Denne protokollen er for bestemmelse av lipider i sjøvann og biologiske prøver. Lipider i filtrater ekstraheres med kloroform eller blandinger av kloroform og metanol i tilfelle av faste stoffer. Lipidklasser måles ved stang tynnlagskromatografi med flammeioniseringsdeteksjon, og summen gir det totale lipidinnholdet.
Lipider består i stor grad av karbon og hydrogen og gir derfor en større spesifikk energi enn andre organiske makromolekyler i havet. Å være karbon- og hydrogenrik de er også hydrofobe og kan fungere som et løsningsmiddel og absorpsjonsbærer for organiske forurensninger og kan dermed være drivere av forurensende bioakkumulering i marine økosystemer. Deres hydrofobe natur letter isolasjonen fra sjøvann eller biologiske prøver: marin lipidanalyse begynner med prøvetaking og deretter ekstraksjon i ikke-polare organiske løsningsmidler, noe som gir en praktisk metode for separasjon fra andre stoffer i en akvatisk matrise.
Hvis sjøvann er prøvet, innebærer det første trinnet vanligvis separasjon i operasjonelt definerte “oppløste” og “partikkelfraksjoner” ved filtrering. Prøver samles inn og lipider isoleres fra prøvematrisen vanligvis med kloroform for virkelig oppløst materiale og kolloider, og med blandinger av kloroform og metanol for faste stoffer og biologiske prøver. Slike ekstrakter kan inneholde flere klasser fra biogene og menneskeskapte kilder. På dette tidspunktet kan totale lipider og lipidklasser bestemmes. Total lipid kan måles ved å summere individuelt bestemte lipidklasser som vanligvis har blitt kromatografisk separert. Tynnlagskromatografi (TLC) med flammeioniseringsdeteksjon (FID) brukes regelmessig til kvantitativ analyse av lipider fra marine prøver. TLC-FID gir synoptisk lipidklasseinformasjon og, ved å summere klasser, en total lipidmåling.
Lipidklasseinformasjon er spesielt nyttig når den kombineres med målinger av individuelle komponenter, for eksempel fettsyrer og/eller steroler, etter at de er frigjort fra lipidekstrakter. Det store utvalget av lipidstrukturer og -funksjoner betyr at de brukes bredt i økologisk og biogeokjemisk forskning som vurderer økosystemhelsen og graden av påvirkning av menneskeskapte påvirkninger. De har blitt brukt til å måle stoffer av kostholdsverdi til marin fauna (f.eks. aquafeeds og/eller byttedyr), og som en indikator på vannkvalitet (f.eks. hydrokarboner).
Metodene beskrevet her gjelder stoffer som er definert operasjonelt som marine lipider. Denne definisjonen er basert på deres egnethet til væske-væske ekstraksjon i ikke-polare organiske løsningsmidler, og det gir en praktisk metode for deres separasjon fra andre stoffer i en akvatisk matrise. Deres hydrofobe natur letter isolasjonen fra sjøvann eller biologiske prøver, samt deres berikelse, og fjerning av salter og proteiner.
Målingen av lipidinnhold og dens sammensetning i marine organismer har vært av stor interesse for matnettøkologi, akvakulturernæring og matvitenskap i flere tiår. Lipider er universelle komponenter i levende organismer, som fungerer som essensielle molekyler i cellemembraner, som store kilder til biotilgjengelig energi, gir termisk isolasjon og oppdrift, og fungerer som signalmolekyler. Selv om prosedyrer for lipidbestemmelse på andre felt er beskrevet godt, krever deres bruk med marine prøver vanligvis modifikasjon for å tilpasse seg feltforhold samt prøvetype1.
For sjøvannsprøver krever det første trinnet vanligvis separasjon i de operasjonelt definerte “oppløste” og “partikkelfraksjonene”, normalt ved filtrering (protokolltrinn 1). Partikkelfraksjonen er det som beholdes av filteret, og størrelsen på porene er viktig for å definere avskjæringen2. Ofte når vi tar prøver av svevestøv, vil vi gjerne relatere lipidkonsentrasjoner til totale massekonsentrasjoner, i så fall må en separat, mindre prøve (f.eks. 10 ml) tas for dette formålet (Protokoll trinn 1, merk). For å få en nøyaktig massebestemmelse er det viktig å legge til ammoniumformat (35 g / L) på slutten av filtreringen.
Sjøvannsfiltratet fra den større prøven skal utgjøre mellom 250 ml og 1 l avhengig av prøvetype og utsettes for væskevæskeutvinning i en separatortrakt (protokolltrinn 2). Lipidenes hydrofobe natur betyr at de kan skilles fra andre forbindelser ved ekstraksjon i et ikkepolært løsningsmiddel som kloroform. Et tolagssystem opprettes der lipider partisjonerer seg inn i det organiske laget mens vannløselige komponenter forblir i det vandige laget.
Partikkelprøver på et filter, eller biologiske prøver ekstraheres med en modifisert Folch et al. ekstraksjon3, som også involverer kloroform (protokolltrinn 3). Igjen opprettes et organisk / vandig system der lipider partisjonerer seg inn i den organiske fasen, mens vannløselige molekyler forblir i den vandige fasen, og proteiner utfelles. Faktisk, for faste stoffer, bruker de fleste laboratorier en viss variasjon av Folch et al. ekstraksjon3-prosedyren som involverer kloroform og metanol. For filtre er det første trinnet å homogenisere i 2 ml kloroform og 1 ml metanol.
Under utvinning bør det tas hensyn til å beskytte lipider mot kjemisk eller enzymatisk modifikasjon, ved å holde prøver og løsningsmidler på is for å redusere esterbinding hydrolyse eller karbonkarbon dobbel binding oksidasjon. Vev og cellelipider er ganske godt beskyttet av naturlige antioksidanter og ved oppdeling4; Etter homogeniseringen av prøver kombineres imidlertid celleinnhold som gjør lipider mer avhendet til endring, kjemisk eller enzymatisk. Noen lipider, som de fleste steroler, er svært stabile, mens andre, som de som inneholder flerumettede fettsyrer, er mer utsatt for kjemisk oksidasjon. Andre, som steroler med konjugerte doble bindinger, er utsatt for oksidasjon katalysert av lys5. Etter ekstraksjoner er lipider mye mer utsatt for kjemisk oksidasjon, og prøver bør lagres under en inert gass som nitrogen. En mild strøm av nitrogen vil også bli brukt til å konsentrere ekstrakter.
Etter konsentrasjonen vil lipider normalt kvantifiseres i bulk, da de er en viktig komponent i marine økosystemer som gir en høy konsentrasjon av energi, mer enn dobbelt så mye kJ /g karbohydrater og proteiner. Alltid ville de neste bli kvantifisert som individuelle komponenter: Den omfattende analysen av lipider innebærer generelt separasjon i enklere kategorier, i henhold til deres kjemiske natur. Dermed innebærer en full analyse å måle totale lipider, lipidklasser og individuelle forbindelser.
Total lipid kan bestemmes ved å ta summen av individuelt målte lipidklasser atskilt med kromatografi6. Et marint lipidekstrakt kan inneholde mer enn et dusin klasser fra biogene og menneskeskapte kilder. Det brede utvalget av lipidstrukturer betyr at mye informasjon kan oppnås ved å bestemme individuelle grupperinger av strukturer. Lipidklasser individuelt, eller i visse grupper, har blitt brukt til å signalisere tilstedeværelse av visse typer organismer, samt deres fysiologiske status og aktivitet2. De har også blitt brukt som en indikator på opprinnelsen til organisk materiale, inkludert oppløst organisk materiale (DOM) samt hydrofobe forurensninger.
Triacylglyseroler, fosfolipider og steroler er blant de viktigste biogene lipidklassene. De to første er biokjemisk relatert da de har en glyserol ryggrad som to eller tre fettsyrer er esterifisert (Figur 1). Triacylglyseroler, sammen med voksester, er svært viktige lagringsstoffer, mens andre fettsyreholdige lipidklasser som diacylglyseroler, frie fettsyrer og monoacylglyseroler generelt er mindre bestanddeler. Frie fettsyrer er tilstede ved lavere konsentrasjoner i levende organismer, da de umettede kan være giftige7. Steroler (både i frie og esterifiserte former) og fettalkoholer er også inkludert blant de mindre polare lipidene, mens glykolipider og fosfolipider er polare lipider. Polar lipider har en hydrofil gruppe, noe som gjør det mulig å danne lipidbilayere som finnes i cellemembraner. Frie steroler er også membranstrukturelle komponenter, og når de tas i forhold til triacylglyseroler, gir de en tilstand eller ernæringsmessig indeks (TAG : ST) som har blitt mye brukt8. Når de tas i forhold til fosfolipider (ST : PL), kan de brukes til å indikere plantefølsomhet for salt: høyere verdier opprettholder strukturell integritet og reduserer membrangjennomtrengelighet9. Det motsatte av dette forholdet (PL : ST) har blitt studert i bivalve vev under temperaturtilpasning10.
Marine lipidklasser kan separeres av tynnlagskromatografi (TLC) på silikagelbelagte stenger (protokolltrinn 4) og deretter oppdages og kvantifiseres ved flammeioniseringsdeteksjon (FID) i en automatisk FID-skanner. TLC/FID har rutinemessig blitt brukt til marine prøver, da det raskt gir synoptiske lipidklassedata fra små prøver, og ved å ta summen av alle klasser, en verdi for totale lipider. TLC/FID har blitt utsatt for en kvalitetssikringsvurdering (QA) og ble funnet å oppfylle standarder som kreves for konsistent ekstern kalibrering, lave emner og presis replikeringsanalyse11. Variasjonskoeffisienter (CV) eller relative standardavvik er rundt 10 %, og de totale LIPID-dataene for FID-skanneren er normalt rundt 90 % av dem som oppnås ved gravimetrisk og andre metoder2. Gravimetry gir høyere totale lipider sannsynligvis fordi FID-skanneren bare måler ikke-flyktige forbindelser, og også som et resultat av mulig inkludering av ikke-lipidmateriale i gravimetriske målinger.
Informasjonen fra lipidklasseanalyse er spesielt nyttig når den kombineres med bestemmelse av fettsyrer som individer, eller steroler, eller de to i kombinasjon. Det første skrittet mot disse analysene innebærer frigjøring av alle komponentfettsyrer sammen med steroler i lipidekstraktene (protokolltrinn 5). Det store utvalget av lipidstrukturer og -funksjoner betyr at de har sett bred bruk i økologiske og biogeokjemiske studier som vurderer økosystemhelsen og i hvilken grad de har blitt påvirket av menneskeskapte og terrestriske tilførsler. De har blitt brukt til å måle biosyntese av stoffer av kostholdsverdi til marin fauna, samt for å indikere kvaliteten på vannprøver. Måling av lipider i sedimentkjerneprøver bidrar til å vise sedimentenes følsomhet for endringer i menneskelig arealbruk nær landbunnsmarginen.
Det primære verktøyet for å identifisere og kvantifisere individuelle lipidforbindelser har tradisjonelt vært gasskromatografi (GC) med FID. Før analyse blir imidlertid disse forbindelsene gjort mer flyktige ved avledning. Fettsyrer frigjøres i nærvær av en sur katalysator(H2SO4) fra acyl lipidklasser (figur 1). I organisk kjemi er akrylgruppen (R-C = O) vanligvis avledet fra en karboksylsyre (R-COOH). De blir deretter re-esterified til fettsyre metyl estere (FAME) som gir bedre separasjoner på GC kolonner (Protocol trinn 5).
Hastigheten som TLC-FID-systemet gir synoptisk lipidklasseinformasjon fra små prøver, gjør TLC-FID til et dyktig verktøy for screening av marine prøver før det foretas mer involverte analytiske prosedyrer. Slike analyser krever vanligvis frigjøring av komponentforbindelser fra lipidekstrakter og avledning for å øke volatiliteten ved gasskromatografi. TLC-FID kombinert med GC-FID har vist seg å være en kraftig kombinasjon for ekstrakter av sjømat og andre matvarer14. For vellykkede mari…
The authors have nothing to disclose.
Denne forskningen ble finansiert av Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC) tilskuddsnummer 105379 til C.C. Parrish. Memorial University’s Core Research Equipment &Instrument Training (CREAIT) Network bidro til å finansiere denne publikasjonen.
15 ml vials | VWR | 66009-560 | |
1-hexadecanol | Sigma | 258741-1G | |
1-Monopalmitoyl-rac-glycerol | Sigma | M1640-1g | |
2 ml vials | VWR | 46610-722 | |
25 mm glass fibre filters | Fisher | 09 874 32A | |
2ml pipet bulbs | VWR | 82024-554 | |
47 mm glass fibre filters | Fisher | 09 874 32 | |
5 3/4" pipets | Fisher | 1367820A | |
9" pipets | Fisher | 1367820C | |
Acetone | VWR | CAAX0116-1 | |
Agilent GC-FID 6890 | Agilent | ||
Calcium Chloride ANHS 500gm | VWR | CACX0160-1 | |
Caps for 2 ml vials | VWR | 46610-712 | |
chloroform | VWR | CACX1054-1 | |
Cholesteryl palmitate | Sigma | C6072-1G | |
Chromarod S5 | Shell USA | 3252 | |
Dichloromethane | VWR | CADX0831-1 | |
DL-a-phosphatidylcholine, dipalmotoyl | Sigma | P5911-1g | |
Ethyl Ether, ACS grade anhydr 4L | VWR | CAEX0190-4 | |
Glyceryl tripalmitate | Sigma | T5888-100MG | |
Hamilton Syringe 702SNR 25µl | Sigma | 58381 | |
Helium | Air Liquide | A0492781 | |
Hexane | VWR | CAHX0296-1 | |
Hydrogen regulator | VWR | 55850-484 | |
Iatroscan MK6 | Shell USA | ||
Kimwipes | Fisher | 066662 | |
Medical Air | Air Liquide | A0464563 | |
Medium nitrile gloves | Fisher | 191301597C | |
Nitrile gloves L | VWR | CA82013-782 | |
Nitrogen | Air Liquide | A0464775 | |
Nitrogen Regulator | VWR | 55850-474 | |
Nonadecane | Sigma | 74158-1G | |
Palmitic acid | Sigma | P0500-10G | |
Repeating dispenser | Sigma | 20943 | |
Sodium Bicarbonate 1kg | VWR | CA97062-460 | |
Sodium Sulfate Anhy ACS 500gr | VWR | CA71008-804 | |
Sulfuric acid | VWR | CASX1244-5 | |
Teflon tape | Fisher | 14610120 | |
tissue master 125 115V w/7mm homogenator | OMNI International | TM125-115 | |
TLC development tank | Shell USA | 3201 | |
UHP hydrogen | Air Liquide | A0492788 | |
VWR solvent repippetter | VWR | 82017-766 | |
VWR timer Flashing LED 2 channel | VWR | 89140-196 | |
Zebron ZB-Wax GC column | Phenomenex | 7HM-G013-11 |