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Artigo de método

Estratégia para Biobanco de Organoides para Câncer de Ovário: Abordando a Heterogeneidade Interpaciente entre Subtipos Histológicos e Estágios da Doença

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DOI:

10.3791/66467

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23 de fevereiro de 2024

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* These authors contributed equally

Neste artigo

Resumo

Este protocolo oferece uma estrutura sistemática para o estabelecimento de organoides de câncer de ovário de diferentes estágios da doença e aborda os desafios da variabilidade específica da paciente para aumentar o rendimento e permitir uma expansão robusta a longo prazo para aplicações subsequentes. Inclui etapas detalhadas para processamento de tecidos, semeadura, ajuste dos requisitos de meios e coloração por imunofluorescência.

Resumo

Embora o estabelecimento de um biobanco de câncer de ovário a partir de organoides derivados de pacientes, juntamente com suas informações de antecedentes clínicos, prometa avanços na pesquisa e no cuidado ao paciente, a padronização permanece um desafio devido à heterogeneidade dessa malignidade letal, combinada com a complexidade inerente da tecnologia organoide. Este protocolo adaptável fornece uma estrutura sistemática para realizar todo o potencial dos organoides do câncer de ovário, considerando uma variabilidade paciente-específica de progenitores. Ao implementar um fluxo de trabalho experimental estruturado para selecionar condições ideais de cultura e métodos de semeadura, com testes paralelos de semeadura 3D direta versus uma rota 2D/3D, obtemos, na maioria dos casos, linhas de expansão robustas de longo prazo adequadas para uma ampla gama de aplicações downstream.

Notavelmente, o protocolo tem sido testado e se mostrado eficiente em um grande número de casos (N = 120) de material de partida altamente heterogêneo, incluindo câncer de ovário de alto e baixo grau e estádios da doença com debulking primário, doença recorrente e espécimes cirúrgicos pós-neoadjuvantes. Dentro de um ambiente de sinalização exógena de baixo Wnt e alto BMP, observamos progenitores sendo diferentemente suscetíveis à ativação da via da Heregulina 1 ß (HERß-1), com o HERß-1 promovendo a formação de organoides em alguns enquanto o inibe em outros. Para um subconjunto das amostras do paciente, a formação ideal de organoides e o crescimento a longo prazo requerem a adição do fator de crescimento de fibroblastos 10 e R-Spondin 1 ao meio.

Além disso, destacamos as etapas críticas da digestão do tecido e do isolamento do progenitor e apontamos exemplos em que o breve cultivo em 2D em plástico é benéfico para a subsequente formação de organoides na matriz do Extrato de Membrana Basal tipo 2. Em geral, o biobanco ideal requer testes sistemáticos de todas as principais condições em paralelo para identificar um ambiente de crescimento adequado para linhas individuais. O protocolo também descreve o procedimento de manuseio para incorporação, secção e coloração eficientes para obter imagens de alta resolução de organoides, o que é necessário para uma fenotipagem abrangente.

Introdução

O manejo clínico de pacientes com câncer epitelial de ovário permanece desafiador devido à sua apresentação clínica heterogênea em estágios avançados e altas taxas derecorrência1. Melhorar nossa compreensão do desenvolvimento do câncer de ovário e do comportamento biológico requer abordagens de pesquisa que abordem a variabilidade específica do paciente durante o curso da doença, a resposta ao tratamento e as características histopatológicas e moleculares2.

O biobanco, caracterizado pela coleta sistemática e preservação a longo prazo de amostras tumorais derivadas de pacientes com câncer de ov....

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Protocolo

Espécimes de tecido tumoral de cirurgias de câncer de ovário foram coletados e organoides derivados da paciente foram gerados em conformidade com o Comitê de Ética da Universidade LMU (17-471), aderindo aos regulamentos existentes aplicáveis da UE, nacionais e locais. Cada paciente envolvido no estudo consentiu por escrito. Ao trabalhar com amostras de tecido fresco, a permissão de segurança de Nível 2 de Biossegurança e os gabinetes de fluxo laminar são necessários. Dada a natureza potencialmente infecciosa das amostras de tecido, que não pode ser descartada devido à falta de testes de rotina de doenças infecciosas relevantes, é necessário garantir que as regulamenta....

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Resultados

Após dissociação, filtração e contagem inicial do tecido, as células são semeadas em paralelo diretamente no formato 3D, como explicado acima, bem como a suspensão no frasco para breve expansão 2D. Em alguns casos, a expansão 2D transitória influencia positivamente a formação do organoide, e a linha de longo prazo é estabelecida com sucesso por essa via, enquanto a semeadura 3D paralela comparativa pode resultar em parada de crescimento (Figura 1). Para cada tecido doador processado, as célu.......

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Discussão

O protocolo projetado aborda os desafios anteriores do biobanco de organoides do câncer de ovário no que diz respeito à formação de organoides e ao potencial de passagem a longo prazo e garante a geração de linhas totalmente expansíveis a partir da maioria dos depósitos tumorais sólidos. O processo de coleta cirúrgica de amostras tumorais a serem utilizadas para geração de organoides impacta significativamente o rendimento e o potencial de expansão. Amostras de tecido tumoral podem ser obtidas durante vários procedimento.......

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Divulgações

M.K. está listado como um inventor em uma patente relacionada a um meio para organoides de câncer de ovário. F.T. recebeu financiamento de pesquisa, conselho consultivo, honorários e despesas de viagem da AstraZeneca, Clovis, Eisai, ImmunoGen, Medac, MSD, PharmaMar, Roche, SAGA e Tesaro/GSK. S.M. recebeu financiamento de pesquisa, conselho consultivo, honorários ou despesas de viagem: AbbVie, AstraZeneca, Clovis, Eisai, GlaxoSmithKline, Hubro, Medac, MSD, Novartis, Nykode, Olympus, PharmaMar, Pfizer, Roche, Sensor Kinesis, Teva, Tesaro.

Agradecimentos

O estudo é financiado pelo Centro Alemão de Pesquisa do Câncer DKTK, parceiro de Munique, uma parceria entre a DKFZ e o Hospital Universitário LMU de Munique. O estudo também é apoiado pela bolsa alemã Cancer Aid (#70113426 e #70113433). A incorporação de parafina de tecidos e organoides foi realizada nas instalações do núcleo do Instituto de Anatomia, Faculdade de Medicina, LMU Munique, Munique. A Imagem Confocal foi realizada na instalação Core Bioimaging no Centro Biomédico (BMC). Os autores agradecem a Simone Hofmann, Maria Fischer, Cornelia Herbst, Sabine Fink e Martina Rahmeh pela ajuda técnica.

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
100 Sterican 26 GBraun, Melsungen, Alemanha4657683
100 Sterican 27 GBraun, Melsungen, Alemanha4657705
293T HA Rspo1-FcR& D systems, Minneapolis, EUA3710-001-01Alternativa: Linha celular que expressa R-Spondin1, Sigma-Aldrich, SC111
A-83-01 (TGF-b RI Inibidor de quinase IV)Merck, Darmstadt, Alemanha616454
Meio avançado DMEM/F-12 Gibco, Thermo Scientific, Waltham, EUA12634028
Anticorpo anti-p53 (DO1)Santa Cruz Biotechnology, Texas, EUAsc-126
Anticorpo anti-PAX8Proteintech, Manchester, Reino Unido 10336-1-AP
B-27 Suplemento (50x)Gibco, Thermo Scientific, Waltham, EUA17504-044
Filtro de aspirador de pó com tampa de garrafa 0.2 µ mCorning, Berlim, Alemanha 
Frasco de cultura de células CELLSTAR, 175 cm2Greiner Bio-one, Kremsmü nster, Áustria661175
Balão de cultura de células CELLSTAR, 25 cm2Greiner Bio-one, Kremsmü nster, Áustria690160
Balão de cultura de células CELLSTAR, 75 cm2Greiner Bio-one, Kremsmü nster, Áustria658175
Collagenase IThermo Scientific, Waltham, EUA17018029
Costar 48-well Clear TC-treated Corning, Berlim, Alemanha 3548
Cryo SFMPromoCell • Ciência Centrada no Ser Humano, Heidelberg, AlemanhaC-29912
Extrato de Membrana Basal com Fator de Crescimento Reduzido Cultrex, Tipo 2, PathclearR& D systems, Minneapolis, EUA3533-005-02Alternativa: Matrigel, Matriz de membrana basal reduzida por fator de crescimento  Corning, 356231 
Cy5 AffiniPure Donkey Anti-Mouse IgGJackson Immuno715-175-151
DAKO  Tampão de citrato, pH 6.0, 10x Antigen RetrieverSigma-Aldrich, Merck, Darmstadt, AlemanhaC9999-1000ML
DAPIThermo Scientific, Waltham, EUA62248
Burro anti coelho Alexa Fluor Plus 555Thermo Scientific, Waltham, EUAA32794
Burro anti-cabra IgG Alexa Fluor Plus 488Thermo Scientific, Waltham, EUAA32814
Dulbecco&agudo; s Solução salina tamponada com fosfato Gibco, Thermo Scientific, Waltham, EUA14190-094
Epredia Richard-Allan Scientific HistoGelThermo Scientific, Waltham, EUAEpredia HG-4000-012
Falcon Poliestireno de 24 poços Corning, Berlim, Alemanha 
Bisturi de penas Pfm medical, Colônia, Alemanha200130010
Soro Fetal BovinoGibco, Thermo Scientific, Waltham, EUA10270106
Formalina 37% livre de ácido, estabilizadoMorphisto, Offenbach am Main, Alemanha1019205000
GlutaMAXGibco, Thermo Scientific, Waltham, EUA35050038
HEPES (1 M)Gibco, Thermo Scientific, Waltham, EUA
Anticorpo humano EpCAM / TROP-1R & D systems, Minneapolis, USAAF960
Human FGF10Peprotech, NJ, USA100-26
BMP2 recombinante humanoGibco, Thermo Scientific, Waltham, USAPHC7146
Recombinante humano EGFGibco, Thermo Scientific, Waltham, USAPHG0311L
Heregulin beta-1 recombinante humanoPeprotech, NJ, USA100-03
Software LAS X coreLeica Microsystemshttps://webshare.leica-microsystems.com/latest/core/widefield/
Leica TCS SP8 X  Microscópio Confocal a Laser de Luz BrancaLeica Microsystems
N-2 Suplemento (100x)Gibco, Thermo Scientific, Waltham, EUA17502-048
NicotinamidaSigma-Aldrich, Merck, Darmstadt, AlemanhaN0636
Omnifix 1 mLBraun, Melsungen, Alemanha3570519
Parafilme de
Omnilab, Munique, Alemanha5170002
Paraformaldeído Morphisto, Offenbach am Main, Alemanha1176201000
Pen StrepGibco, Thermo Scientific, Waltham, EUA15140-122
Penicilina-Estreptomicina (10.000 U/mL)Sigma-Aldrich, Merck, Darmstadt, AlemanhaP4333-100
PluriStrainer 400 µ mPluriSelect, Leipzig, Alemanha43-50400-01
PrimocinInvivoGen, Toulouse, Françaant-pm-05
Tampão de lise de glóbulos vermelhosSigma-Aldrich, Merck, Darmstadt, Alemanha11814389001
RoticlearCarl Roth, Karlsruhe, AlemanhaA538.5
Surgipath ParaplastLeica, Wetzlar, Alemanha39602012
Thermo Scientific Nunc CryovialsThermo Scientific, Waltham, EUA375418PK
Triton X-100Sigma-Aldrich, Merck, Darmstadt, AlemanhaT8787
Trypan Blue StainSigma-Aldrich, Merck, Darmstadt, AlemanhaT8154
Enzima TrypLE Express Gibco, Thermo Scientific, Waltham, EUA12604-013
Tween-20PanReac AppliChem, Darmstadt, AlemanhaA4974-0100
Y-27632TOCRIS biotechne, Wiesbaden, Alemanha1254
ZeocinInvitrogen, Thermo Scientific, Waltham, EUAR25001
430049351447156630080Parafina

Referências

  1. Siegel, R. L., Miller, K. D., Fuchs, H. E., Jemal, A. Cancer statistics. CA Cancer J Clin. 72 (1), 7-33 (2022).
  2. Berger, A. C., et al. A comprehensive pan-cancer molecular study of gynecologic and breast cancers. Cancer Cell. 33 (4), 690-705 (2018).
  3. Watson, R. W. G., Kay, E....

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Reimpressões e permissões

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