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Artigo de método

A determinação da especificidade da Protease no Mouse tecido extrai por espectrometria de massa MALDI-TOF: manipulando o PH para causar alterações de especificidade

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DOI:

10.3791/57469

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25 de maio de 2018

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Neste artigo

Resumo

Aqui, apresentamos um protocolo para determinar a especificidade da protease no tecido cru rato extratos usando espectrometria de MALDI-TOF.

Resumo

Proteases têm várias funções biológicas, incluindo a digestão de alimentos e ativação/inativação de proteínas. Identificar a especificidade da protease é importante por revelar a função de protease. O método proposto neste estudo determina a especificidade de protease medindo-se o peso molecular de substratos exclusivos usando Matrix-assisted Laser dessorção/ionização de espectrometria de massa de tempo-de-voo (MALDI-TOF). Os substratos contêm iminobiotin, enquanto o site clivado consiste de aminoácidos, e o espaçador é composto por polietileno glicol. O substrato clivado irá gerar um único peso molecular, usando um ácido aminado clivado. Um dos méritos desse método é que pode ser efectuada em uma panela, usando amostras brutas, e é também adequado para avaliar várias amostras. Neste artigo, descrevemos um método experimental simples otimizado com amostras extraídas do tecido do pulmão do rato, incluindo a extracção de tecido, colocação de substratos digestivos em amostras, purificação de substratos digestivos sob condições de pH diferente e medição de peso molecular dos substratos, utilizando espectrometria de massa MALDI-TOF. Em resumo, esta técnica permite a identificação da especificidade da protease em amostras brutas derivado de extratos de tecido usando espectrometria de massa MALDI-TOF, que facilmente pode ser ampliada para múltiplo processamento de amostra.

Introdução

Proteases regulam processos fisiológicos por clivagem de proteínas, e o início da atividade de protease em horários específicos e locais é regulamentado1. Portanto, é importante identificar a expressão e a atividade dos tecidos que são regulamentados localmente e desenvolver um novo método para detectar proteases. O método proposto neste estudo visa identificar a especificidade da protease em paralelo para detecção de proteases.

Existem alguns métodos para a detecção de especificidade de protease. O método azocasein é conhecido por sua utilização na detecção de proteases2 mas é limitado em sua....

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Protocolo

Protocolos experimentais animais foram aprovados pelo Comitê de ética da Universidade Nihon farmacêutico e realizados em conformidade com as orientações para o cuidado e o uso de animais de laboratório da Universidade Nihon farmacêutico. O protocolo foi ajustado para extratos de tecido derivados de camundongos ICR. Camundongos ICR foram comprados de Nippon SLC Ltd. (Shizuoka, Japão)

1. preparação do substrato Iminobiotin-etiquetado

O substrato sofre a fase sólida síntese usando grupo 9-fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc)-protegido aminoácidos, conforme descrito abaixo de11. Use a tabel....

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Resultados

Avaliação do método para a identificação da especificidade de protease por protease modelo

A eficiência deste sistema foi avaliada usando TPCK-tripsina e protease V8, cujas especificidades do substrato foram obtidas. TPCK-tripsina e protease V8 foram estimados para clivar a sequência de aminoácidos no C-terminal dos resíduos lisina e arginina e no lado de carboxila do ácido aspártico e ácido glutâmico resíduos, respectivamente.

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Discussão

Este protocolo utiliza a espectrometria de massa MALDI-TOF para identificar a especificidade de protease em amostras brutas derivado de extratos de tecido e facilmente pode ser ampliado para múltiplo processamento de amostra. Em particular, estamos manipulados pH para causar uma mudança na especificidade de substrato.

O método (ABC) complexo avidina-biotina, que tem sido amplamente utilizado em bioquímica devido à sua especificidade de ligação, foi utilizado em nosso protocolo. Devido a forte .......

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Divulgações

Os autores declaram não haverá conflito de interesses.

Agradecimentos

Este trabalho foi financiado em parte pelo Nihon farmacêutica Universidade bolsa de pesquisa da Universidade de Nihon farmacêutico (2016) e o MEXT KAKENHI Grant número JP17854179.

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Resina Fmoc-NH-SAL (- [2,4-Dimetoxifenil-N- (9-fluorenilmetoxicarbonil)
aminometil]fenoxi resina)
Watanabe Chemical Co., Ltd.A00102
N, N-dimetilformamida (DMF)Watanabe Chemical Co., Ltd.A00185
piperidinaWatanabe Chemical Co., Ltd.A00176
ácido trinitrobenzenossulfônico (TNBS)WAKO Chemical209-1483
O- (6-Cloro-1H-benzotriazol-1-il) -N, N, N ', N'-tetrametilurônio hexafluorofosfato (HCTU)Watanabe Chemical Co., Ltd.A00067
1-Hidroxi-1H-benzotriazol, monohidrato (HOBt)Watanabe Chemical Co., Ltd.A00014
diisopropiletilamina (DIPEA)Watanabe Chemical Co., Ltd.A00030
triisopropilsilano (TIS)Watanabe Chemical Co., Ltd.A00170
ethanedithiol (EDT)Watanabe Chemical Co., Ltd.A00057
ácido trifluoroacético (TFA)MilliporeS6612278 403
acetonitrilaKokusan Chemical2153025
coluna de cartucho C18ÁguasWAT051910
éter octilfenílico de poli (oxietileno)WAKO Chemical168-11805Triton X-100
homogeneizador de misturaKinematicaPT3100Homogeneizador Polytron
Coomassie Brilliant Blue (CBB) -G250Nakarai Chemical094-09
glicerolNakarai Chemical170-18
N-tosil-L-fenilalanina clorometilcetona (TPCK)-tripsinaSigma-AldrichT1426
dimetilsulfóxido (DMSO)WAKO Chemical043-07216
estreptavidina sepharoseGE Healthcare17-511-01
ZipTipC18MilliporeZTC18S096
&alfa;-ciano-4-hidroxicinâmico ácido (CHCA)Sigma-AldrichC2020
MALDI-TOF espectrometria de massaBruker Daltonics, Alemanhaautoflex
2-iminobiotinaSigma-AldrichI4632
Fmoc-aminoácidosWatanabe Chemical Co., Ltd.

Referências

  1. Neurath, H., Walsh, K. A. Role of proteolytic enzymes in biological regulation (a review). Proc Natl Acad Sci U S A. 73 (11), 3825-3832 (1976).
  2. Surinov, B. P., Manoilov, S. E. Determination of the activity of proteolytic enzymes by means of azocasein. Vop....

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Reimpressões e permissões

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