Summary

Laboratoriemetoder som används för att upprätthålla och differentiera biotyper av<em> Vibrio cholerae</em> Kliniska och miljömässiga isoleringar

Published: May 30, 2017
doi:

Summary

Detta manuskript beskriver lämpliga Vibrio cholerae underhållstekniker utöver en rad biokemiska analyser, som tillsammans används för snabb och tillförlitlig differentiering mellan kliniska och miljömässiga V. Kolerae biotyper i en laboratorieinställning.

Abstract

Den vattenlevande Gram-negativa bakterien Vibrio cholerae är det etiologiska medlet av den smittsamma gastrointestinala sjukdomscholera. På grund av den globala förekomsten och svårighetsgraden av denna sjukdom, V. Kolerae har studerats omfattande i både miljö- och laboratorieinställningar, vilket kräver korrekt underhåll och odlingsteknik. Klassisk och El Tor är två huvudbiotyper som komponerar V. Kolerae O1-serogruppen, vilka uppvisar unika genotypiska och fenotypiska egenskaper som ger tillförlitliga mekanismer för biotypkarakterisering och kräver distinkta virulensinducerande odlingsbetingelser. Oavsett biotypen av orsaksspänningen för någon given infektion eller utbrott, inbegriper standardbehandlingen av sjukdomen rehydreringsterapi kompletterad med en antibiotikabehandling. Biotypklassificering kan emellertid vara nödvändig för laboratorieundersökningar och kan ha större effekter på det biomedicinska området.I början av 2000 identifierades kliniska isolat som uppvisade genotypiska och fenotypiska egenskaper från både klassiska och El Tor-biotyper. De nyligen identifierade hybriderna, benämnda El Tor-varianter, har orsakat biotypidentifiering av klinisk och miljöisolat att bli mer komplex än tidigare traditionella analysanalyser för enkel analys. Förutom att beskriva V. Cholerae generella underhålls- och odlingsmetoder beskriver detta manus en serie genspecifika (ctxB- och tcpA) PCR-baserade genetiska skärmar och fenotypiska analyser (polymyxin B-resistens, citratmetabolism, proteolytisk aktivitet, hemolytisk aktivitet, motilitet och glukosmetabolism via Voges- Proskauer-analys) kollektivt används för att karakterisera och / eller skilja mellan klassiska och El Tor-biotyper. Tillsammans ger dessa analyser ett effektivt systematiskt tillvägagångssätt som kan användas som ett alternativ eller till kostsamma arbetskrävande experiment i karaktärenTion av V. Kolerae kliniska (och miljö) isolat.

Introduction

Kolera är en sjukdom i den distala tunntarmen som orsakas av konsumtion av förorenad mat eller vatten innehållande den vattenlevande Gram-negativa bakterien Vibrio cholerae . Symptom på kolera inkluderar kräkningar och okontrollerbar vattnig diarré, vilket leder till svår uttorkning, vilket om det inte behandlas ordentligt kommer att leda till döden. V. Kolerae kan delas in i över 200 serogrupper baserat på strukturen hos cellyt-lipopolysackarid-O-antigenen. Dock har endast 2 serogrupper, O1 och O139, visat epidemi eller pandemisk potential 1 , 2 . Dessutom har serogrupp O139 huvudsakligen isolerats till Sydostasien 3 , 4 , medan serogrupp O1 distribueras över hela världen. Dessutom kan O1 serogruppen uppdelas i 2 huvudbiotyper: klassisk och El Tor. Den klassiska biotypen var ansvarig för de första 6 kolera pandemiernaS mellan 1817 och 1923. Den pågående sjunde pandemin är ett resultat av El Tor-biotypen, som globalt förskjutit den klassiska biotypen i miljön 5 , 6 , 7 . På senare tid har stammar uppstått som innehåller särdrag hos både klassiska och El Tor-biotyper 8 , 9 , 10 , 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 17 och har sedan kallats El Tor-varianter 13 , 17 . Vissa El Tor-varianter har visat förhöjda virulensfunktioner med snabbare och svårare sjukdomsprogression än vad som tidigare observerats och betonarBehovet av ett mer omfattande tillvägagångssätt för agentidentifiering och förebyggande och behandling av sjukdomar 8 , 9 , 18 . Medan biotypidentifiering inte diktat omedelbart behandlingen kan ytterligare framsteg inom vaccinutveckling och framtida terapeutiska medel dra nytta av biotypsskillnad.

Den första serien av protokoll som anges här gör det möjligt för utredare att behålla V. Koleraestammar i en laboratorieinställning. Konsistens och efterföljande analys kräver lagerberedning och tillväxt av isolat, som inte är biotypberoende. För att optimalt inducera virulensgenuttryck krävs dock oberoende biotypspecifika odlingsmetoder 19 . Dessutom beskrivs förberedelser för olika genetiska och biokemiska analyser i detta manuskript.

Kollatoxin (CT) och toxinkombinationenGulerad pilus (TCP) är två huvudsakliga virulensfaktorer som styrs av master regulator ToxT i båda biotyperna hos V. Kolerae O1 serogrupp 20 . CT är ett bifasit toxin bestående av fem CtxB Subenheter som omger en enda CtxA-subenhet och är ansvarig för den snabba elektrolytförlusten associerad med kolera. TCP är en typ IV pilus kodad av tcp operon ( tcpABQCRDSTEF ), och är involverad i fastsättning och kolonisering av den distala tunntarmen. TcpA är den första genen av tcp operon som kodar för de individuella pilinunderenheterna som är nödvändiga för byggandet av pilus 8 . Gensekvensen för ctxA är helt konserverad mellan klassiska och El Tor-biotyper, medan ctxB och tcpA skiljer sig över de två biotyper men konserveras inom varje biotyp 8 . CtxB är helt konserverad mellan biotyper utom vid två basposiTion (115 och 203). I El Tor-biotypen ligger tymin vid baspositionerna 115 och 203, medan den klassiska biotypen innehåller cytosin vid dessa baser. TcpA är helt konserverad inom varje biotyp, men skiljer sig ändå vid flera baser mellan biotyper. Dessa genetiska skillnader tjänar som primära biotypidentifieringsmarkörer och efter sekvensering av polymeraskedjereaktionsprodukt (PCR) amplifieringsprodukten innefattande dessa ställen kan isolationssekvenser jämföras med vildtyp (WT) klassisk O395 eller WT El Tor N16961 för att bestämma biotypbakgrunden Av CT respektive TCP i ett givet V. cholerae- isolat.

Många protokoll har utvecklats för att karakterisera fenotypiska skillnader mellan de klassiska och El Tor biotyperna 21 , 22 , 23 . Polymyxin B är ett peptidantibiotikum som äventyrar det yttre cellmembranets integritet i gramnegativa bacTeria och polymyxin B-resistans kan visualiseras genom polymyxin B-resistansanalysen 21 . Citrat är ett primärt substrat av Krebs cykel, och förmågan att metabolisera citrat som en enda kolkälla kan bestämmas med användning av citratmetabolismassayen 22 . HapR kodar för en global regulator och huvudkorumavkänningsregulatorn i V. cholerae, HapR, som binder till olika promotorregioner och reglerar gen- och operonuttryck 24 . Vissa patogena stammar av V. cholerae har en naturligt förekommande ramskiftmutation i hapR- genen som har orsakat denna täthetsberoende reglering av virulensgenuttryck att gå vilse 24 , 25 . Genom att mäta HapR-reglerad proteasaktivitet med användning av mjölkagarmedium kan forskaren identifiera huruvida ett visst isolat innehåller en funktionell HapR 23 . DeHemolysanalys tester för en stam förmåga att utsöndra hemolytiska enzymer som lyser röda blodkroppar; Graden av hemolys kan visualiseras på blodagarplattor 23 . Motilitet är ofta associerad med virulens i V. cholerae och kan analyseras med användning av motilitetsagarplattor 23 . Voges-Proskauer-analysen testar för en stam förmåga att fermentera glukos som en enda kolkälla och producera biprodukten acetoin 21 . Med framväxten av El Tor-varianter är det svårt att förutsäga resultaten av någon given fenotypisk analys utan omfattande genotypisk screening och före avdrag av biotypbakgrunden för V. Kolerae- isolat, rekommenderas att utföra denna samling av analyser 23 och jämföra resultaten med referensstammar som i tabell 2 .

Här har vi avancerat en serie protokoll som kollektivt använder sig avoremNtioned genotypiska och fenotypiska analyser för ett mer omfattande tillvägagångssätt för att karakterisera V. Kolerae biotyper. Vidare har vi beskrivit de genotypiska och fenotypiska skillnaderna av kända V. Cholerae El Tor-varianter (MQ1795 och BAA-2163), jämfört med vanligen använda biotypreferensstammar (WT klassisk O395, WT El Tor C6706 och WT El Tor N16961; Tabell 1 ). Framväxten av El Tor-varianter har presenterat utmaningar för tillförlitligheten av tidigare använda enkla analysbiotypkaraktäriseringsprotokoll; Emellertid kommer detta multipla analysidentifieringssystem att möjliggöra en mer tillförlitlig karakterisering av kliniska och miljömässiga V. Koleraeisoler .

Protocol

Obs! Tidsåtgärder för varje analys måste göras eftersom enskilda mediepreparationer kräver olika tider. Till exempel bör solid agarplattmedium tillåtas tillräckligt kallt och torrt (1-2 dagar). Ytterligare tidsöverväganden ( dvs. ensam koloni och ökning av övernattningstiden) anges under varje protokoll och finns i tabell 2 . 1. Framställning av media 1x fosfatbuffrad saltlösning (PBS) Väg 4,0 g NaCl, 0,1 g KCl, 0…

Representative Results

För korrekt underhåll och användning av någon bakteriestam rekommenderas det att fördubbla tiden för den eller de aktuella stammen. Häri varierar växlingshastigheterna hos vanligen använda V. Koleraestammar demonstrerades genom en tillväxtkurva och ungefärliga fördubblingstider beräknades med användning av linjär regression. WT El Tor N16961 och El Tor variant MQ1795 visade kortare fördubblingstider (~ 1 h och ~ 1 h respektive) än WT klassiska O395 (~ 2 h) ( <st…

Discussion

Av de över 200 identifierade V. Kolerae serogrupper, har endast O1 och O139 epidemisk potential. O1 serogruppen kan delas in i två biotyper: klassisk och El Tor. Hybridstammar, benämnda El Tor-varianter 13 , 17 har emellertid uppstått som besitter El Tor-biotypbakgrunden och har klassiska egenskaper 8 , 9 , 10 , 11 ,<…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Forskning som stöds av New Hampshire-INBRE genom ett Institutional Development Award (IDeA), P20GM103506, från National Institute of General Medical Sciences of the NIH.

Materials

1 kb DNA Ladder New England Biolabs N3232S https://www.neb.com/products/n3232-1-kb-dna-ladder
60% Glycerol Calbiochem 356352 http://www.emdmillipore.com/US/en/product/Glycerol%2C-Molecular-Biology-Grade—CAS-56-81-5—Calbiochem,EMD_BIO-356352
Agar Becto, Dickinson and Co. 214030 http://catalog.bd.com/nexus-ecat/getProductDetail?productId=214030&parentCategory=&parentCategoryName=&categoryId=&categoryName=&searchUrl=%2FsearchResults%3Fkeyword%3D214030%26typeOfSearch%3DproductSearch
Agar with brain-heart infusion Becto, Dickinson and Co. 237500 http://catalog.bd.com/nexus-ecat/getProductDetail?productId=237500&parentCategory=&parentCategoryName=&categoryId=&categoryName=&searchUrl=%2FsearchResults%3Fkeyword%3D237500%26typeOfSearch%3DproductSearch
Agarose Peqlab 732-2789 https://de.vwr.com/store/catalog/product.jsp?catalog_number=732-2789&_DARGS=/store/cms/de.vwr.com/de_DE/header_2016111711383215.jsp_AF&_dynSessConf=1766917479792147141&targetURL=/store/catalog/product.jsp%3Fcatalog_number%3D732-2789&lastLanguage=en&/vwr/userprofiling/EditPersonalInfoFormHandler.updateLocale=&_D%3AcurrentLanguage=+&currentLanguage=en&_D%3AlastLanguage=+&_D%3A/vwr/userprofiling/EditPersonalInfoFormHandler.updateLocale=+
Anhydrous K2HPO4 Fisher Scientific P288-500 https://www.fishersci.com/shop/products/potassium-phosphate-dibasic-anhydrous-crystalline-powder-certified-acs-fisher-chemical-5/p288500?searchHijack=true&searchTerm=P288500&searchType=RAPID
Blood Agar Plates Remel R01200 Store at 4 °C;  http://www.remel.com/Catalog/Item.aspx?name=Blood+Agar
Boric Acid Fisher Scientific A73-500 https://www.fishersci.com/shop/products/boric-acid-crystalline-certified-acs-fisher-chemical-6/a73500?searchHijack=true&searchTerm=A73500&searchType=RAPID
Bromothymol Blue Fisher Scientific B388-10 https://www.fishersci.com/shop/products/bromothymol-blue-certified-acs-fisher-chemical/b38810?searchHijack=true&searchTerm=B38810&searchType=RAPID
Cirtric acid ·H2O Fisher Scientific S72836-3 https://www.fishersci.com/shop/products/citric-acid-monohydrate-4/s728363#?keyword=s728363
Deoxynucleotide (dNTP) Solution Kit New England Biolabs N0446S Store at -20 °C;  https://www.neb.com/products/n0446-deoxynucleotide-solutionset
Disodium EDTA Fisher Scientific S311-500 https://www.fishersci.com/shop/products/ethylenediaminetetraacetic-acid-disodium-salt-dihydrate-crystalline-certified-acs-fisher-chemical-7/s311500?searchHijack=true&searchTerm=S311500&searchType=RAPID
DNA Clean & Concentrator™ -25 Kit Zymo Research D4007 http://www.zymoresearch.com/dna/dna-clean-up/zymoclean-gel-dna-recovery-kit
GelGreen Nucleic Acid Stain Biotium 41005 https://biotium.com/product/gelgreentm-nucleic-acid-gel-stain-10000x-in-water/
Genesys 10SUV-VIS Spectrophotometer Thermo Scientific 840-208100 https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/840-208100?ICID=search-840-208100
Gentra Puregene Yeast/Bact. Kit Qiagen 158567 https://www.qiagen.com/us/shop/sample-technologies/dna/dna-preparation/gentra-puregene-yeastbact-kit/#orderinginformation
HCl Fisher Scientific A144-212 Corrosive;  https://www.fishersci.com/shop/products/hydrochloric-acid-certified-acs-plus-fisher-chemical-10/a144212?searchHijack=true&searchTerm=A144212&searchType=RAPID
KCl Fisher Scientific P217-500 https://www.fishersci.com/shop/products/potassium-chloride-crystalline-certified-acs-fisher-chemical-4/p217500?searchHijack=true&searchTerm=P217500&searchType=RAPID
KH2PO4 Fisher Scientific P285-500 https://www.fishersci.com/shop/products/potassium-phosphate-monobasic-crystalline-certified-acs-fisher-chemical-5/p285500?searchHijack=true&searchTerm=P285500&searchType=RAPID
KOH Fisher Scientific P250-500 https://www.fishersci.com/shop/products/potassium-hydroxide-pellets-certified-acs-fisher-chemical-5/p250500?searchHijack=true&searchTerm=P250500&searchType=RAPID
Le Loop Decon Labs Inc. MP190-25 http://deconlabs.com/products/leloop/
Le Stab Decon Labs Inc. MP186-5 http://deconlabs.com/products/lestab/
MgSO4·7H2O Fisher Scientific M63-500 https://www.fishersci.com/shop/products/magnesium-sulfate-heptahydrate-crystalline-certified-acs-fisher-chemical-3/m63500?searchHijack=true&searchTerm=M63500&searchType=RAPID
Mini-Sub Cell GT Horizontal Electrophoresis System Bio Rad Labs 1704406 http://www.bio-rad.com/en-us/product/mini-sub-cell-gt-cell?WT.srch=1&WT.mc_id=aw-cbb-NA-sub_cell_systems_brand_gold&WT.knsh_id=7eb1981f-a011-42a3-aece-1236ff453373
MR-VP Broth Difco 216300 http://catalog.bd.com/nexus-ecat/getProductDetail?productId=216300&parentCategory=&parentCategoryName=&categoryId=&categoryName=&searchUrl=%2FsearchResults%3Fkeyword%3Dmr-vp%2Bmedium%26typeOfSearch%3DproductSearch
Na2HPO4 Fisher Scientific S374-500 https://www.fishersci.com/shop/products/sodium-phosphate-dibasic-anhydrous-granular-powder-certified-acs-fisher-chemical-5/s374500?searchHijack=true&searchTerm=S374500&searchType=RAPID
NaCl Fisher Scientific S271-10 https://www.fishersci.com/shop/products/sodium-chloride-crystalline-certified-acs-fisher-chemical-6/s27110?searchHijack=true&searchTerm=S27110&searchType=RAPID
NaHCO3 Fisher Scientific S233-500 https://www.fishersci.com/shop/products/sodium-bicarbonate-powder-certified-acs-fisher-chemical-5/s233500?searchHijack=true&searchTerm=S233500&searchType=RAPID
NaNH4HPO4·4H2O Fisher Scientific S218-500 https://www.fishersci.com/shop/products/sodium-ammonium-phosphate-tetrahydrate-crystalline-certified-fisher-chemical/s218500?searchHijack=true&searchTerm=S218500&searchType=RAPID
NanoDrop Lite Spectrophtometer Thermo Scientific ND-LITE-PR https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/ND-LITE-PR?ICID=search-ND-LITE-PR
Nonfat dry milk Nestle Carnation N/A N/A
Peptone Becto, Dickinson and Co. 211677 http://catalog.bd.com/nexus-ecat/getProductDetail?productId=211677&parentCategory=&parentCategoryName=&categoryId=&categoryName=&searchUrl=%2FsearchResults%3Fkeyword%3D211677%26typeOfSearch%3DproductSearch
Petri Dishes (100 mm x 15 mm) Fisher Scientific FB0875712 https://www.fishersci.com/shop/products/fisherbrand-petri-dishes-clear-lid-12/fb0875712#?keyword=FB0875712
Petri Dishes (150 mm x 15 mm) Fisher Scientific FB0875714 https://www.fishersci.com/shop/products/fisherbrand-petri-dishes-clear-lid-12/fb0875714?searchHijack=true&searchTerm=FB0875714&searchType=RAPID
Polymyxin B sulfate salt Sigma-Aldrich P1004-10MU Store at 2-4 °C; http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sial/p1004?lang=en&region=US
Taq DNA Polymerase New England Biolabs M0273S Store at -20 °C; https://www.neb.com/products/m0273-taq-dna-polymerase-with-standard-taq-buffer
Taq Reaction Buffer New England Biolabs M0273S Store at -20 °C;  https://www.neb.com/products/m0273-taq-dna-polymerase-with-standard-taq-buffer
Thermal Cycler Bio-Rad C1000 Touch™  Bio Rad Labs 1840148 http://www.bio-rad.com/evportal/evolutionPortal.portal?_nfpb=true&_pageLabel=search_page&sfMode=search&sfStartNumber=1&clearQR=true&js=1&searchString=1840148&database=productskus+productcategories+productdetails+abdProductDetails+msds+literatures+inserts+faqs+downloads+webpages+assays+genes+pathways+plates+promotions&tabName=DIVISIONNAME
Triphenyltetrazolium chloride Alfa Aesar A10870 https://www.alfa.com/en/catalog/A10870/
Tris Base Fisher Scientific BP152-1 https://www.fishersci.com/shop/products/tris-base-white-crystals-crystalline-powder-molecular-biology-fisher-bioreagents-7/bp1521?searchHijack=true&searchTerm=BP1521&searchType=RAPID
Tris∙HCl Calbiochem 9310 http://www.emdmillipore.com/US/en/product/OmniPur-TRIS-Hydrochloride—CAS-1185-53-1—Calbiochem,EMD_BIO-9310-OP
Tryptone Becto, Dickinson and Co. 211705 http://catalog.bd.com/nexus-ecat/getProductDetail?productId=211705&parentCategory=&parentCategoryName=&categoryId=&categoryName=&searchUrl=%2FsearchResults%3Fkeyword%3D211705%26typeOfSearch%3DproductSearch
Yeast Extract Becto, Dickinson and Co. 212750 http://catalog.bd.com/nexus-ecat/getProductDetail?productId=212750&parentCategory=&parentCategoryName=&categoryId=&categoryName=&searchUrl=%2FsearchResults%3Fkeyword%3D212750%26typeOfSearch%3DproductSearch
α-napthol MP Biomedicals 204189 http://www.mpbio.com/product.php?pid=05204189

References

  1. Shimada, T., et al. Extended serotyping scheme for Vibrio cholerae. Curr. Microbiol. 28 (3), 175-178 (1994).
  2. Yamai, S., Tadayuki, O., Toshio, S., Yasuji, K. Distribution of serogroups of Vibrio cholerae non-O1 non-O139 with specific reference to their ability to produce cholera toxin, and addition of novel serogroups. Jpn. J. Infect. Dis. 71 (10), 1037-1045 (1997).
  3. Karaolis, D. K., Lan, R., Reeves, P. R. The sixth and seventh cholera pandemics are due to independent clones separately derived from environmental, nontoxigenic, non-O1 Vibrio cholerae. J. Bacteriol. 177 (11), 3191-3198 (1995).
  4. Albert, M. J., et al. Large epidemic of cholera-like disease in Bangladesh caused by Vibrio cholerae O139 synonym Bengal. Lancet. 342 (8868), 387 (1993).
  5. Barua, D., Barua, D., Greenough III, W. B. History of Cholera. Cholera. , 1-36 (1992).
  6. Morales, R., Delgado, G., Cravioto, A., Faruque, S. M., Nair, G. B. Population Genetics of Vibrio cholerae. Vibrio cholerae-Genomics and Molecular Biology. , 29-47 (2008).
  7. Samadi, A. R., Chowdhury, M. K., Huq, M. K., Khan, M. U. Seasonality of classical and El Tor cholera in Dhaka, Bangladesh: 17-year trends. Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 77 (6), 853-856 (1983).
  8. Son, M. S., Megli, C. J., Kovacikova, G., Qadri, F., Taylor, R. K. Characterization of Vibrio cholerae O1 El Tor biotype variant clinical isolates from Bangladesh and Haiti, including a molecular genetic analysis of virulence genes. J. Clin. Microbiol. 49 (11), 3739-3749 (2011).
  9. Ghosh-Banerjee, J., et al. Cholera toxin production by the El Tor variant of Vibrio cholerae O1 compared to prototype El Tor and classical biotypes. J. Clin. Microbiol. 48 (11), 4283-4286 (2010).
  10. Ansaruzzaman, M., et al. Cholera in Mozambique, variant of Vibrio cholerae. Emerg. Infect. Dis. 10 (11), 2057-2059 (2004).
  11. Ansaruzzaman, M., et al. Genetic diversity of El Tor strains of Vibrio cholerae O1 with hybrid traits isolated from Bangladesh and Mozambique. Int. J. Med. Microbiol. 297 (6), 443-449 (2007).
  12. Lan, R., Reeves, P. R. Pandemic spread of cholera: genetic diversity and relationships within the seventh pandemic clone of Vibrio cholerae determined by amplified fragment length polymorphism. J. Clin. Microbiol. 40 (1), 172-181 (2002).
  13. Nair, G. B., Faruque, S. M., Bhuiyan, N. A., Kamruzzaman, M., Siddique, A. K., Sack, D. A. New variants of Vibrio cholerae O1 biotype El Tor with attributes of the classical biotype from hospitalized patients with acute diarrhea in Bangladesh. J. Clin. Microbiol. 40 (9), 3296-3299 (2002).
  14. Nair, G. B., et al. Isolation of Vibrio cholerae O1 strains similar to pre-seventh pandemic El Tor strains during an outbreak of gastrointestinal disease in an island resort in Fiji. J. Med. Microbiol. 55 (11), 1559-1562 (2006).
  15. Nair, G. B., Mukhopadhyay, A. K., Safa, A., Takeda, Y., Faruque, S. M., Nair, G. B. Emerging hybrid variants of Vibrio cholerae O1. Vibrio cholerae—Genomics and Molecular Biology. , 179-190 (2008).
  16. Safa, A., et al. Genetic characteristics of Matlab variants of Vibrio cholerae O1 that are hybrids between classical and El Tor biotypes. J. Med. Microbiol. 55 (11), 1563-1569 (2006).
  17. Nusrin, S., et al. Diverse CTX phages among toxigenic Vibrio cholerae O1 and O139 strains isolated between 1994 and 2002 in an area where cholera is endemic. J. Clin. Microbiol. 42 (12), 5854-5856 (2004).
  18. Carignan, B. M., Brumfield, K. D., Son, M. S. Single nucleotide polymorphisms in regulator-encoding genes have an additive effect on virulence gene expression in a Vibrio cholerae clinical isolate. mSphere. 1 (5), e00253 (2016).
  19. Iwanaga, M., Yamamoto, K., Higa, N., Ichinose, Y., Nakasone, N., Tanabe, M. Culture conditions for stimulating cholera toxin production by Vibrio cholerae O1 El Tor. Microbiol. Immunol. 30 (11), 1075-1083 (1986).
  20. DiRita, V. J., Claude, P., Georg, J., Mekalanos, J. J. Regulatory cascade controls virulence in Vibrio cholerae. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 88 (12), 5403-5407 (1991).
  21. Kovacikova, G., Lin, W., Skorupski, K. Duel regulation of genes involved in acetoin biosynthesis and motility/biofilm formation by the virulence activator AphA and the acetate-responsive Lys-R type regulator AlsR in Vibrio cholerae. Mol. Microbiol. 57 (2), 420-433 (2005).
  22. Vogel, H. J., Bonner, D. M. Acetylornithinase of Escherechia coli: partial purification and some properties. J. Biol. Chem. 218 (1), 97-106 (1956).
  23. Son, M. S., Taylor, R. K. Genetic screens and biochemical assays to characterize Vibrio cholerae O1 biotypes: classical and El Tor. Curr. Protoc. Microbiol. , 6A.2.1-6A.2.17 (2011).
  24. Kovacikova, G., Skorupski, K. Regulation of virulence gene expression in Vibrio cholerae by quorum sensing: HapR functions at the aphA promoter. Mol. Microbiol. 46 (4), 1135-1147 (2002).
  25. Wang, Y., et al. The prevalence of functional quorum-sensing systems in recently emerged Vibrio cholerae toxigenic strains. Environ. Microbiol. Rep. 3 (2), 218-222 (2011).
  26. Sanders, E. R. Aseptic laboratory techniques. J. Vis. Exp. (63), e3064 (2012).
  27. Martinez, R. M., Megli, C. J., Taylor, R. K. Growth and laboratory maintenance of Vibrio cholerae. Curr. Protoc. , 6A.1.1-6A.1.6 (2010).
check_url/55760?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Brumfield, K. D., Carignan, B. M., Ray, J. N., Jumpre, P. E., Son, M. S. Laboratory Techniques Used to Maintain and Differentiate Biotypes of Vibrio cholerae Clinical and Environmental Isolates. J. Vis. Exp. (123), e55760, doi:10.3791/55760 (2017).

View Video