Concentration of Metabolites from Low-density Planktonic Communities for Environmental Metabolomics using Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy

R. Craig Everroad; Seiji Yoshida; Yuuri Tsuboi; Yasuhiro Date; Jun Kikuchi; Shigeharu Moriya

doi:10.3791/3163

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Concentrazione dei metaboliti a bassa densità Comunità planctoniche per Metabolomica ambientali utilizzando la spettroscopia a risonanza magnetica nucleare

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Concentration of Metabolites from Low-density Planktonic Communities for Environmental Metabolomics using Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy

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Concentrazione dei metaboliti a bassa densità Comunità planctoniche per Metabolomica ambientali utilizzando la spettroscopia a risonanza magnetica nucleare

DOI:

10.3791/3163-v

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11:47 min

•

April 07, 2012

•

R. Craig Everroad*¹, Seiji Yoshida*², Yuuri Tsuboi, Yasuhiro Date, Jun Kikuchi^3,4, Shigeharu Moriya²

¹Biosphere Oriented Biology Research Unit,RIKEN Advanced Science Institute, ²Graduate School of Nanobioscience, Yokohama City University, ³Advanced NMR Metabomics Research Team,RIKEN Plant Science Center, ⁴Graduate School of Bioagricultural Science,Nagoya University

Capítulos

00:02Título
01:28Preparation of filters to remove extractables and filtration of sample for metabolite concentration
04:44Extraction of aqueous-soluble metabolites
07:48NMR spectroscopy and data analysis
11:15Conclusions

Summary

Tadução automática

Un metodo per l'estrazione metabolita da parte delle comunità microbiche planctonici è presentato. Campionamento intera comunità si realizza mediante filtrazione su filtri appositamente preparati. Dopo liofilizzazione, acquoso-solubili metaboliti vengono estratti. Questo approccio consente per l'applicazione della metabolomica ambientali trans-omiche indagini di comunità microbiche naturali o sperimentali.

Concentrazione dei metaboliti a bassa densità Comunità planctoniche per Metabolomica ambientali utilizzando la spettroscopia a risonanza magnetica nucleare

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