Este esforço investigativo buscou elucidar o mecanismo de administração tópica de fármacos utilizando uma integração sinérgica de farmacologia em rede e conjuntos de dados de expressão gênica omnibus (GEO). Este artigo avaliou a viabilidade, o alvo e o mecanismo do ShiDuGao (SDG) no tratamento do eczema do ânus.
É necessária uma assinatura do JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou inicie seu teste gratuito.
Artigo de método
A eficácia e os mecanismos de via subjacentes do tratamento com ShiDuGao para eczema de ânus com base em conjuntos de dados GEO e farmacologia de rede
* These authors contributed equally
Neste artigo
Resumo
Resumo
O eczema do ânus é uma doença inflamatória crônica e recorrente da pele que afeta a área ao redor do ânus. Embora as lesões ocorram principalmente na pele anal e perianal, elas também podem se estender para o períneo ou genitália. ShiDuGao (SDG) foi encontrado para possuir propriedades reparativas significativas contra prurido anal, controle de exsudação, redução de umidade, e reparação da pele. No entanto, os alvos genéticos e os mecanismos farmacológicos dos ODS no eczema anal ainda precisam ser amplamente elucidados e discutidos. Consequentemente, este estudo empregou uma abordagem farmacológica de rede e utilizou conjuntos de dados de expressão gênica omnibus (GEO) para investigar alvos gênicos. Adicionalmente, uma rede de interação proteína-proteína (IBP) foi estabelecida, resultando na identificação de 149 alvos, dos quais 59 foram considerados genes hub, dentro da rede de interação "droga-alvo-doença".
A função gênica dos ODS no tratamento do eczema perianal foi avaliada através da utilização da análise da Enciclopédia de Genes e Genomas de Kyoto (KEGG) e Ontologia Gênica (GO). Posteriormente, a função antieczema perianal e a potencial via dos ODS, identificadas na análise farmacológica da rede, foram validadas usando a metodologia de acoplamento molecular. Os processos biológicos associados a genes e proteínas alvo dos ODS no tratamento do eczema do ânus englobam principalmente respostas mediadas por citocinas, respostas inflamatórias e respostas ao lipopolissacarídeo, entre outras. Os resultados das análises de enriquecimento de vias e anotação funcional sugerem que o ODS desempenha um papel crucial na prevenção e manejo do eczema anal, regulando as vias de infecção pelo vírus Shigelose e herpes simplex 1. A farmacologia da rede e a análise do banco de dados GEO confirmam a natureza multi-alvo do SDG no tratamento do eczema anal, especificamente modulando TNF, MAPK14 e CASP3, que são alvos centrais cruciais nas vias de sinalização TNF e MAPK. Esses achados fornecem uma direção clara para uma investigação mais aprofundada sobre o mecanismo terapêutico dos ODS para eczema anal, destacando seu potencial como uma abordagem de tratamento eficaz para essa condição debilitante.
Introdução
O eczema anal é uma afecção alérgica da pele que acomete a região e mucosas perianais, apresentando diversas manifestaçõesclínicas1. Os sintomas característicos incluem eritema anal, pápulas, bolhas, erosão, exsudatos e crostas. Esses sintomas surgem principalmente devido a arranhões, espessamento e rugosidade da área afetada2.
O eczema anal, caracterizado por duração prolongada da doença, crises recorrentes e tratamento desafiador, pode ter efeitos adversos na saúde física e mental dos pacientes3. A patogênese do eczema anal ainda não está clara, e a medicina moderna s....
Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.
Protocolo
Este estudo não se refere à aprovação ética e consentimento para participar. Os dados utilizados neste estudo foram obtidos de bancos de dados genéticos.
1. Predição de alvos de doenças
- Acesse o banco de dados GeneCards (https://www.genecards.org) e o banco de dados online de herança mendeliana no homem (OMIM, https://www.omim.org), utilizando "eczema do ânus" como termo de busca para alvos de doenças.
- Faça o download das planilhas dos alvos da doença. Exclua os alvos repetidos para obter os alvos de eczema do ânus.
2. Seleção dos componentes ativos
Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.
Resultados
Genes relacionados ao eczema do ânus, genes-alvo dos ODS e alvos comuns
Um total de 958 potenciais candidatos a genes foram examinados em Genecards e 634 em bancos de dados OMIM, enquanto duplicatas foram excluídas. Para obter uma compreensão abrangente dos genes relacionados ao eczema anal, os achados de vários bancos de dados foram amalgamados, produzindo um total de 958 genes distintos. Consequentemente, uma rede de interação proteína-proteína (IBP) específica para eczema anal foi meticulosamente f.......
Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.
Discussão
A dermatite atópica é uma forma específica de eczema que compartilha mecanismos subjacentes com o eczema. Acredita-se que os genes hub estejam relacionados a essa condição são TNF, MAPK14 e CASP3. Os efeitos terapêuticos dos ODS sobre o eczema anal são atribuídos principalmente à sua ação nas vias de sinalização do TNF e MAPK por meio desses três geneshub17.
O ODS inclui cinco drogas distintas: índigo naturalis, cipreste dourado, gesso calcinado, calamina e galha chines.......
Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.
Divulgações
Os autores não têm nada a revelar.
Materiais
| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| AutoDockTools | AutoDock | https://autodocksuite.scripps.edu/adt/ | |
| Cytoscape 3.9.1 | Cytoscape | https://cytoscape.org/ | |
| banco de dados GeneCards | GeneCards | https://www.genecards.org | |
| banco de dados GEO | Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ | |
| ferramenta GEO2R | Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia | https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/ | |
| Metascape | Metascape | https://metascape.org/ | |
| Herança mendeliana online no banco de dados do homem | de proteínas OMIM | https://www.omim.org | |
| RCSB | Banco de Dados de Proteínas RCSB (RCSB PDB) | http://www.pdb.org/ | |
| Banco de dados STRING | STRING | https://string-db.org/ | |
| Banco de dados ADME suíço | Banco de dados de farmacologia do sistema do Instituto Suíço de Bioinformática | http://www.swissadme.ch/index.php | |
| Medicina Tradicional Chinesa (TCMSP) | Banco de dados de farmacologia de sistemas de medicina tradicional chinesa e plataforma de análise | http://tcmspw.com/tcmsp.php | |
| Venny2.1 | BioinfoGP | https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html |
Referências
- Ma, M., Lu, H., Yang, Z., Chen, L., Li, Y., Zhang, X. Differences in microbiota between acute and chronic perianal eczema. Medicine. 100 (16), e25623(2021).
- Dietrich, C. F., Hoch, F. Anal eczema. Revue Therapeutique. 78 (9), 509-512 (2021).
- Dietrich, A., Ruzicka, T., Hermans, C.
Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.
Reimpressões e permissões
