Quantifying cell division and expansion is of crucial importance to the understanding of whole-plant growth. Here, we present a protocol to calculate cellular parameters determining maize leaf growth rates and highlight the use of these data for investigating molecular growth regulatory mechanisms by directing developmental stage-specific sampling strategies.
Growth analyses are often used in plant science to investigate contrasting genotypes and the effect of environmental conditions. The cellular aspect of these analyses is of crucial importance, because growth is driven by cell division and cell elongation. Kinematic analysis represents a methodology to quantify these two processes. Moreover, this technique is easy to use in non-specialized laboratories. Here, we present a protocol for performing a kinematic analysis in monocotyledonous maize (Zea mays) leaves. Two aspects are presented: (1) the quantification of cell division and expansion parameters, and (2) the determination of the location of the developmental zones. This could serve as a basis for sampling design and/or could be useful for data interpretation of biochemical and molecular measurements with high spatial resolution in the leaf growth zone. The growth zone of maize leaves is harvested during steady-state growth. Individual leaves are used for meristem length determination using a DAPI stain and cell-length profiles using DIC microscopy. The protocol is suited for emerged monocotyledonous leaves harvested during steady-state growth, with growth zones spanning at least several centimeters. To improve the understanding of plant growth regulation, data on growth and molecular studies must be combined. Therefore, an important advantage of kinematic analysis is the possibility to correlate changes at the molecular level to well-defined stages of cellular development. Furthermore, it allows for a more focused sampling of specified developmental stages, which is useful in case of limited budget or time.
Tillväxtanalys beror på en uppsättning verktyg som ofta används av växtvetenskapsmän att beskriva genotyp bestäms tillväxtskillnader och / eller fenotypiska svar på miljöfaktorer. De inkluderar storlek och vikt mätningar av hela anläggningen eller ett organ och beräkningar av tillväxttakten för att utforska de bakomliggande mekanismerna för tillväxt. Organtillväxt bestäms genom celldelning och expansion på cellnivå. Därför, inklusive kvantifiering av dessa två processer i tillväxtanalyser är nyckeln till att förstå skillnader i tillväxt hela organ en. Därför är det viktigt att ha en lämplig metod för att bestämma celltillväxtparametrar som är relativt lätt att använda av icke-specialiserade laboratorier.
Kinematisk analys har redan etablerat sig som en metod som ger en kraftfull ram för utvecklingen av tillväxtorgan modeller 2. Tekniken har optimerats för linjära system,såsom Arabidopsis thaliana rötter och monokotyledona bladen, men även för icke-linjära system, såsom tvåhjärtbladiga blad 3. Numera är denna metod alltmer används för att studera hur genetiska, hormonella, utvecklings och miljöfaktorer påverkar celldelning och expansion i olika organ (Tabell 1). Dessutom ger det också en ram för att koppla cellulära processer för att de underliggande biokemiska, molekylära och fysiologiska föreskrifter (tabell 2), även om begränsningar kan införas av organstorlek och spatial organisation för tekniker som kräver större mängder av växtmaterial (t.ex. metabolit mätningar, proteomik, etc.).
Monokotyledona blad, såsom majs (Zea mays) blad, representerar linjära system i vilka celler rör sig från basen av bladet mot spetsen, i följd passerar genom meristem och töjning zonen för att nå den mognazon. Detta gör den till en idealisk modellsystem för kvantitativa studier av de rumsliga mönster för tillväxt 4. Dessutom lämnar majs har stora tillväxtzoner (meristem och töjning zon som sträcker sig över flera centimeter 5) och ge möjligheter till studier på andra nivåer i organisationen. Detta gör det möjligt för undersökningen av (förmodade) reglerande mekanismer som styr celldelning och expansion, kvantifieras genom kinematisk analys genom en rad molekylära tekniker, fysiologiska mätningar, och cellbiologiska metoder (tabell 2).
Här ger vi ett protokoll för att utföra en kinematisk analys i monokotyledona blad. Först förklarar vi hur man genomför en ordentlig analys av både celldelning och cellförlängning som en funktion av läget utmed bladet axeln och hur man kan beräkna kinematiska parametrar. För det andra, visar vi också hur detta kan användas som en grund för provtagningsdesign. Här diskuterar vi två fall: hög upplösning provtagning end fokuserad provtagning, vilket möjliggör förbättrad tolkning av data och spara tid / pengar, respektive.
Tabell 1. Översikt över kinematisk analyserar metoder för kvantifiering av celldelning och expansion i olika organ.
organ | referens |
monokotyledona blad | 16, 20, 21, 22 |
rotspetsar | 2, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 |
tvåhjärtbladiga blad | 21, 30, 31 |
skjuta apikala meristem | 32 |
Tabell 1. Översikt över kinematisk analyserar metoder för kvantifiering av celldelning och expansion i olika organ.
<p class="jove_content" fo:keep-together.within-page = "1">Tabell 2. Samband mellan cellulära processer kvantifieras genom den kinematiska analys deras reglering på molekylär nivå. Hänvisningar till olika studier som anknyter kvantifiering av cellulära processer till resultat från biokemiska och molekylära analyser i olika arter och organ. Xyloglukan endotransglucosylase (XET), malondialdehyd (MDA), cyklinberoende kinaser (CDK). Klicka här för att se en större version av denna tabell.
En fullständig kinematisk analys på blad majs möjliggör fastställandet av den cellulära grund av bladtillväxt och gör det möjligt att utformningen av effektiva strategier för provtagning. Även om protokollet är relativt enkelt, är viss försiktighet rekommenderas i följande kritiska steg: (1) Det är viktigt att ta bort de yngre, slutna blad (steg 2,3) utan att skada meristem, eftersom meristem längdbestämning (steg 3) kräver den fullständiga meristem att närvara. Lite övning i förväg kan behövas….
The authors have nothing to disclose.
Detta arbete stöddes av en PhD stipendium från universitetet i Antwerpen till VA; en PhD stipendium från den flamländska Science Foundation (FWO, 11ZI916N) till KS; projektbidrag från FWO (G0D0514N); en samordnad forskningsaktivitet (GOA) forskningsanslag, "A systembiologi strategi från Leaf Morfogenes" från forskningsrådet vid universitetet i Antwerpen, och Interuniversitets sevärdhet polacker (IUAP VII / 29 MARS), "Majs och Arabidopsis rot- och skott tillväxt" från den belgiska federala forskningspolitiska Office (BELSPO) till GTSB Han Åsard, Bulelani L. Sizani och Hamada AbdElgawad bidrog till video .
Pots | Any | Any | We use pots with the following measueres, but can be different depending on the treatment/study : bottom diameter: 11cm, opening diameter: 15 cm, height: 12 cm. We grow one maize plant per pot. |
Planting substrate | Any | Any | We use potting medium (Jiffy, The Netherlands), but other substrates can be used, depending on treatment/study. |
Ruler | Any | Any | An extension ruler that covers at least 1,5 meters is needed to measure the final leaf length of the plants. |
Seeds | Any | NA | Seeds can be ordered from a breeder. |
Scalpel | Any | Any | The scalpel is used during leaf harvesting to detach the leaf of interest from its surrounding leaves and right after harvesting to cut a proper sample for cell length and meristem length measurements. |
15 ml falcon tubes | Any | Any | The 15 ml falcon tubes are used for storing samples used for cell length measurements during sample clearing with absolute ethanol and lactic acid. |
Eppendorf tubes | Any | Any | The eppendorf tubes are used for storing samples used for meristem length measurements in ethanol:acetic acid 3:1 (v:v) solution. |
Gloves | Any | Any | Latex gloves, which protect against corrosive reagents. |
Acetic acid | Any | Any | CAUTION: Corrosive to metals, category 1 Skin corrosion, categories 1A,1B,1C Serious eye damage, category 1; Flammable liquids, categories 1,2,3 |
Absolute ethanol | Any | Any | CAUTION: Hazardous in case of skin contact (irritant), of eye contact (irritant), of inhalation. Slightly hazardous in case of skin contact (permeator), of ingestion |
Lactic acid >98% | Any | Any | CAUTION: Corrosive to metals, category 1 Skin corrosion, categories 1A,1B,1C Serious eye damage, category 1 |
Sodium chloride (NaCl) | Any | Any | |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Any | Any | CAUTION: Acute toxicity (oral, dermal, inhalation), category 4 Skin irritation, category 2 Eye irritation, category 2 Skin sensitisation, category 1 Specific Target Organ Toxicity – Single exposure, category 3 |
Tris(hydroxymethyl)aminomethane hydrochloride (Tris-HCl) | Any | Any | This material can be an irritant, contact with eyes and skin should be avoided. Inhalation of dust may be irritating to the respiratory tract. |
4′,6-Diamidine-2′-phenylindole dihydrochloride (DAPI) | Any | Any | Cell permeable fluorescent minor groove-binding probe for DNA. Causes skin irritation. May cause an allergic skin reaction. May cause respiratory irritation. |
Ice | Any | NA | The DAPI solution has to be kept on ice. |
Fluorescent microscope | AxioScope A1, Axiocam ICm1 from Zeiss or other | Any fluorescent microscope can be used for determining meristem length. | |
Microscopic slide | Any | Any | |
Cover glass | Any | Any | |
Tweezers | Any | Any | Tweezers are needed for unfolding the rolled maize leaf right after harvesting in order to cut a proper sample for cell length and meristem length measurements. |
Image-analysis software | Axiovision (Release 4.8) from Zeiss | NA | The software can be downloaded at: http://www.zeiss.com/microscopy/en_de/downloads/axiovision.html. Other softwares such as ImageJ (https://imagej.nih.gov/ij/) could be used as well. |
Microscope equipped with DIC | AxioScope A1, Axiocam ICm1 from Zeiss or other | Any microscope, equipped with differential interference contrast (DIC) can be used to measure cell lengths. | |
R statistical analysis software | R Foundation for Statistical Computing | NA | Open source; Could be downloaded at https://www.r-project.org/ |
R script | NA | NA | We use the kernel smoothing function locpoly of the Kern Smooth package (Wand MP, Jones MC. Kernel Smoothing: Chapman & Hall/CRC (1995)). The script is available for Mac and Windows upon inquire with the corresponding author. We have versions for Mac and Windows. |