A matéria orgânica do solo (MOS) é uma mistura complicada de diferentes compostos que abrangem desde componentes vegetais livres e parcialmente degradados até compostos mais alterados microbialmente mantidos nos agregados do solo até subprodutos microbianos altamente processados com fortes associações com minerais reativos do solo. Os cientistas do solo têm lutado para encontrar maneiras de separar o solo em frações que sejam facilmente mensuráveis e úteis para a modelagem de carbono (C) do solo. O fracionamento do solo com base na densidade está sendo cada vez mais utilizado, sendo de fácil execução e produzindo pools de C com base no grau de associação entre a MOS e diferentes minerais; assim, o fracionamento da densidade do solo pode auxiliar na caracterização da MOS e na identificação de mecanismos de estabilização da MOS. No entanto, os protocolos de fracionamento da densidade do solo relatados variam significativamente, tornando os resultados de diferentes estudos e ecossistemas difíceis de comparar. Aqui, descrevemos um procedimento robusto de fracionamento por densidade que separa partículas e matéria orgânica associada a minerais e explicamos os benefícios e desvantagens de separar o solo em duas, três ou mais frações de densidade. Tais frações frequentemente diferem em sua composição química e mineral, tempo de rotatividade e grau de processamento microbiano, bem como o grau de estabilização mineral.