Journal
/
Biologia
/
Ein Protokoll für die Verwendung von Gen Set Anreicherung Analyse zur Ermittlung von geeigneten Tiermodell für die translationale Forschung
JoVE Journal
Biologia
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Biologia
A Protocol for Using Gene Set Enrichment Analysis to Identify the Appropriate Animal Model for Translational Research
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Ein Protokoll für die Verwendung von Gen Set Anreicherung Analyse zur Ermittlung von geeigneten Tiermodell für die translationale Forschung

DOI:
10.3791/55768-v

•

09:35 min

•

August 16, 2017

•

, , , , ,
1Department of Experimental Toxicology and ZEBET,German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), 2Department of Clinical Pharmacology and Toxicology,Charité-Universitätsmedizin Berlin

Capítulos

  • 00:05Título
  • 00:54Performing the Game Set Enrichment Analysis (GSEA)
  • 05:46Comparing the GSEA Results and Identifying the Optimal Animal Model
  • 07:55Results: Overlap of Pathway Regulation Identifies Suitable and Unsuitable Animal Models
  • 08:49Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Wir bieten ein standardisiertes Protokoll für die Nutzung der Genanalyse Set Anreicherung von transkriptomischen Daten, um eine ideale Maus-Modell für die translationale Forschung zu identifizieren.
Dieses Protokoll kann mit DNA-Microarray und RNA Sequenzierungsdaten verwendet werden und kann weiter mit anderen Daten der Omics verlängert werden, wenn Daten vorhanden sind.

Tags

Gene Set Enrichment AnalysisAnimal ModelTranslational ResearchGenome DataMouse ModelsInflammatory DiseasesGene Expression StudiesGene Expression DataPhenotype FileMolecular Signature DatabaseDNA Chip AnnotationsGSEA SoftwareGene SymbolsPermutations

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/55768?article_type=v

Testen visueller Sensibilität für die Geschwindigkeit und Richtung der Bewegung in Lizards
check_url/pt/55768?article_type=v

Computer-Generated-Tiermodell Stimuli
check_url/pt/55768?article_type=v

Mit dem Gene Pulser MXcell Elektroporation System zur Primary Cells mit hohem Wirkungsgrad zu transfizieren
check_url/pt/55768?article_type=v

Genomweite Analyse mittels ChIP zu Isoform-spezifische Gene-Targets zu identifizieren
check_url/pt/55768?article_type=v

Die Methode der Nager Whole Embryo Culture mit der Rotator-type Bottle Kultur-System
check_url/pt/55768?article_type=v

Isolierung von Ribosom gebunden Nascent Polypeptide<em> In-vitro-</em> Identifizieren Translational Pause Standorten entlang mRNA
check_url/pt/55768?article_type=v

Mit SECM Arrest Sequenz als Werkzeug zum Ribosom gebunden Polypeptide isolieren
check_url/pt/55768?article_type=v

Using Caenorhabditis elegans as a Model System to Study Protein Homeostasis in a Multicellular Organism
check_url/pt/55768?article_type=v

Xenopus laevis als Modell zur Übersetzung Impairment Identifizieren
check_url/pt/55768?article_type=v

Komplette Workflow zur Analyse von Histon-post-translationale Modifikationen Mit Bottom-up-Massenspektrometrie: Von Histone Extraktion in Datenanalyse

Read Article