Detection of Phytophthora capsici in Irrigation Water using Loop-Mediated Isothermal Amplification

Owen Hudson; Sumyya Waliullah; Justin Hand; Romina Gazis-Seregina; Fulya Baysal-Gurel; Md Emran Ali

doi:10.3791/61478

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Detecção de Phytophthora capsici em água de irrigação usando amplificação isotérmica mediada por loop

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Detection of Phytophthora capsici in Irrigation Water using Loop-Mediated Isothermal Amplification

Detecção de Phytophthora capsici em água de irrigação usando amplificação isotérmica mediada por loop

DOI:

10.3791/61478-v

•

07:25 min

•

June 25, 2020

•

Owen Hudson, Sumyya Waliullah, Justin Hand, Romina Gazis-Seregina, Fulya Baysal-Gurel, Md Emran Ali

¹Department of Plant Pathology, Coastal Plain Experiment Station,University of Georgia, ²University of Georgia Cooperative Extension, ³Department of Plant Pathology, Tropical Research & Education Center,University of Florida, ⁴Department of Agricultural and Environmental Sciences, Otis L. Floyd Nursery Research Center,Tennessee State University

Capítulos

00:04Introduction
00:48Pump and Filter Setup
01:16Water Sampling and Filtering
02:22Magnetic Bead-Based DNA Extraction
03:58Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Assay
05:07Results: Representative Phytophthora capsici Detection
06:53Conclusion

Summary

Tadução automática

Desenvolvemos um método para detectar zoospores Phytophthora capsici em fontes de água usando um método de extração de DNA de papel filtro juntamente com um ensaio de amplificação isotérmica mediada em loop (LAMP) que pode ser analisado no campo ou no laboratório.

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