavia, questi HBVs ricombinanti non sono utili per lo screening HBV / replica, o per l'high-throughput screening dei fattori che influenzano l'infezione da HBV / replica. Questo è principalmente a causa della bassa produttività dei virus ricombinanti e la ridotta intensità di espressione del gene reporter causato dalla produzione di virus inefficiente.

Per superare questi problemi, abbiamo costruito un HBV giornalista con un alto rendimento di produzione di virus. Questo virus è altamente sensibile per monitorare le prime fasi del ciclo di replicazione dell'HBV, dall'entrata alla trascrizione. Per raggiungere questo obiettivo, NanoLuc (NL) è stato scelto come gene marcatore perché è un piccolo (171 amminoacidi) progettati giornalista luminescenticlass = "xref"> 14. Inoltre, NL è di circa 150 volte più luminoso di lucciola o Renilla luciferasi, e la reazione luminescenti è ATP-indipendenti, il che suggerisce che il tasso di successo falso sarà basso per lo screening ad alto rendimento. L'efficienza produttiva del HBV ricombinante è pari a circa 1/5 del genitore HBV, e simile a livelli riportati per precedenti virus ricombinanti HBV; tuttavia, la luminosità NL supera problemi di produttività virus in modo che possa essere utilizzato per lo screening di massa di agenti anti-HBV.

Proiezione di agenti anti-HBV utilizzando epatociti primari, HepaRG, HepAD38 e epatociti NTCP-trasdotte potrebbe essere utile per lo screening di agenti anti-HBV con il metodo convenzionale (s). Tuttavia, il sistema qui descritto presenta diversi vantaggi, quali una semplice manipolazione, ad alta sensibilità e basso costo per lo screening. Questi vantaggi sono adatti per dosaggi elevati di throughput per lo sviluppo e identificare nuovi agenti HBV per scopi terapeutici.

Protocol

1. Produzione di ricombinante HBV codifica per la proteina Reporter Preparazione delle cellule HepG2 Preparare terreno di coltura cellulare (mezzo di Dulbecco modificato Eagle (DMEM) supplementato con 10% siero bovino fetale (FBS), 100 U / ml di penicillina, 100 ug / ml di streptomicina e 100 ml aminoacidi U / non essenziali). Piastra 4 x 10 6 cellule HepG2 in 10 cm Piatto collagene rivestite in 10 ml di mezzo di coltura il giorno prima della transfezione. Incuba…

Representative Results

La figura 1 mostra uno schema del genoma HBV, RNA trascritti, proteine del virus e la cui regione codificante sul genoma. Il gene reporter e la sua posizione nel genoma sono anche indicati. La Figura 2 mostra l'HBV plasmide reporter e helper plasmide contenente il gene reporter. Il reporter pUC1.2HBV / NL è stato costruito eliminando posizioni nucleotidiche 223-811 dal sito inizio della trascrizione del mRNA precore di pUC1.2HBV 16…

Discussion

Il genoma HBV ha quattro principali fasi di lettura aperti (ORF), tra cui il nucleo, polimerasi, di superficie e X ORF (Figura 1). Trascrizione di questi quattro HBV ORF è strettamente regolata da quattro promotori: il promotore precore / core contenenti enhancer II, S1 promotore, promotrice S2 e X promotore contenente enhancer I 18. I 3,5 kb e 3,4 kb mRNA sono tradotti in precore e Core proteine, rispettivamente. La grande proteina busta (L) è prodotto dal più grande mRNA sub…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

This work was supported in part by the Research Program on Hepatitis from Japan Agency for Medical Research and Development (AMED) and by Grants-in-Aids for Scientific Research from the Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (MEXT) of Japan.

Materials

Nano-Glo Luciferase Assay Regent Promega N1110
Penicillin-Streptomycin Mixed Solution Nacalai tesque 09367-34 
MEM Non-Essential Amino Acids Solution Thermo Fisher Scientific 11140050
DMEM Thermo Fisher Scientific 11995065
Opti-MEM I Reduced Serum Medium Thermo Fisher Scientific 31985070
100 mm/collagen-coated dish Iwaki 4020-010
Lipofectamine 3000 Transfection Reagent Thermo Fisher Scientific L3000001 
Polyethylene glycol (PEG) 6000  Sigma-Aldrich 81255
Polyethylene glycol (PEG) 8000  Sigma-Aldrich 89510
NaCl Nacalai tesque 31319-45 
0.5 mol/l-EDTA Solution Nacalai tesque 06894-14 
Tris-HCl Nacalai tesque 35434-21
Millex-HP, 0.45 μm, polyethethersulfone, filter Merck Millipore SLHP033RS
Dimethyl sulfoxide (DMSO) Sigma-Aldrich D2650
Collagen coated 96-well plate Corning NO3585
Passive Lysis 5xBuffer Promega E1941
GloMax 96 Microplate Luminometer Promega E6501
Sucrose Nacalai tesque 30403-55
Luminometer plate Greiner bio-one 655075
HepG2-NTCP1-myc-clone22 Reference 15
pUC1.2HBV delta epsilon Reference 15
pUC1.2HBV/NL Reference 15
50 ml tube Violamo 1-3500-02
Anti-Myc antibody Sigma-Aldrich C3956
HBIG Japan Blood Products Organization
IFN-β Mochida Pharmaceutical 14987224005413
Heparin Sigma-Aldrich H3393

Referências

  1. Fattovich, G., Stroffolini, T., Zagni, I., Donato, F. Hepatocellular carcinoma in cirrhosis: incidence and risk factors. Gastroenterology. 127 (5), 35-50 (2004).
  2. Revill, P., Testoni, B., Locarnini, S., Zoulim, F. Global strategies are required to cure and eliminate HBV infection. Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol. 13 (4), 239-248 (2016).
  3. Wursthorn, K., et al. Peginterferon alpha-2b plus adefovir induce strong cccDNA decline and HBsAg reduction in patients with chronic hepatitis B. Hepatology. 44 (3), 675-684 (2006).
  4. Stuyver, L. J., et al. Nomenclature for antiviral-resistant human hepatitis B virus mutations in the polymerase region. Hepatology. 33 (3), 751-757 (2001).
  5. Ochiya, T., Tsurimoto, T., Ueda, K., Okubo, K., Shiozawa, M., Matsubara, K. An in vitro system for infection with hepatitis B virus that uses primary human fetal hepatocytes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (6), 1875-1879 (1989).
  6. Galle, P. R., Hagelstein, J., Kommerell, B., Volkmann, M., Schranz, P., Zentgraf, H. In vitro experimental infection of primary human hepatocytes with hepatitis B virus. Gastroenterology. 106 (3), 664-673 (1994).
  7. Gripon, P., et al. Infection of a human hepatoma cell line by hepatitis B virus. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (24), 15655-15660 (2002).
  8. Murakami, Y., et al. Discovering novel direct acting antiviral agents for HBV using in silico screening. Biochem. Biophys. Res. Commun. 456 (1), 20-28 (2015).
  9. Ladner, S. K., et al. Inducible expression of human hepatitis B virus (HBV) in stably transfected hepatoblastoma cells: a novel system for screening potential inhibitors of HBV replication. Antimicrob. Agents. Chemother. 41 (8), 1715-1720 (1997).
  10. Yan, H., et al. Sodium taurocholate cotransporting polypeptide is a functional receptor for human hepatitis B and D virus. Elife. 3, (2012).
  11. Wang, Z., et al. Replication-competent infectious hepatitis B virus vectors carrying substantially sized transgenes by redesigned viral polymerase translation. PLoS. One. 8, 60306 (2013).
  12. Chaisomchit, S., Tyrrell, D. L., Chang, L. J. Development of replicative and nonreplicative hepatitis B virus vectors. Gene. Ther. 4 (12), 1330-1340 (1997).
  13. Hong, R., et al. Novel recombinant hepatitis B virus vectors efficiently deliver protein and RNA encoding genes into primary hepatocytes. J. Virol. 87 (12), 6615-6624 (2013).
  14. Hall, M. P., et al. Engineered luciferase reporter from a deep sea shrimp utilizing a novel imidazopyrazinone substrate. ACS. Chem. Biol. 7 (11), 1848-1857 (2012).
  15. Nishitsuji, H., et al. Novel reporter system to monitor early stages of the hepatitis B virus life cycle. Cancer. Sci. 106 (11), 1616-1624 (2015).
  16. Sugiyama, M., et al. Influence of hepatitis B virus genotypes on the intra- and extracellular expression of viral DNA and antigens. Hepatology. 44 (4), 915-924 (2006).
  17. Seeger, C., Zoulim, F., Mason, W., Knipe, D., Howley, P. Hepadnaviruses. Field Virology. Volume 1. , 2185-2221 (2013).
  18. Moolla, N., Kew, M., Arbuthnot, P. Regulatory elements of hepatitis B virus transcription. J. Viral. Hepat. 9 (5), 323-331 (2002).
  19. Cattaneo, R., Will, H., Schaller, H. Hepatitis B virus transcription in the infected liver. EMBO. J. 3 (9), 2191-2196 (1984).
  20. Enders, G. H., Ganem, D., Varmus, H. Mapping the major transcripts of ground squirrel hepatitis virus: the presumptive template for reverse transcriptase is terminally redundant. Cell. 42 (1), 297-308 (1985).
  21. Haines, K. M., Loeb, D. D. The sequence of the RNA primer and the DNA template influence the initiation of plus-strand DNA synthesis in hepatitis B virus. J. Mol. Biol. 370 (3), 471-480 (2007).
  22. Hirsch, R. C., Lavine, J. E., Chang, L. J., Varmus, H. E., Ganem, D. Polymerase gene products of hepatitis B viruses are required for genomic RNA packaging as well as for reverse transcription. Nature. 344 (6266), 552-555 (1990).
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Citar este artigo
Nishitsuji, H., Yamamoto, H., Shiina, R., Harada, K., Ujino, S., Shimotohno, K. Development of a Hepatitis B Virus Reporter System to Monitor the Early Stages of the Replication Cycle. J. Vis. Exp. (120), e54849, doi:10.3791/54849 (2017).

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