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Analyse von Genexpressionsdaten aus marinen mikrobiellen Gemeinschaften mit Environmental Transcriptomics
JoVE Journal
Biologia
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JoVE Journal Biologia
Analyzing Gene Expression from Marine Microbial Communities using Environmental Transcriptomics
DOI:

13:51 min

February 18, 2009

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Capítulos

  • 00:00Título
  • 01:06Introduction
  • 01:51Preparation and Environmental RNA Collection
  • 03:32Total RNA Extraction
  • 06:03First rRNA Removal
  • 07:29Second rRNA Removal
  • 10:38mRNA Amplification
  • 12:01cDNA Synthesis
  • 12:51Representative Results/ Outcome
  • 13:16Conclusion

Summary

Tadução automática

Wir stellen eine Methode zur Erzeugung von cDNA aus Umwelt-mRNA. In der Regel Gesamt-RNA zunächst aus der Umgebung gesammelt, rRNA selektiv entfernt, mRNA wird selektiv verstärkt und cDNA aus der angereicherten mRNA-Pool synthetisiert wird sequenziert. Recovered Sequenzen annotiert werden unter Verwendung von Standard Bioinformatik Techniken, um die exprimierten Gene zu identifizieren.

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