FM-färgämnen har varit till ovärderlig hjälp i förståelsen av synaptiska dynamik. FMS är normalt följs under fluorescerande mikroskopet under olika stimulering förhållanden. Dock medger photoconversion av FM färgämnen i kombination med elektronmikroskopi visualisering av olika synaptiska vesikler pooler, bland annat ultrastruktur komponenter, synaptiska boutons.